Anställning som postdoktor (2 år) inom biodiversitetsövervakning

Arbetsbeskrivning

Vi utlyser en postdoktoranställning inom ekologi med fokus på övervakning av biologisk mångfald i nordliga ekosystem med hjälp av eDNA.

Postdoktorprojektet kommer att ingå i ett större EU-finansierat projekt med forskare från både Sverige och Finland. Anställningen är på heltid under två år, men kan förlängas upp till ytterligare ett år. Sista ansökningsdag är den 29 september 2024 och anställningen förväntas börja under 2024, eller enligt överenskommelse. Välkommen med din ansökan!

Forskningsbeskrivning
Globala och europeiska avtal betonar vikten av att övervaka biologisk mångfald. Dessutom kommer den nya naturrestaureringslagen att kraftigt öka behovet av biodiversitetsövervakning i EU-länder. Övervakning av biologisk mångfald är dock mycket tidskrävande och kostsamt på grund av den omfattande expertis som krävs för att identifiera arter i olika miljöer och det arbetsamma fältarbetet. Environmental DNA (eDNA), det vill säga upptäckt av DNA-spår som lämnas i miljön av olika organismer, har stor potential att bli ett effektivt verktyg för övervakning av biologisk mångfald.

De för närvarande använda eDNA-metoderna har visat sig vara väl lämpade för tempererade ekosystem, men misslyckas ofta med att upptäcka nyckelarter i ekosystem belägna på mer nordliga breddgrader. Många känsliga ekosystem i norra Sverige och Finland är under press från exempelvis klimatförändringar och skogsbruk. Det övergripande målet är att utveckla effektiva och standardiserade metoder för eDNA-provtagning och bearbetning anpassade till nordliga habitat och arter.

Det planerade arbetet består av två delar. I den första delen bedöms behoven och potentialen för övervakning av arter och ekosystem i norra Sverige och Finland med hjälp av eDNA. Lämpligheten hos redan tillgängliga eDNA-metoder och verktyg för biodiversitetsprovtagning utvärderas, och hur de kan användas eller optimeras för att fungera i nordliga habitat analyseras. Här kommer vi att arbeta med intressenter som använder eller behöver eDNA-verktyg för olika biodiversitetsprovtagningar, genom att undersöka deras behov via enkäter, intervjuer och workshops.

I den andra delen kommer metabarcoding-metoder att genomföras parallellt med shotgun-baserad metagenomik för att utvärdera specificitet och känslighet hos olika metoder och markörer när det gäller övervakning av arter i nordliga ekosystem. Data som produceras kommer att användas för att rekonstruera en lång tidsserie av förändringar i biologisk mångfald i ett borealt ekosystem med hjälp av arkiverade prover. Den valda kandidaten kommer att delta i projektets utformning, dataanalys, publicering av resultat och kommunikation med intressenter. För mer information om vår nyutvecklade shotgun-baserade metod, se:
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.12.06.569882v1

Möjligheter för professionell utveckling, som exempelvis projektledning, ledarskap, handledning, undervisning och bidragsansökning, finns tillgängliga och uppmuntras.

Postdoktorn kommer att arbeta med professor Roland Jansson och dr Per Stenberg (Umeå universitet) samt ett nätverk av forskare och intressenter involverade i biodiversitetsövervakning från Finland och Sverige. Tjänsten finansieras av ett Interreg Aurora-projekt.

Kvalifikationer
För att anställas med stöd av postdoktoravtalet krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas.

För att anställas med stöd av postdoktoravtalet bör främst den komma ifråga som har avlagt examen enligt föregående stycke för högst tre år sedan. Om det finns särskilda skäl kan den komma i fråga som avlagt doktorsexamen tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, tjänstgöring inom totalförsvaret, eller andra liknande omständigheter samt klinisk tjänstgöring eller för ämnesområdet relevant tjänstgöring/uppdrag. Postdoktor som ska undervisa eller handleda ska ha relevant högskolepedagogisk utbildning.

Den framgångsrika kandidaten bör ha ett intresse och dokumenterad erfarenhet av ekologiska frågor och/eller metoder. Detta kan innebära en doktorsexamen i ekologi, genetik eller ett närliggande område. Tidigare erfarenhet krävs inom minst ett av följande områden: eDNA-analys, analys av storskaliga DNA-sekvensdata (bioinformatik) eller biodiversitetsövervakning. Utmärkta skriftliga och muntliga kommunikationsfärdigheter, förmåga att planera, genomföra och slutföra forskningsprojekt, förmåga att tänka självständigt och kreativt samt förmåga att arbeta både i team och självständigt förväntas. Erfarenhet av att arbeta med boreala ekosystem och kommunikation med intressenter och/eller populärvetenskapliga aktiviteter är meriterande.

Hur man ansöker
Ansökan ska innehålla följande, skrivet på svenska eller engelska:

- Ett personligt följebrev som motiverar din ansökan och hur du kan bidra till forskningen (max en sida),
- CV inklusive publikationslista, där max 3 relevanta publikationer markeras, med länkar till publikationerna,
- En kopia av doktorsexamensbevis eller dokumentation som klargör när doktorsexamen förväntas erhållas,
- Kontaktuppgifter till två referenspersoner,
- Andra dokument som sökanden önskar åberopa.

Sista ansökningsdag är 29 september 2024.

Kontakt
Eventuella ytterligare frågor om forskningen eller ansökan ska riktas till Roland Jansson (roland.jansson@umu.se) eller Per Stenberg (per.stenberg@umu.se).

Kontaktpersoner på detta företaget

Fredrik Almqvist
090-786 69 25
Michael Holmboe
090-7865248
Rainer Backman, professor (huvudhandledare)
090-786 59 43
Torbjörn Lestander, docent
090-786 87 95
Ewa Mellerowicz, professor
090-786 83 67
Thomas Olofsson
090-786 67 10
Åke Fransson
090-786 50 33
Jonatan Klaminder, jonatan.klaminder@emg.umu.se
090-786 9554
Henrik Larsson
090-786 79 97, 070-825 59 51
Christer Nilsson, christer.nilsson@umu.se
090-7866003

Sammanfattning

Besöksadress

Umeå universitet
None

Postadress

Umeå universitet
Umeå, 90187

Liknande jobb


Postdoktor inom genomik

Postdoktor inom genomik

4 november 2024

Sjukhusgenetiker med erfarenhet av helgenom - välkommen till oss!

Sjukhusgenetiker med erfarenhet av helgenom - välkommen till oss!

18 mars 2024