Bioinformatiker i klinisk genetik

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens 100 främsta lärosäten. Här finns cirka 44 000 studenter och mer än 8 000 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.


Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 2700 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.

Institutionen för laboratoriemedicin (ILM) är en av sex institutioner vid Medicinska fakulteten. Vi bedriver ledande forskning inom det laboratoriemedicinska fältet med fokus på hur sjukdomar uppkommer och hur vi kan förbättra patienters diagnostik och behandling. Några av våra starkaste områden med forskning i världsklass, handlar om cancer-, genetik- och blodforskning.



Forskargruppen

Vid Avdelningen för klinisk genetik och inom forskargruppen ledd av Thoas Fioretos söker vi en bioinformatiker med inriktning mot matematisk modellering och maskininlärning.

Inom forskargruppen, som består av ett 10-tal personer, arbetar vi bl.a. med integrativa genomiska analyser av leukemiceller för att bättre förstå varför dessa sjukdomar uppstår och för att förbättra diagnostik och uppföljning av patienter som insjuknar i leukemi. De integrativa genetiska analyserna består av helgenomsekvensering, exomsekvensering, RNA-sekvensering och singel-cell sekvensering av leukemiceller och ställer stora krav på kunskaper inom avancerad bioinformatisk och matematisk analys, samt maskininlärning. Läs mer om gruppens forskning https://portal.research.lu.se/portal/sv/organisations-researchgroups/translational-genomic-and-functional-studies-of-leukemia(868a0f62-e3a7-42b7-a811-3e1f3ddad2b3).html.

Inom forskargruppen värnar vi om en god arbetsmiljö med högt i tak och omtanke om varandra.

Gruppen söker nu en bioinformatiker till en deltidstjänst på 20%, tidsbegränsad till 2 år. Önskat startdatum är 1 august eller enligt överenskommelse.

Arbetsuppgifter

Den anställda kommer att arbeta i ett team av forskare med både bioinformatisk och molekylärgenetisk kompetens och ha särskilt ansvar för att stödja utvecklingen och kunskapen avseende maskininlärning inom forskargruppen. Utvecklade klassningsverktyg kommer bl.a. att användas för att prediktera biologiska/genetiska undergrupper av olika leukemiformer. Den anställda förväntas också att vara behjälplig med programmering för utveckling av nya analysverktyg som underlättar tolkningen av erhållna datamängder.

Kvalifikationer

Krav för anställningen är:

- PhD inom matematik, gärna med fokus på matematisk modellering och bioinformatik.
- Postdoktoral erfarenhet inom relevant ämnesområde (t.ex matematik, beräkningsbiologi).
- Mycket goda kunskaper inom maskininlärning (t.ex. XGBoost, Random forests).
- Ha tidigare kunskaper och erfarenhet av matematisk modellering och bioinformatiska analyser av stora genomiska datamängder.
- Mycket goda kunskaper i programmering (t.ex. C++, Julia, Python, Perl och/eller R).

Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper. Arbetsuppgifterna kräver att du har förmågan att samarbeta väl med andra, eftersom du kommer att ingå i ett team, samt har en god förmåga att arbeta självständigt och tar egna initiativ.

Meriterande för tjänsten är:

- Tidigare erfarenhet av att analysera genomiska data från blodcancer.

Instruktioner till ansökan

Ansökan ska innehålla ett personligt brev där du beskriver hur du uppfyller eftersökta kvalifikationer, ett CV samt examensbevis.

Övrigt

Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.

Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Vi ser jämställdhet och mångfald som en styrka och tillgång. Välkommen med din ansökan! Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.