Bioinformatiker inom precisionsmedicin

Vill du arbeta med precisionsmedicin i den molekylära diagnostikens frontlinje?
Vi söker en bioinformatiker för att stärka vårt bioinformatiker team inom området cancer.

Tjänsten är en unik och spännande möjlighet för dig som vill jobba med precisionsmedicin och genomik inom avancerad forskning och det finns utrymme att utforma tjänsten utifrån dina kompetenser och intresseområden.

Vi erbjuder en fartfylld miljö där du arbetar i nära samarbete med både högskola och hälso- och sjukvård. Vårt uppdrag vid Clinical Genomics är att bidra till stor samhälls- och patientnytta och i din roll kommer du vara en bidragande faktor till detta arbete.

Om oss
Enheten Clinical Genomics är en nationell forskningsinfrastruktur vid Science for Life Laboratory (SciLifeLab). Vårt uppdrag är att bidra till implementeringen av precisionsdiagnostik och precisionsmedicin i Sverige. Tillsammans med forskare och vårdgivare i Sverige utför vi avancerade genomikanalyser (storskalig DNA sekvensering) och jobbar för att utveckla och implementera de avancerade testerna inom sjukvården. Syftet är att säkerställa möjlighet till världsledande forskning och att diagnostiken i Sverige ligger i internationell framkant. Vi har även ett brett nordiskt och europeiskt nätverk av samarbetspartners och deltar i flera gemensamma projekt.

Länk: http://www.scilifelab.se/facilities/clinical-genomics-stockholm/

Din roll
Vi söker dig som har ett brinnande intresse för bioinformatik, för att arbeta med avancerade genomikanalyser inom området cancer. Fokus på arbetet kommer att ligga inom helgenomsekvensering kombinerat med expressionsanalyser inom flera pågående projekt med nationella och internationella samarbetspartners. Det finns möjlighet att utforma tjänsten utifrån dina kompetenser och intresseområden.

I rollen ingår att;

- Utveckling av bioinformatik inom cancer
- Utvärdera nya analysverktyg
- Delta i analys av patientprover i flera pågående pilotprojekt
- I samarbete med backend och frontend utvecklare samt externa samarbetspartners utveckla informatiklösningar för klinisk tolkning av genomik och transkriptomikdata

Vårt team består av ca 35 medarbetare med bred kompetens inom genomik, bioinformatik, mjukvaruutveckling, IT och kvalitetssäkring. Vi har en teknisk infrastruktur för avancerade genomikanalyser, vilket vi löpande vidareutvecklar för att möta framtida behov. Hos oss erbjuds du en spännande arbetsmiljö, med utmanande arbetsuppgifter och hög teamkänsla. Vi arbetar tillsammans för att uppnå teamets gemensamma mål; att genom avancerade genomikanalyser öka förståelsen av sjukdomsmekanismer och genom vården bidra till att förbättra människors liv.

Vi jobbar i nära samarbete med genetiker, molekylärbiologer, läkare och andra vårdaktörer, både på SciLifeLab och hos olika vårdgivare i Sverige.

Vem är du?
Vi söker dig som har en examen inom life science eller motsvarande kompetens.

Krav för tjänsten är:

- Utmärkta kunskaper i bioinformatik inom genomik
- Goda kunskaper i Linux och goda programmeringskunskaper i Python och R
- Erfarenhet av arbete med storskaliga beräkningsresurser (high performance computing)
- Goda kunskaper i engelska

Det är viktigt att du trivs med att arbeta i team och att du som person bidrar till interna och externa samarbeten.

Meriterande:

Vi ser med fördel att du innehar flera av nedan erfarenheter, men det är inget krav:

- Disputerad inom relevant life science ämnesområde
- Erfarenhet av arbete inom cancerområdet och med relevanta genomikdatabaser
- Erfarenhet av arbete med system för versionskontroll (tex git)
- Erfarenhet av arbete med containerteknologier (docker, singularity, podman)
- Erfarenhet av databasteknologier (SQL och noSQL)
- Erfarenhet av att leverera strukturerad kod

Vad erbjuder vi?
En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet även en statlig myndighet. Det innebär att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal, generös semester och en bra tjänstepension. Du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård.

Placering: Solna



Ansökan
Tjänsten är en visstidsanställning på upp till max 24 månader. 

Varmt välkommen med din ansökan senast 2021-01-15

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. 

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss