Bioinformatiker

Bioinformatiker
vid Institutionen för genetik och patologi, Rudbecklaboratoriet, med inriktning mot användning av tekniker för storskalig genomanalys.Tillsvidareanställning med tillträde snarast, 6 månaders provanställning tillämpas.

Institutionen för genetik och patologi vid Uppsala Universitet (http://www.genpat.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom medicinsk och klinisk genetik, bioinformatik, patologi, tumörbiologi samt vaskulärbiologi.Rudbecklaboratoriet erbjuder en välutvecklad infrastruktur för forskning med tillgång till spetsteknologi och ett antal serviceverksamheter, såsom cellanalys, konfokalmikroskopi, DNA-sekvensering och genotypning.Anställningen som bioinformatiker är placerad vid Uppsala Genome Center som är en facilitet för olika typer av storskalig analys av DNA.

Arbetsuppgifter: Som bioinformatiker vid Institutionen för Genetik och Patologi och Uppsala Genome Center kommer du att ha huvudansvaret för informatikdelen för sekvensdata som genereras med s.k. "next-generation sequencing" på ABI SOLiD system.Detta innebär att du tillsammans med forskarna planerar projektet, genomför de initiala dataanalyserna med hjälp av tillgängliga programvaror, samt tillgodoser datalagringsbehovet.Detta ställer krav på såväl datateknisk som bioinformatisk kunskap.I arbetet ingår också att informera och introducera forskarna i hantering och analys av genererad sekvensdata.En del av arbetstiden kan komma att användas i aktuella forskningsprojekt inom institutionen.Stora möjligheter finns att utveckla egna analysmetoder eller testa nya metoder på de dataset som genereras.

Kvalifikationskrav: Doktorsexamen med dokumenterad erfarenhet inom området samt datateknisk och bioinformatisk kunskap.Tidigare erfarenhet av genomanalys, bioinformatik, dataprogrammering (C++, JAVA) och olika operativsystem (Linux, Windows, Mac OS).Ett krav är förmåga att med egna initiativ och självständighet utföra arbetet enligt uppdrag samt att ta ansvar för utfört arbete gentemot uppdragsgivare.En viktig uppgift är att kommunicera med de forskare vi utför arbete åt och att introducera dem i denna typ av bioinformatiskt arbete.Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Önskvärt och/eller meriterande i övrigt: Tidigare erfarenhet av arbete med data från "next generation sequencing", särskilt från ABI SOLiD system.

Uppsala universitet har ambitionen att främja jämställdheten genom en jämnare könsfördelning.Flertalet anställda inom denna kategori är kvinnor varför vi gärna ser män som sökande till anställningen.

Lön sätts efter kompetens.Det är önskvärt att löneanspråk anges i ansökan.


Välkommen med din ansökan med ev.I samtliga fall ska UFV-PA 2010/1005 anges.För att möjliggöra framtida kontakt ska ansökan innehålla uppgifter om namn, adress och telefonnummer.Meritförteckning ska också bifogas till ansökan.