Bioinformatiker

Bioinformatiker
vid Institutionen för genetik och patologi, Rudbecklaboratoriet, med inriktning mot användning av array- och DNA-sekvens- baserade tekniker för genomanalys.Tills vidare med tillträde snarast, sex månaders provanställning tillämpas.

Institutionen för genetik och patologi vid Uppsala universitet (http://www.genpat.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom medicinsk och klinisk genetik, bioinformatik, patologi, tumörbiologi samt vaskulärbiologi.Rudbecklaboratoriet erbjuder en välutvecklad infrastruktur för forskning med tillgång till spetsteknologi och ett antal serviceverksamheter, såsom cellanalys, konfokalmikroskopi, DNA-sekvensering och genotypning.

Bestämningen av hela genomsekvensen hos en art representerar en milstolpe inom livsvetenskaperna.Tillgång till sekvensen från det humana genomet möjliggör globala genomanalyser med hjälp av ett flertal tekniker, såsom olika typer arrayer och storskalig parallell DNA-sekvensning.Ett av ansvarsområdena kommer att vara analyser av data genererade från Illumina och Nimblegen array platformer, i samband med analyser av genetisk och epigenetisk variation inom olika translationella forskningsprojekt.Vidare, nya snabba tekniker för att bestämma DNA-sekvensen, baserade på massiv parallell DNA-sekvensning, finns nu tillgängliga och gör det möjligt att bestämma en arts hela genom till en bråkdel av tidigare kostnader.Dessa tekniker finns etablerade vid Uppsala universitet.De genererar mycket stora datamängder och kräver en omfattande bioinformatisk analys.

Arbetsbeskrivning:
Som bioinformatiker vid Institutionen för genetik och patologi kommer du att ha ansvaret för informatikdelen inom ovan beskrivna verksamhet.Detta innebär att du tillsammans med forskarna planerar projektet, genomför de initiala dataanalyserna med hjälp av tillgängliga programvaror, samt tillgodoser datalagringsbehovet.Detta ställer krav på såväl datateknisk som bioinformatisk kunskap.Stora möjligheter finns att utveckla egna analysmetoder eller testa nya metoder på de dataset som genereras.

Kvalifikationskrav:
Doktorsexamen med dokumenterad erfarenhet inom området samt datateknisk och bioinformatisk kunskap.Tidigare post-doc erfarenhet samt erfarenhet av genomanalys, bioinformatik, dataprogrammering (Perl, C++, JAVA) och olika operativsystem (Linux, Windows).Självständighet och god förmåga att samarbeta är viktiga personliga egenskaper.

Du som söker är också ansvarstagande och har god förmåga att kommunicera med andra medlemmar i gruppen samt har förmågan att introducera yngre medarbetare till bioinformatiska analyser.Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Lön sätts efter kompetens.Det är önskvärt att löneanspråk anges i ansökan.

Ansökan skall innehålla, meritförteckning (CV), publikationslista, tre referenser med kontaktinformation (namn, adress, fax telefonnr och e-post adress).