Bioinformatiker

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 41 000 studenter, 6 500 anställda och en omsättning på 5,9 miljarder kronor.



Bioinformatiker vid Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi.

Tillsvidareanställning med tillträde snarast. 6 månader provanställning.

Bioinformatics Infrastructure for Life Sciences (BILS; http://bils.se), främjar svensk livsvetenskaplig forskning genom att stödja forskare med bioinformatisk expertis. Över 45 experter finns anställda utspridda på ett flertal orter i Sverige med spetskompetens inom ett flertal områden som genomik, transkriptomik, proteomik, metabolomik och statistik. BILS samarbetar med SciLifeLab (http://www.scilifelab.se), en nationell resurs som tillhandahåller avancerad teknik och tekniskt kunnande inom biovetenskaperna. Den stora mängden tillgängliga resurser gör att Sverige är en av de bästa platserna i världen för livsvetenskaplig forskning som tillsammans med skickliga forskare har gjort att Sverige ligger i framkant av områden som komparativ genomik och genomevolution.

BILS startar nu en ”genome assembly”-grupp på Uppsala Universitet placerad i Navet: SciLifeLabs Uppsala-nod. I denna kreativa miljö och i nära samarbete med den redan etablerade annoterings-gruppen kommer assembly-gruppen att hjälpa Svenska assembly-projekt med framförallt de novo assembly av genom, inklusive assembly-validering.

Arbetsbeskriving: För denna nya assembly-grupp söker vi en/två experter med lång erfarenhet av assembly och en vilja att vara med om att utveckla en ny och framgångsrik infrastruktur till en hög internationell standard. Gruppen kommer att hjälpa svenska assembly-projekt med allt från handledning till att fullständigt ansvara för assembly-delen av projektet. Projekten kommer att variera mycket och man kan förvänta sig många olika typer av data från många olika organismer. En viktig del av arbetet kommer att vara konstruktion av pipelines för kvalitetskontroll, assembly och assembly-validering och en vana av liknande arbete i en Linuxmiljö är därför av stor vikt för positionen.

Kvalifikationskrav: Doktorsexamen inom bioinformatik, molekylärbiologi, datavetenskap eller liknande utbildning och god erfarenhet av genom-assembly. Erfarenhet av närbesläktade områden inom NGS är en styrka och vi ser extra positivt på erfarenhet av assembly av stora eukaryota genom. Gedigen kunskap i skriptspråk (t.ex. Perl, Python eller Ruby) är en nödvändighet och utveckling av pipelines och/eller assemblymjukvara anses extra positivt. Vidare krävs god förmåga att arbeta i en serviceinriktad miljö, både i samarbete och självständigt. Utmärkt talad och skriven engelska krävs. Innehavare av anställning kommer samarbeta med forskare av mycket olika bakgrund varför utmärkt kommunikationsförmåga är nödvändigt. Stor vikt läggs vid personlig lämplighet.

Upplysningar: För allmänna frågor om BILS, kontakta Prof. Bengt Persson på e-post: bengt.persson@bils.se. För mer specifika frågor om arbetsuppgifter, kontakta Dr. Henrik Lantz på e-post: henrik.lantz@imbim.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 11 augusti 2014. UFV-PA 2014/1993. Klicka på länken nedan för att komma till ansökningsformuläret.

Bioinformatiker


Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Vi tar enbart emot ansökan på det sätt som beskrivs i annonsen.