Bioinformatiker

Bioinformatiker, med inriktning mot användning av tekniker för ultrasnabb genomanalys vid Institutionen för genetik och patologi, Rudbecklaboratoriet.Tillträde snarast för en period av 2 år, med möjlighet till förlängning.

Institutionen för genetik och patologi vid Uppsala universitet (http://www.genpat.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom medicinsk och klinisk genetik, bioinformatik, patologi, tumörbiologi samt vaskulärbiologi.Rudbecklaboratoriet erbjuder en välutvecklad infrastruktur för forskning med tillgång till spetsteknologi och ett antal serviceverksamheter, såsom cellanalys, konfokalmikroskopi, DNA-sekvenering och genotypning.

Bestämningen av hela genomsekvensen hos en art representerar en milstolpe inom livsvetenskaperna.Nya ultra-snabba tekniker för att bestämma DNA-sekvensen, baserade på massiv parallell DNA-sekvensning, finns nu tillgängliga och gör det möjligt att bestämma en arts hela genom till en bråkdel av tidigare kostnader.Dessa tekniker finns etablerade vid institutionen för genetik och patologi (ABI SOLiD) inom Centrum för Metagenomisk Sekvensanalys (CMS).De genererar mycket stora datamängder och kräver en omfattande bioinformatisk analys.CMS är en "core facilitet" som utför ultrasnabb DNA-sekvensning till svenska forskargrupper.Denna service omfattar såväl den laborativa analysen som de initiala delarna av den bioinformatiska analysen.

Arbetsuppgifter: Som bioinformatiker vid Institutionen för genetik och patologi kommer du att ha huvudansvaret för informatikdelen inom denna verksamhet.Detta innebär att du tillsammans med forskarna planerar projektet, genomför de initiala dataanalyserna med hjälp av tillgängliga programvaror, samt tillgodoser datalagringsbehovet.Detta ställer krav på såväl datateknisk som bioinformatisk kunskap.Stora möjligheter finns att utveckla egna analysmetoder eller testa nya metoder på de dataset som genereras.
Kvalifikationskrav: Doktorsexamen med dokumenterad erfarenhet inom området samt datateknisk och bioinformatisk kunskap.

Önskvärt och/eller meriterande i övrigt: Tidigare postdocerfarenhet samt erfarenhet av genomanalys, bioinformatik, dataprogrammering (C++, JAVA) och olika operativsystem (Linux, Windows, Mac OS).

Uppsala universitet har ambitionen att främja jämställdheten genom en jämnare könsfördelning.Flertalet anställda inom denna kategori är kvinnor varför vi gärna ser män som sökande till anställningen.

Lön sätts efter kompetens.Det är önskvärt att löneanspråk anges i ansökan

Ansökan skall innehålla, meritförteckning (CV), publikationslista, tre referenser med kontaktinformation (namn, adress, fax nr, telefonnummer och/eller e-post adress).