1–2 tillämpningsexperter inom NBIS

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra långsiktig skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har drygt 54 000 studenter, mer än 7 500 anställda och en omsättning på cirka 8 miljarder kronor.




Institutionen för cell- och molekylärbiologi är indelad i sju forskningsprogram som alla fokuserar på olika områden inom cell- och molekylärbiologi: beräkningsbiologi och bioinformatik, mikrobiologi och immunologi, molekylärbiologi, molekylär biofysik, molekylär evolution, molekylär systembiologi och strukturbiologi.

Den vetenskapliga grunden till vad vi gör ligger i biologi, men vår forskning överlappar med andra områden såsom medicin, datavetenskap, matematik, kemi, ingenjörsvetenskaper och fysik. Institutionen har över 200 anställda med runt 60 doktorander. Läs gärna mer om verksamhetens arbete på https://icm.uu.se.

UPPMAX (Uppsala Multidisciplinary Center for Advanced Computational Science, http://www.uppmax.uu.se) är ett nationellt center med uppgift att tillhandahålla resurser för högprestandaberäkningar för forskare i Sverige. UPPMAX grundades 2003 och har idag ett antal högprestanda datorsystem i drift med användare från många discipliner, men främst datadrivna vetenskapsområden där lagring av stora datamängder behövs, såsom t.ex. bioinformatik och andra livsvetenskaper. UPPMAX har ett 20-tal anställda system- och tillämpningsexperter.

SciLifeLab är ett nationellt centrum för molekylär biovetenskap. UPPMAX är värd för Compute and Storage, en enhet som ingår i Bioinformatikplattformen NBIS (https://nbis.se) vid SciLifeLab. NBIS erbjuder projektstöd inom bioinformatik och relaterade ämnen samt tillhandahåller infrastruktur och avancerad utbildning. Genom vår enhet Compute and Storage bidrar NBIS till användarmiljön på relevanta nationellt tillgängliga system samt tekniskt stöd för denna miljö.

https://www.uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/

Arbetsuppgifter
Tjänsten är placerad vid NBIS Compute and Storage. Detta är en grupp på 4–5 bioinformatiker och andra experter vars uppgift är att stödja forskare inom livsvetenskaperna i användandet av storskaliga beräknings- och lagringsresurser. Främst används system vid UPPMAX, men även alternativa datorsystem kan ingå såsom t.ex. cloud, GPU, eller large-memory system. Faciliteten har över 1000 årliga användare från hela landet i vitt spridda forskningsområden. Miljön som har byggts upp är världsunik och möjliggör forskning i världsklass.

Allmänna arbetsuppgifter inkluderar avancerat användarstöd, installation av programvara och databasresurser, underhåll och utveckling av den digitala forskningsmiljön, undervisning av användargrupper inom relevanta ämnen, skriptning av verktyg för externt eller internt bruk, utredningsarbeten, samt granskning av projektansökningar och effektivitetsanalys av pågående projekt. Den nu utlysta tjänsten är tänkt att stärka gruppens kompetens inom bioinformatik, framför allt inom humandata, samt inom analys av optisk eller elektronisk mikroskopi.

Kvalifikationskrav
Den person vi söker skall ha en utbildning på åtminstone Master-nivå inom bioinformatik, molekylär bioteknik, bildanalys, eller liknande ämne inom livsvetenskaperna, dokumenterad erfarenhet av programmering, god social kompetens, god samarbetsförmåga samt förmåga till att ta egna initiativ. Dessutom bör personen behärska fackspråksmässigt flytande engelska i både tal och skrift. Goda kunskaper i svenska är meriterande. Vi lägger stor vikt vid personlig lämplighet.

Kandidaten skall ha dokumenterad erfarenhet av nedanstående områden:

- Linux (som användare)
- Skriptspråk såsom Bash, Python och/eller Perl

Kandidaten skall även ha professionell erfarenhet inom något av följande områden:

- Användarstöd
- Programmeringsspråk såsom C/C++, Fortran
- Forskning inom livsvetenskaperna

Önskvärt/meriterande i övrigt

- Workflowsystem såsom NextFlow, Snakemake eller Galaxy
- Bildanalysverktyg såsom exempelvis CellProfiler eller ImageJ
- Pedagogik och egen undervisning
- Dokumenteringsarbete
- Informationssäkerhet
- Webbteknologi

Om anställningen
Anställningen är tillsvidare, provanställning kan tillämpas. Omfattningen är 100%. Tillträde snarast eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Marcus Lundberg, enhetschef Compute&Storage, E-post marcus.lundberg@nbis.se

Välkommen med din ansökan senast den 27 januari 2023, UFV-PA 2022/4954

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.


Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.