Bioinformatiker

Bioinformatiker

Arbetsbeskrivning

KTH är ett av Europas ledande tekniska universitet och en viktig arena för kunskapsutveckling. Som Sveriges största universitet för teknisk forskning och utbildning samlar vi studenter, forskare och fakultet från hela världen. Vår forskning och utbildning omfattar såväl naturvetenskap som alla grenar inom teknik samt arkitektur, industriell ekonomi, samhällsplanering, historia och filosofi.




Forskningsingenjör inom Bioinformatik/Systemutveckling

Tjänsten är placerad på SciLifeLab i Solna.

SciLifeLab är ett nationellt centrum för storskalig livsvetenskaplig forskning med en avancerad teknologisk infrastruktur. Läs mer om verksamheten på: https://www.scilifelab.se/

Arbetsuppgifter
Vi söker en Bioinformatiker / Systemutvecklare till vårt produktionsteam på National Genomics Infrastructure (NGI), en av Europas största sekvenseringsanläggningar. NGI- Stockholm tillhandahåller storskalig sekvensering, samt kunskap om denna, till svenska forskargrupper. Verksamhetens mål är att främja svensk forskning inom genomik, samt att hålla Sverige konkurrenskraftigt inom fältet. Detta uppnås genom att arbeta mot hög kvalitet på både data, analyser och service. Läs mer om NGIs verksamhet på: https://ngisweden.scilifelab.se/about   

Den sökande kommer att arbeta med kvalitetskontroll, analys och leverans av sekvensdata. Arbetet kommer även att innefatta utveckling, förbättring och underhåll av informatiklösningar för hantering av produktionens interna dataflöden. Fördelningen mellan de olika arbetsuppgifterna kommer att bero på den sökandes erfarenhet.

Arbetsuppgifterna kommer bl a innefatta följande

- Kvalitetskontroll och leverans av sekvensdata
- Analys av sekvensdata enligt “best-practice” protokoll samt tolka och bedöma analysresultat
- Systemadministration av centrala IT-system
- Koordinering av programvaruinstallationer och underhåll av analysservrar
- Automatisering av data- och analysflöden
- Underhåll och utveckling av interna informationsdatabaser
- Besvara supportärenden och kommunicera med externa beställare
- Visualisering av processförlopp och resultat

Vi erbjuder
- En anställning på ett ledande tekniskt universitet som skapar kunskap och kompetens för en hållbar framtid
- Engagerade och ambitiösa kollegor samt en kreativ, internationell och dynamisk miljö

https://www.kth.se/om/work-at-kth/kth-your-future-workplace-1.49050.

Kvalifikationer
Krav
- Avlagd examen på grundnivå eller avancerad nivå (högskoleutbildning) inom ämnet för anställningen eller motsvarande kompetens.
- Utmärkta programmeringskunskaper. Erfarenhet att arbeta med Python, Perl, Java eller  C/C++.
- Erfarenhet av arbete med versionshanteringsverktyg som git
- Väl förtrogen med att arbeta i Linux-/Unixmiljö Utmärkt kommunikations- och samarbetsförmåga
- Flytande engelska i tal och skrift då det krävs i det dagliga arbetet

Meriterande
- Tidigare erfarenhet av att analysera NGS data. 
- Erfarenhet av användning av datorkluster (HPC eller Cloud).
- Erfarenhet av webbapplikationsutveckling, databasadministration.
- Erfarenhet av att arbeta med LIMS (Laboratory Information Management Systems)
- Medvetenhet om mångfalds- och likabehandlingsfrågor med särskild fokus på jämställdhet.

Personliga Egenskaper
För att lyckas och trivas i den här rollen så tror vi att du är en självgående problemlösare, med ett strukturerat och kvalitetsmedvetet arbetssätt. Du har god kommunikationsförmåga i både tal och skrift. Det är också viktigt med en bra samarbetsförmåga.

Vi kommer att lägga stor vikt vid personliga egenskaper.

Fackliga representanter
Du hittar kontaktuppgifter till fackliga representanter på https://www.kth.se/om/work-at-kth/fackrepresentanter-1.500898. 

Ansökan
Du ansöker via KTH:s rekryteringssystem. Du som sökande har huvudansvaret för att din ansökan är komplett när den skickas in.

Ansökan ska innehålla:
1. CV inklusive relevant yrkeserfarenhet och kunskap.
2. Personligt brev, max 2 sidor långt.

Ansökan ska vara KTH tillhanda senast sista ansökningsdagen vid midnatt, CET/CEST (CentralEuropean Time/Central European Summer Time).

Om anställningen 
Anställningen gäller tidsbegränsat enligt avtal - i upp till 24 mån, dock längst tom 31/12 2023. 
Tillträde enligt överenskommelse.

Övrigt
Strävan efter jämställdhet, mångfald och lika villkor är både en kvalitetsfråga och en självklar del av KTH:s värdegrund.

För information om behandling av personuppgifter i samband med rekrytering https://www.kth.se/om/work-at-kth/processing-of-personal-data-in-the-recruitment-process-1.823440.

Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.

Sammanfattning

Liknande jobb


Forskningsassistent: Klinisk noggrannhet hos AI inom bröstradiologi

Forskningsassistent: Klinisk noggrannhet hos AI inom bröstradiologi

20 december 2024

Staff scientist inom metagenomik

5 december 2024