Bioinformatiker

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 41 000 studenter, 6 500 anställda och en omsättning på 5,9 miljarder kronor.



En position inom bioinformatik är tillgänglig i Jochen Wolfs forskningsgrupp vid Evolutionsbiologiskt centrum i Uppsala, Sverige.

Anställningen är inledningsvis tidsbegränsad till 2 år med möjlighet till förlängning. UFV-PA 2014/1596.

Bakgrund: Vi är en ung, växande forskningsgrupp som tillämpar en integrerad strategi för att studera evolutionära processer i naturliga populationer. Forskningstemana inkluderar artbildning och genomevolution. En av de centrala frågorna är att förstå de evolutionära processer och genetiska mekanismer som ligger bakom artbildning (t.ex. Wolf et al. 2010, 2012, Shafer et al. 2013 Ellegren et al. 2012). Med hjälp av storskaliga genetiska metoder, samt fältbaserade experiment, karakteriserar vi genomisk divergens mellan populationer och arter och bedömer dess förhållande till funktionell fenotypisk divergens. Dessutom arbetar vi efter makro evolutionära komparativa metoder för att studera evolution över större tidsskalor (t.ex. Nabholz et al. 2013) och ibland är intresserar vi oss av metodiska frågor (t.ex. Wolf 2013, Mugal 2014, Vijay et al. 2013). De för närvarande empiriska studierna inkluderar fåglar (svalor och kråkfåglar), marina däggdjur (sälar och späckhuggare) och europeiska hemiclonal grodor. http://www.ebc.uu.se/Research/IEG/evbiol/research/Wolf/.

Arbetsuppgifter: Stödja forskningsgrupp som tillämpar en integrerad strategi för att studera evolutionära processer i naturliga populationer. Forskningstemana inkluderar artbildning och genomevolution. Bioinformatikern kommer att ansvara för handhavandet av stora transcriptome och genom-resekvenserings dataset och engagera sig aktivt i pågående forskningsprojekt. Vanliga arbetsuppgifter innebär rådatainspektion, genome assembly och annotering av ryggradsdjurens genom (fåglar: ca 1,2 Gb, marina däggdjur: ca 3Gb), multiple sequence alignments, mappping, genotypning, etc.

Kvalifikationskrav: Doktors- eller högskoleexamen inom relevant område samt kunskaper i relevant programmeringsspråk (UNIX , Perl , Python , etc.). En bakgrund inom populationsgenomik eller komparativ genomik är meriterande. Att den sökande är bekant med genetiska databaser och har erfarenhet inom bioinformatiska analyser av high throughput sequencing data från Illumina, SOLID, IonTorrent och single molecule sequencing.

Miljön: Evolutionsbiologiskt centrum (EBC) (http://www.ebc.uu.se/) är en av världens ledande forskningsinstitutioner inom evolutionsbiologi. EBC är den del av Uppsala universitet som har rankats högst bland alla europeiska universitet inom ämnet biologi (CHE europeiska rangordning) och inkluderar en bred variation av discipliner. Den vetenskapliga miljön med många seminarier, journal clubs och sociala aktiviteter erbjuder utmärkta möjligheter för kontakter och samarbeten. En forskarskola för närvarande lett av Jochen Wolf ger en ram för kurser och seminarier som i stort sett återspeglar våra forskningsintressen (http://www.ebc.uu.se/education/postgrad/gradschool/Seminars). Vårt labb är en del av Institutionen för evolutionsbiologi (http://www.ebc.uu.se/Research/IEG/evbiol/), ett aktivt miljö som behandlar grundläggande evolutionära frågor med ett brett spektrum av olika metoder. Som medlem i Science for Life Laboratory (http://www.scilifelab.se/) har vi tillgång till fantastiska datorresurser (https://www.uppmax.uu.se/uppnex) och en excellent bioinformatik infrastruktur (http://www.scilifelab.se/platforms/bioinformatics/). Vi samarbetar också aktivt med forskargrupper i det närliggande BioMedicalCentre (http://www.imbim.uu.se/Research). Labbet ligger i studentstaden Uppsala, som erbjuder rika möjligheter inom kultur-och friluftsliv. Sveriges huvudstad Stockholm är mindre än en timmes tågresa bort.

Lön: Individuell lönesättning tillämpas. Ange löneanspråk i ansökan.

Ansökan inkluderar CV, motivering samt kontaktuppgifter till minst två referenser.

Upplysningar om anställningen lämnas av Jochen Wolf, jochen.wolf@ebc.uu.se.

Välkommen med din skriftliga ansökan senast den 7 juli, 2014. UFV-PA 2014/1596. Klicka på länken nedan för att komma till ansökningsformuläret.

Bioinformatiker


Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Vi tar enbart emot ansökan på det sätt som beskrivs i annonsen.