Bioinformatiker (tidsbegränsad anställning)

vid Institutionen för biokemi och biofysik. Sista ansökningsdag: 2020-11-13.

SciLifeLab (www.scilifelab.se) är ett nationellt centrum för storskalig livsvetenskaplig forskning med en avancerad teknologisk infrastruktur. Vid SciLifeLab utförs multidisciplinär forskning baserad på DNA sekvensering, genexpressionsanalys, proteomik, bioinformatik, biostatistik och systembiologi. Målsättningen är att göra det möjligt för svenska forskare att analysera gener, transkript och proteiner i olika organismer i avsikt att klarlägga molekylära mekanismer relaterade till hälsa och miljö. Exempel på tematiska forskningsområden som för närvarande bearbetas inom SciLifeLab är klinisk genomik/proteomik, cancergenomik och komplexa sjukdomars genomik samt ekologisk och miljörelaterad genomik.

Bioinformatik och systembiologi är centrala aktiviteter inom centret, och en betydande del av personalen vid SciLifeLab arbetar inom dessa områden.

National Genomics Infrastructure (NGI, https://ngisweden.scilifelab.se/about/) är den största tekniska plattformen på SciLifeLab. Det är en nationell resurs som erbjuder en toppmodern infrastruktur för DNA-sekvensering och SNP-genotypning till forskare över hela Sverige. Genom att ge tillgång till avancerad teknik inom genomik och tillhandahålla riktlinjer och stöd för provsamling, studiedesign, protokollval och bioinformatikanalys, hoppas vi kunna möjliggöra världsledande forskning.

Arbetsuppgifter
Vi söker en vikarierande (ett år) bioinformatiker / systemutvecklare till vårt produktionsteam på NGI som ska arbeta med kvalitetskontroll, analys och leverans av sekvensdata. Arbetet kommer även att innefatta utveckling, förbättring och underhåll av informatiklösningar för hantering av produktionens interna dataflöden. Fördelningen mellan de olika arbetsuppgifterna kommer att bero på den sökandes erfarenhet. 

Arbetsuppgifterna kommer bl a innefatta följande


• Kvalitetskontroll och leverans av sekvensdata.
• Analys av sekvensdata enligt “best-practice” protokoll samt tolka och bedöma analysresultat.
• Systemadministration av centrala IT-system.
• Koordinering av programvaruinstallationer och underhåll av analysservrar.
• Automatisering av data- och analysflöden.
• Underhåll och utveckling av interna informationsdatabaser.
• Besvara supportärenden och kommunicera med externa beställare.
• Visualisering av processförlopp och resultat.

Kvalifikationer
Behörighetskrav


• Högskoleexamen inom bioinformatik eller datavetenskap, alternativt molekylärbiologi/bioteknik med inriktning mot databehandling eller motsvarande kompetens.
• Utmärkta programmeringskunskaper. Erfarenhet att arbeta med Python, Perl, Java eller  C/C++.
• Erfarenhet av arbete med versionshanteringsverktyg som git.
• Väl förtrogen med att arbeta i Linux-/Unixmiljö.
• Utmärkt kommunikations- och samarbetsförmåga.
• Obehindrat tala och skriva engelska.

Meriterande


• Tidigare erfarenhet av att analysera NGS data.
• Erfarenhet av användning av datorkluster (HPC eller Cloud).
• Erfarenhet av webbapplikationsutveckling, databasadministration.
• Erfarenhet av att arbeta med LIMS (Laboratory Information Management Systems).

Vi lägger stor vikt vid den sökandes personliga egenskaper, såsom god samarbetsförmåga, förmåga att arbeta självständigt, god organisationsförmåga och noggrannhet. En positiv attityd gentemot kollegor är en förutsättning.

Anställningsvillkor
Anställningen avser heltid och gäller ett vikariat på ett år. Stockholms universitet tillämpar individuell lönesättning, ange därför gärna löneanspråk. Tillträde snarast.

Stockholms universitet strävar efter att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika möjligheter för alla.

Kontakt
Närmare information om anställningen lämnas av par.lundin@scilifelab.se.

Fackliga företrädare
Ingrid Lander (Saco-S), tfn 0708-16 26 64, saco@saco.su.se, Alejandra Pizarro Carrasco (Fackförbundet ST/Lärarförbundet), tfn 08-16 34 89, alejandra@st.su.se, samt seko@seko.su.se (SEKO).

Ansökan
Du söker anställningen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Bifoga endast personligt brev och CV. Kopior på betyg och intyg tar du med vid en eventuell intervju.

Anvisningar för sökande finns på webbsidan: att söka en anställning.

Välkommen med din ansökan!


Stockholms universitet bidrar till det hållbara demokratiska samhällets utveckling genom kunskap, upplysning och sanningssökande.