1 doktorand i Biomedicinsk vetenskap, inriktning virologi

Neurotropa virus hos grisar och deras roll i kongenital sjukdom
Sektionen för virologi på institutionen för biomedicin och veterinär folkhälsovetenskap, Sveriges lantbruksuniversitet i Uppsala söker en doktorand till projektet ? Neurotropa virus hos grisar och deras roll i kongenital sjukdom?. Sektionen för virologi är en aktiv forskningsmiljö med nära samarbete med såväl nationella som internationella forskargrupper. Forskningen inom sektionen fokuserar på olika aspekter av infektionsbiologi såsom virus-värd interaktion, epidemiologi, genetisk karakterisering och virusdetektion (ex. via storskalig sekvensering och metagenomik). Sektionen består för närvarande av en professor, fyra seniora forskare, en postdoktor och fyra doktorander.

Detta doktorandprojekt har det övergripande syftet att identifiera, karakterisera och utvärdera orsaken till medfödd skaksjuka och fläksjuka. Medfödd skaksjuka är en sjukdom som drabbar nyfödda spädgrisar. Symptomen är skakningar och svårigheter med koordinationen, vilket kan leda till svårigheter att dia och därmed ökad dödlighet. Denna sjukdom anses vara smittsam och det har sedan länge spekulerats i att den orsakas av virus. Fläksjuka är en medfödd förlamning som karakteriseras av begränsad funktion i bakbenen, vilket leder till svårigheter att stå och gå och därmed ökad dödlighet. Det finns en teori om att både skaksjuka och fläksjuka skulle kunna orsakas av samma virus och detta doktorandprojekt kommer att titta närmare på detta.

Vi kommer att använda oss av en metod som kallas viral metagenomik för att ta reda på vilka virus som finns i hjärnan hos griskultingar med medfödd skaksjuka, de med fläksjuka, samt hos friska spädgrisar från samma besättning. Viral metagenomik använder storskalig sekvensering och bioinformatik för att förutsättningslöst identifiera vilka virus som finns i ett specifikt prov ? t.ex. i träck, blod eller vävnad. De virus som identifieras kommer att isoleras och karakteriseras för att sedan användas i experimentella infektioner av friska, dräktiga suggor för att utvärdera om dessa virus kan orsaka kongenital skaksjuka och/eller fläksjuka hos spädgrisar.

Vi har nya forskningsresultat som visar att det finns virus i hjärnan på nyfödda grisar, framför allt hos sjuka grisar men även, till vår förvåning, hos till synes friska. Vi vill följa upp dessa resultat i detta projekt för att förstå mer om hur dessa virus påverkar griskultingar och om de orsakar sjukdom.


Kvalifikationer: Vid tillträdet av tjänsten skall den sökande ha en veterinärmedicinsk examen, en mastersexamen i biologi, bioteknik, infektionsbiologi (eller motsvarande) alternativt en läkarexamen. Intresse och kunskap inom veterinärmedicin, molekylärbiologi, mikrobiologi, virologi, patologi och viss bioinformatik är meriterande, liksom praktisk erfarenhet av laboratoriearbete. Goda kunskaper i engelska, både skriftligt och muntligt förväntas. Urvalet bland de behöriga sökande kommer att baseras på förmåga att tillgodogöra sig utbildningen, förmåga att samarbeta, liksom egenskaper så som kreativitet, initiativförmåga och självständighet. Särskild vikt kommer att läggas vid den sökandes skriftliga motivering (bifogas via ansökningsformuläret eller som brev), som beskriver varför du är intresserad av området/projektet och vad gör dig till en lämplig kandidat för denna tjänst.