Bioinformatiker

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra långsiktig skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har drygt 54 000 studenter, mer än 7 500 anställda och en omsättning på cirka 8 miljarder kronor.




Institutionen för kirurgiska vetenskaper (IKV) tillhör vetenskapsområdet för medicin och farmaci och har ca 160 anställda och runt 200 registrerade doktorander, av vilka flertalet är kliniskt verksamma läkare och sjuksköterskor.

Vid institutionen bedrivs forskning och undervisning på grundnivå, avancerad nivå och forskarnivå. Undervisningen sker bl.a. inom läkar-, sjuksköterske-, röntgensjuksköterske- och specialistsjuksköterskeprogrammen. Forskningen bedrivs i forskargrupper organiserade utifrån olika kirurgiska specialiteter och näraliggande ämnen såsom anestesi, intensivvård och radiologi. Mycket forskning bedrivs i samarbete mellan olika forskargrupper inom IKV och vid andra institutioner vid Uppsala universitet samt med andra universitet både i Sverige och internationellt. Många av institutionens anställda har anställningar som är förenade med befattningar vid Akademiska sjukhuset.

Nu söker forskargruppen för anestesi och intensivvård en bioinformatiker, gärna med intresse för epidemiologi!

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet.

Projektbeskrivning
Utveckling av svår sjukdom på grund av infektioner är starkt kopplad till värdfaktorer. Det finns idag stora genotypade kohorter liksom stora databaser med data på hälsa och sjukdom. Genom att använda data från stora kohorter och nationella register studerar vi vilka biologiska mekanismer som ligger bakom allvarlig sjukdom.

Arbetsuppgifter
I rollen som bioinformatiker får du möjlighet att arbeta med ovanstående projekt. Det gör du genom att hantera stora databaser med genetiska data och data från nationella register. Du ska undersöka vilka genvarianter och proteiner som är nyckelfaktorer för att utveckla allvarlig sjukdom till exempel efter infektion med metoder så som GWAS och Mendelisk randomisering. Vidare består arbetsuppgifterna av självständig databearbetning, statistiska analyser och att skriva vetenskapliga artiklar i samarbete med forskningsgruppen. Det finns också möjlighet att avsätta viss tid till egen forskning!

Kvalifikationskrav

Masterexamen i bioinformatik, epidemiologi eller annat ämnesområde som bedöms likvärdigt. Dokumenterade färdigheter i data management, statistiska analyser och statistisk modellering (R, Python). Starkt intresse för, och erfarenhet av, genetisk epidemiologi och/eller expertkunskaper i genetisk epidemiologisk studiedesign. Tidigare kunskap och erfarenhet av att självständigt programmera statistiska analyser av epidemiologiska data. Mycket goda kunskaper i det engelska språket, både muntligt och skriftligt, samt utmärkta färdigheter i vetenskaplig skrift.

Som person har du en fallenhet för att samarbeta med andra, vilket är nödvändigt för ett framgångsrikt arbete med andra såväl som individuellt. Du har lätt för att prioritera bland dina arbetsuppgifter och du har en god organisationsförmåga. Slutligen är du detaljorienterad och har ett professionellt förhållningssätt. Stor vikt kommer att fästas vid personliga egenskaper.

Önskvärt/meriterande i övrigt

Doktorsexamen i relevant ämne Erfarenhet av statistiska analyser av data från svenska nationella register är meriterande.

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad i 12 månader. Omfattningen är 100 %. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Prof. Miklos Lipcsey, miklos.lipcsey@uu.se 
För frågor om anställningsförfarandet, vänligen kontakta HR-generalist Louise Lundqvist, louise.lundqvist@uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 7 augusti 2023, UFV-PA 2023/2677

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.


Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.