Bioinformatiker i transkriptomanalys

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 40 000 studenter, 6 500 anställda och en omsättning på cirka 5,5 miljarder kronor.



Tillsvidareanställning med tillträde snarast.

6 månader provanställning.

NGS (Next Generation Sequencing) är ett starkt växande område som möjliggör en ökad förståelse av genetiken bakom bl.a. cellulära funktioner och olika sjukdomar.  Den ökade efterfrågan på den här typen av sekvensdata skapar också ett större behov av bioinformatisk analys. Den nationella bioinformatikinfrastrukturen BILS (Bioinformatics Infrastructure for Life Sciences; http://bils.se) med syfte att stödja svenska forskare med bioinformatik, söker därför en ny medarbetare som ska stödja svenska projekt med framför allt analys av transkriptom data, även kallad RNA-seq.

Arbetsuppgifter: Tjänsten är placerad vid IMBIM, BioMedicinskt Centrum i Uppsala länkad till Science for Life Laboratory. Huvudsakliga arbetsuppgifter inkluderar rekonstruktion av transkript både med och utan referensgenom, genexpression och funktionell annotering av transkript. Tjänsten inkluderar också utveckling av ”pipelines” för hantering av transkriptomdata, vilket kommer att ske i samarbete med personalen vid BILS:s annoteringsplattform.

Kvalifikationskrav: Doktorsexamen inom bioinformatik, molekylärbiologi, datavetenskap eller liknande utbildning. Kandidaten ska ha erfarenhet av NGS-data och i synnerhet RNA-seq.  Vidare krävs god förmåga att arbeta i en serviceinriktad miljö, både i samarbete och självständigt. Erfarenheter av skriptspråk (t.ex. Perl, Python eller Ruby) och speciellt utveckling av pipelines är positivt. Utmärkt kommunikationsförmåga är nödvändigt, eftersom innehavaren av denna tjänst kommer att samarbeta med forskare med mycket olika bakgrund. Utmärkt talad och skriven engelska krävs. Stor vikt kommer läggas vid personlig lämplighet.

För allmänna frågor om BILS, kontakta Prof. Bengt Persson på bengt.persson@bils.se. För mer specifika frågor om arbetsuppgifter, kontakta Dr. Henrik Lantz på henrik.lantz@imbim.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 12 maj 2014. UFV-PA 2014/1095. Klicka på länken nedan för att komma till ansökningsformuläret

Bioinformatiker i transkriptomanalys


Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Vi tar enbart emot ansökan på det sätt som beskrivs i annonsen.