Bioinformatiker - Faciliteten för Klinisk sekvensering

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 40 000 studenter, 7 000 anställda och en omsättning på 6,5 miljarder kronor.



Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet (http://www.

igp.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl.a cancer, diabetes och molekylär diagnostik. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom medicinsk och klinisk genetik, klinisk immunologi, bioinformatik, patologi, tumörbiologi, vaskulärbiologi samt strålningsvetenskap. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar inom den medicinska fakulteten samt ett antal utbildningar inom teknisk-naturvetenskaplig fakultet. Institutionen omsätter omkring 300 mkr varav drygt hälften är externa forskningsbidrag och har ca 340 anställda, varav ca 116 är doktorander, och totalt över 600 verksamma i sin arbetsstyrka.

Klinisk sekvensering startades 2013 som en SciLifeLab-facilitet, organiserad av Uppsala Universitet, Akademiska sjukhuset och Science for Life Laboratory. Uppdraget är att utveckla och tillhandahålla genetiska analyser för olika former av cancer och ärftliga sjukdomar, främst med hjälp av de senaste teknikerna för DNA-sekvensering, s.k. next-generation sequencing (NGS). Tillsammans med andra bioinformatiker, genetiker och läkare levererar faciliteten kliniska bedömningar av upptäckta genetiska varianter.

Arbetsuppgifter:
Faciliteten söker en bioinformatiker på heltid för att driva utvecklingen av analyser och databaser inom vår facilitet. Arbetet kommer till stor del bestå i att utveckla robusta metoder för att analysera NGS data för kliniskt bruk. Inom ramen för tjänsten kommer den sökande bl.a. utvärdera och anpassa mjukvaror för klinisk drift inom våra analyssystem på högpresterande datorkluster. En särskilt viktig aspekt är datasäkerhet och hantering av klinisk data. Den anställde kommer att jobba tillsammans med läkare, sjukhusgenetiker, bioinformatiker och molekylärbiologer inom vår facilitet och även i nationella och internationella samarbeten. Klinisk sekvensering är ett nytt och intensivt forskningsområde och den anställde kommer att ha möjligheten att bidra till publicering och presentation av både tekniska och biologiska resultat och metoder.

Kvalifikationskrav:
Masterexamen eller liknande inom bioinformatik, bioteknik, datavetenskap eller motsvarande fält. Vi är särskilt intresserade av sökanden med erfarenhet av utveckling och tillämpning av bioinformatiska verktyg. Dokumenterad förmåga inom relevanta programmeringsspråk är ett krav, liksom erfarenhet att arbeta i linuxmiljö. Erfarenhet av IT-arbete med höga säkerhetskrav är också meriterande. Arbetet ställer stora krav på noggrannhet, initiativkraft, samarbetsförmåga och självständighet. Tjänsten förutsätter en god förmåga att uttrycka sig på engelska i tal och skrift.

Önskvärt/meriterande i övrigt:
Eftersom dokumentation mot Akademiska sjukhuset sker på svenska är god förmåga att uttrycka sig på svenska i tal och skrift meriterande. Stor vikt kommer att läggas på personlig lämplighet.

Efter en kvalitativ helhetsbedömning av kompetens och skicklighet kommer den sökande att väljas som bedöms ha de bästa förutsättningarna att genomföra och utveckla aktuella arbetsuppgifter samt bidra till att utveckla verksamheten.

Uppsala universitet värdesätter de kvaliteter som jämn könsfördelning och mångfald tillför verksamheten. Vi ser därför gärna sökande av alla kön och med olika födelsebakgrund, funktionalitet och livserfarenhet.

Lön: Individuell lönesättning tillämpas.

Tillträde: Snarast eller efter överenskommelse.

Anställningsform: Tillsvidareanställning med provanställning på 6 månader.

Anställningens omfattning: 100 %

Upplysningar om anställningen lämnas av 
Malin Melin, malin.melin@scilifelab.uu.se, 018-471 4588 

Välkommen med din ansökan senast den 27 februari 2017, UFV-PA 2017/54.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.