1-2 forskare inom dataanalys för ultrasnabb avbildning av proteiner

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 46.000 studenter, 7.300 anställda och en omsättning på 7,3 miljarder kronor.




Positionen finns vid institutionen för cell och molekylärbiologi som är en tvärvetenskaplig och framgångsrik forskningsinstitution som bedriver forskning inom Strukturbiologi, Molekylärbiologi, Mikrobiologi, Beräkningsbiologi, Molekylär systembiologi, Biofysik och molekylär evolution.

Läs mer på http://www.icm.uu.se.

Projektbeskrivning: En ny metod för strukturbestämning av proteiner håller på att utvecklas i Uppsala. Kärnan i metoden är de mycket kraftiga och mycket korta röntgenpulser som kan skapas av en fri-elektronlaser. Den korta pulslängden gör att diffaktionsdata från ett prov kan detekteras innan strålskadorna för samma puls har haft tid att degradera, eller fullständigt förstöra provet. Vår målsättning i Ekebergslabbet är att utveckla och förbättra den mjukvara och de analysalgoritmer som behövs för denna nya typ av avbildning. Speciellt viktigt är att förstå hur dessa metoder kan låta oss undersöka proteiners rörelser på en väldigt kort tidsskala.

Arbetsuppgifter: Forskaren kommer att arbeta med att utveckla algoritmer för dataanalys och testa dessa med både simulerade och experimentella data. Arbetet kan därför inkludera både simulering av diffraktionsdata samt deltagande i experiment vid fri-elektronlaseranläggningar på olika platser i världen. Forskaren kommer att arbeta med egna projekt men i nära samarbete med de andra gruppmedlemmarna. Övrig tjänstgöring vid institutionen kan förkomma så som undervisning och administrativt arbete, dock högst upp till 20% av tjänsten

Kvalifikationskrav: Vi söker en forskningsmotiverad kandidat med doktorsexamen i fysik, datorvetenskap, elektronmikroskopi, dataanalys eller liknande. Du måste ha tidigare erfarenhet av dataanalys och programmering är också ett krav. Forskaren kommer att ingå i ett team och bör vara en konstruktiv och pålitlig samarbetspartner. Slutligen så krävs även en utmärkt förmåga till både skriven och talad engelska.

Önskvärt/meriterande i övrigt: Erfarenhet från någon eller några av följande områden:

- pythonprogrammering,
- dataanalys inom elektronmikroskopi,
- optimering
- diffraktionsexperiment

Ansökan: Din ansökan ska innehålla:

1) Ett kort brev som beskriver dig själv, din forskning och på vilket sätt du är lämpad för den här tjänsten

2) CV (max 2 sidor)

3) Kopior på din doktorsexamen och betyg

4) Namn och kontaktuppgifter (adress, e-post, telefonnummer) till åtminstone två referenser

5) Lista över relevanta publikationer

Lön: Individuell lönesättning.

Tillträde: Snarast eller enligt överenskommelse.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning under 24 månader.

Anställningens omfattning: Heltid, 100 %.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Dr. Tomas Ekeberg mailto:tomas.ekeberg@icm.uu.seeller Prof. Filipe Maia mailto:filipe.maia@icm.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 5 november 2020, UFV-PA 2020/3585.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.


Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.