Bioinformatiker

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 41 000 studenter, 6 500 anställda och en omsättning på 5,9 miljarder kronor.



Bioinformatiker, Nationellt stöd för analys och klinisk användning av storskaliga data från cancerprover vid Institutionen för medicinska vetenskaper med tillträde enligt överenskommelse

SciLifeLab: Science for Life Laboratory, har visionen att skapa ett internationellt ledande centrum som utvecklar tillämpar och tillgängliggör storskalig teknologi för biovetenskap med fokus på medicin, biologi och dess tillämpningar inom miljö och hälsa.

Centret koordinerar forskningsprogram och tekniska plattformar se (www.scilifelab.se)

BILS: Bioinformatic Infrastructure for Life Sciences som är en nationellt distribuerad forskningsinfrastruktur med stöd från Vetenskapsrådet (www.bils.se). BILS tillhandahåller bioinformatisk infrastuktur och support på nationell nivå. Vidare koordinerar BILS den svenska noden i den europeiska infrastukturen för biologisk information ELIXIR.

Arbetsuppgifter: Vi söker dig som vill bidra till att utveckla morgondagens metoder för diagnostik och andra analyser av tumörprover. I arbetsuppgifterna ingår att stödja cancerforskare och kliniker i analysen av olika typer av data för att förbättra diagnostiken och kunskapen om cancer och behandlingseffekter . I arbetet ingår även att utveckla lösningar och infrastruktur för allmänna problem som är relevanta för flera projekt och därför kan få en bred tillämpning. En viktig arbetsuppgift är att sprida kunskap om avancerade metoder för dataanalys av cancerprover genom att anordna och bjuda in till kurser med nationell rekrytering och genom att föra ut information genom olika typer av kommunikation.

I det direkta bioinformatiska stödet ingår DNA analyser av cancerprover tex array-baserade analyser för att mäta allele-specifika kopietal, genotypning och DNA metylering. Dessutom ingår stöd för DNA sekvensering som helgenomsskevensering och exomsekvensering. I tjänsten ingår även stöd för RNA analyser av array-baserade analyser av mRNA, miRNA, ncRNA, alternativ splicing och olika analyser av RNAseq data. 

Arbetet kommer att utföras i nära samverkan med BILS-experter, WABI, SciLifeLab-platttformar och bioinformatik- och cancerforskare.

Kvalifikationskrav: Universitetsutbildning med inriktning mot Life science och dataanalys t.ex. från programmen för molekylärbioteknik, datavetenskap eller biomedicin. Tidigare erfarenhet av programmering (R, perl, python eller andra skriptspråk) och arbete i Linuxmiljö. God muntlig och skriftlig färdighet i engelska och svenska. Sökanden skall vara serviceinriktad, ha god samarbetsförmåga och förmåga till självständigt arbete

Önskvärt/meriterande i övrig: Erfarenhet av bioinformatikstöd för analys av array- och skevenseringsdata. Tidigare erfarenhet av arbete med analys av cancerprover. Erfarenhet av sprida information, hålla kurser och workshops. Forskningserfarenhet av bioinformatisk metodutveckling

Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Ansökan skall innehålla CV, kopior av examensbevis och betyg, eventuella publikationer och en kort beskrivning av dina forskningsintressen. Vi ser gärna att du lämnar uppgifter om referenspersoner och/eller bifogar rekommendationsbrev. Ansökningarna bedöms enligt följande kriterier: Lämplig grundutbildning, tidigare erfarenhet av arbete och/eller forskning inom området eller närliggande områden samt personlig lämplighet.

Lön: Individuell lönesättning tillämpas. Ange löneanspråk i ansökan.

Upplysningar om anställningen lämnas av professor Anders Isaksson, tel: 018-471 44 85, e-post: anders.isaksson@medsci.uu.se eller personalsamordnare Anna Foyer, e-post: anna.foyer@medsci.uu.se.

Välkommen med din skriftliga ansökan senast den 19 juni 2014. UFV-PA 2014/905. Klicka på länken nedan för att komma till ansökningsformuläret.

Bioinformatiker


Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Vi tar enbart emot ansökan på det sätt som beskrivs i annonsen.