1–3 Bioinformatiker i sekvensbaserade analyser

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra långsiktig skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har drygt 54 000 studenter, mer än 7 500 anställda och en omsättning på cirka 8 miljarder kronor.




National Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS; http://nbis.

se) främjar svensk livsvetenskaplig forskning genom att tillhandahålla bioinformatisk expertis och programmeringskompetens till forskare. Organisationen är nationell, med över 100 bioinformatiker, systemutvecklare och data stewards anställda på ett flertal svenska universitet.  NBIS utgör också bioinformatikplattformen på SciLifeLab (http://www.scilifelab.se), en nationell resurs som tillhandahåller avancerade storskaliga tekniker och kunnande inom biovetenskaperna. Genom nära samarbete med de dataproducerande faciliteterna och med ledande forskargrupper har NBIS enastående möjligheter att erbjuda bioinformatiska analyser av högsta klass.

NBIS söker nu efter flera nya medarbetare som ska stödja svenska forskare inom sekvensbaserad bioinformatik (DNA/RNA). De kommer framförallt att jobba med ”short term support”, en verksamhet där vi ser väldigt varierande projekt komma in från olika fält inom biologi och medicin. Exempel på analyser vi ofta jobbar med inkluderar (men är inte begränsade till) genuttryck, variantanalyser, epigenomik, statistik och genomannotering. Vi är just nu intresserade av att stärka vår kompetens inom ”integrative omics”, cancerspecifika typer av analyser och ”genome assembly/annotation”, men även andra typer av kompetenser kan vara av intresse för positionen. NBIS forskarstöd behöver kontinuerligt anpassas till aktuella behov inom det svenska forskarsamhället, och en vilja och förmåga att lära sig är en viktig förmåga att ha för innehavaren av den här tjänsten.

Tjänsterna är placerade vid Uppsala Universitet i Navet, SciLifeLabs Uppsala-nod. I denna kreativa miljö har NBIS över 50 bioinformatiker, systemutvecklare och data stewards, med flera andra SciLifeLab-faciliteter och många olika forskargrupper i närheten. När du jobbar för NBIS är du en del av ett team, du kommer inte vara ensam. Med många kunniga kollegor att bolla med, ett brett utbud av interna kurser och möjlighet att lära sig från alla spännande supportprojekt, ger en anställning hos NBIS mycket goda möjligheter att utvecklas som bioinformatiker.

https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/

Arbetsuppgifter
Arbetet kommer att fokusera på bioinformatisk support till svenska forskare. Exakt vilka typer av analyser som behöver genomföras kommer anpassas efter expertens kompetenser och vilka typer av projekt NBIS får in. Ansvarsområden inkluderar analyser av data, användarkommunikation, eget lärande om nya metoder, rapportskrivande och undervisning.

Kvalifikationskrav

- En doktorstitel och gedigen och dokumenterad erfarenhet (minst 5 år, kan inkludera doktorandtid) av sekvens-baserad bioinformatik (DNA eller RNA).
- God förmåga att arbeta i terminalbaserad Linux-miljö. Vidare krävs god förmåga att arbeta i en serviceinriktad miljö, både i samarbete och självständigt.
- God förmåga att programmera i R eller skript-språk, t.ex. Python.
- Utmärkt talad och skriven engelska krävs. Utmärkt kommunikationsförmåga är nödvändigt, eftersom innehavaren av denna tjänst kommer att samarbeta med forskare med mycket olika bakgrund.
- Stor vikt kommer läggas vid personlig lämplighet.

Önskvärt/meriterande i övrigt


- Post doc -erfarenhet eller annan erfarenhet av bioinformatik efter disputation är av stort intresse.
- Kompetens inom ”integrative omics”, cancerspecifika analyser och/eller ”genome assembly/annotation”.
- Tidigare erfarenhet av att jobba inom forskarstöd är av stort intresse.

Om anställningen 
Anställningen är tillsvidare, provanställning kan tillämpas. Omfattningen är 100 %. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Avdelningschef Dr. Henrik Lantz, mailto:henrik.lantz@imbim.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 7 april 2022, UFV-PA 2022/848

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.


Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.