1--2 Bioinformatiker med inriktning mot Data Stewardship

1--2 Bioinformatiker med inriktning mot Data Stewardship

Arbetsbeskrivning

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra långsiktig skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har drygt 54 000 studenter, mer än 7 500 anställda och en omsättning på cirka 8 miljarder kronor.




Institutionen för cell- och molekylärbiologi är indelad i sju forskningsprogram som alla fokuserar på olika områden inom cell- och molekylärbiologi: beräkningsbiologi och bioinformatik, mikrobiologi och immunologi, molekylärbiologi, molekylär biofysik, molekylär evolution, molekylär systembiologi och strukturbiologi.

Den vetenskapliga grunden till vad vi gör ligger i biologi, men vår forskning överlappar med andra områden såsom medicin, datavetenskap, matematik, kemi, ingenjörsvetenskaper och fysik. Institutionen har över 200 anställda med runt 60 doktorander. Läs gärna mer om verksamhetens arbete på https://icm.uu.se. Den person vi nu söker kommer att vara placerad vid Institutionen för cell- och molekylärbiologi och knuten till National Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS) och Science for Life Laboratory (SciLifeLab).

SciLifeLab är ett nationellt centrum för molekylära biovetenskaper med fokus på forskning inom hälsa och miljö. Centret kombinerar ledande teknisk expertis med avancerat kunnande inom translationell medicin och molekylära biovetenskaper. SciLifeLabs mål är också att bygga en stark forskargruppering kring centret genom utbildning och samverkan. SciLifeLab är en nationell resurs som drivs av Karolinska Institutet, KTH, Stockholms universitet och Uppsala universitet. SciLifeLab startade sin verksamhet 2010 och har idag 570 anställda vid faciliteterna, samt 250 forskargrupper (http://www.scilifelab.se). 

NBIS är en distribuerad nationell forskningsinfrastruktur finansierad av Vetenskapsrådet, Knut & Alice Wallenbergs stiftelse, SciLifeLab och svenska universitet. Syftet med NBIS är att tillhandahålla bioinformatiksupport och infrastruktur till forskare inom livsvetenskaperna. NBIS har ca 120 medarbetare spridda över landet med expertis inom många olika bioinformatiska kompetensområden och systemutveckling. I egenskap av den svenska noden i den europeiska infrastrukturen ELIXIR är NBIS involverat i många internationella aktiviteter med syfte att förbättra den europaövergripande bioinformatikinfrastrukturen. Inom NBIS finns också en grupp experter som fokuserar på att stödja svenska Life Science-forskare med datahantering enligt principerna för Öppen vetenskap och FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable), i nära samarbete med SciLifeLabs Data Centre. Under de senaste två åren har vi vuxit från två till sju personer, och söker nu fler Data Stewards för att ytterligare förstärka datahanteringskompetensen, med särskilt fokus på hantering av kliniskt relaterade känslig forskningsdata, i synnerhet för att möta de kommande ökande behoven genom det stora europeiska 1+MG initiativet som skall tillgängliggöra över en miljon helgenom-sekvenser. Mer information om NBIS finns på https://nbis.se.

https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/

Arbetsuppgifter
Vi söker dig som vill vara med att möjliggöra life science-forskning i Sverige som är bortom vad som är möjligt att uppnå för enskilda forskare, ett enskilt universitet eller ett enskilt forskningsområde. Du kommer att jobba nära och stödja forskare och forskningsprojekt att hantera och tillgängliggöra sina forskningsdata på bästa sätt genom att etablera datahanteringsplaner, och att hjälpa forskargrupper att strukturera och publicera forskningsdata. Ett stort fokus kommer att ligga på etablera och genomföra rutiner för användarstöd för deponering av humangenetisk data. En viktig del i arbetet är också att utbilda forskare i principer och tillvägagångssätt för hantering och delning av olika typer av forskningsdata. Du förväntas också bidra med kompetenshöjande nätverkande inom forskningsdatahantering i Sverige, och med utvecklingsaktiviteter internationellt inom ELIXIR-nätverket.

Kvalifikationskrav
Sökande skall minst ha masterexamen inom Life Science, Informationsteknik, eller Bioinformatik, alternativt motsvarande kompetens inom ett eller flera av dessa områden förvärvad på annat sätt. Kännedom om principer och förutsättningar för Öppen vetenskap och FAIR. Dessutom dokumenterad erfarenhet av undervisning på universitetsnivå. 

Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet. Den sökande ska ha mycket god samarbetsförmåga, initiativförmåga och goda kommunikativa kvaliteter. Som person bör du vara flexibel och serviceinriktad. Du bör även vara kvalitetsmedveten samt mål- och resultatinriktad. Du ska kunna uttrycka dig obehindrat på engelska i både skrift och tal.

Meriterande är

- Erfarenhet av att arbeta med klinisk eller annan känslig data
- Förtrogenhet med svensk lagstiftning angående personuppgifter och forskningsetik
- Erfarenhet av internationella repositorier för deponering och publicering av Life Science-data, och därtill relevanta datatyper, metadata och standarder
- Erfarenhet av att arbeta med användarstöd
- Erfarenhet av att arbeta i internationella samarbeten och nätverk
- Erfarenhet av Carpentries-metodik

Om anställningen 
Anställningen är tillsvidare, provanställning kan tillämpas. Omfattningen är 100 %. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Niclas Jareborg, 0733-866605, mailto:niclas.jareborg@nbis.se, Elin Kronander, mailto:elin.kronander@nbis.se, 0729-999558,‬ och Bengt Persson, 0704-250230, mailto:bengt.persson@nbis.se.

Välkommen med din ansökan senast den 19 augusti 2022, UFV-PA 2022/2692.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.


Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Kontaktpersoner på detta företaget

Anders Grundström, Saco-rådet
018-471 5380
Carin Söderhäll, TCO/ST
018-471 1997
Stefan Djurström, Seko
018-471 3315

Sammanfattning

Besöksadress

751 05 Box 256
None

Postadress

Box 256
Uppsala, 75105

Liknande jobb


Forskningsassistent: Klinisk noggrannhet hos AI inom bröstradiologi

Forskningsassistent: Klinisk noggrannhet hos AI inom bröstradiologi

20 december 2024

Staff scientist inom metagenomik

5 december 2024