Bioinformatiker (tidsbegränsad anställning)

vid Institutionen för biokemi och biofysik. Sista ansökningsdag: 2021-06-28

SciLifeLab är ett nationellt center för molekylära biovetenskaper med fokus på forskning inom hälsa och miljö. Centret kombinerar ledande teknisk expertis med avancerat kunnande inom translationell medicin och molekylära biovetenskaper. SciLifelab är en nationell resurs som drivs av Karolinska Institutet, KTH, Stockholms universitet och Uppsala universitet. Centret samarbetar med flera andra lärosäten.

Arbetsuppgifter
Vi letar efter en bioinformatiker för att gå med i vårt utvecklingsteam vid NGI, en av Europas största sekvenseringsanläggningar, på SciLifeLab i Solna. Den utvalda kandidaten får en varierad roll och kommer att vara delaktig i många typer av uppgifter. Arbetsuppgifterna inkluderar bland annat att:


• arbeta i samarbetsprojekt med användare
• analysera data från interna utvecklingsprojekt
• utveckla nya analysflöden
• programvaruutveckling, till exempel för kvalitetskontroll
• automation av data / analysflöde
• hjälp för att hålla befintliga pipelines och verktyg ”state-of-the-art”.

Kvalifikationer
Krav


• Programmeringskunskaper, främst i Python, alt. R, Perl, Java eller C / C ++.
• Grundläggande kunskap inom versionskontroll, t.ex. git.
• Erfarenhet av att använda Linux / UNIX.
• Utmärkta kommunikations- och samarbetsförmåga.
• Erfarenhet av att jobba i ett ISO-ackrediterat facilitet för Genomik.
• Erfarenhet av informationssystem för laboratorier (LIMS).
• Du talar och skriver engelska obehindrat.

Meriterande


• Erfarenhet av att hantera stora datamängder, särskilt nästa generations sekvenseringsdata (NGS).
• Erfarenhet av HPC eller motsvarande datorsystem.
• Erfarenhet i bioinformatik eller motsvarande kompetens.
• Erfarenhet av webbapplikationsutveckling och / eller databasadministration (SQL eller noSQL).
• Erfarenhet i VueJs.
• Erfarenhet av analysering av HiC/Promoter capture data.
• Erfarenhet i provisionering med hjälp av Ansible.

Personliga egenskaper

För att lyckas och trivas i den här rollen så tror vi att du är en självgående problemlösare, med ett strukturerat och kvalitetsmedvetet arbetssätt. Du har god kommunikationsförmåga i både tal och skrift. Det är också viktigt med en bra samarbetsförmåga.

Vi kommer lägga stor vikt vid personliga egenskaper.

Anställningsvillkor
Anställningen avser heltid och är tidsbegränsad till högst två år. Stockholms universitet tillämpar individuell lönesättning, ange därför gärna löneanspråk. Tillträde snarast.

Stockholms universitet strävar efter att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika möjligheter för alla.

Kontakt
Närmare information om anställningen lämnas av Anja Mezger (Head of Facility, NGI Applications Development), anja.mezger@scilifelab.se eller Phil Ewels (Bioinformatics Lead, NGI Applications Development), phil.ewels@scilifelab.se.

Fackliga företrädare
Ingrid Lander (Saco-S), tfn 0708-16 26 64, saco@saco.su.se, Alejandra Pizarro Carrasco (Fackförbundet ST/Lärarförbundet), tfn 08-16 34 89, alejandra@st.su.se, samt seko@seko.su.se (SEKO).

Ansökan
Du söker anställningen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Bifoga endast personligt brev och CV. Kopior på betyg och intyg tar du med vid en eventuell intervju.

Anvisningar för sökande finns på webbsidan: att söka en anställning.

Välkommen med din ansökan!


Stockholms universitet bidrar till det hållbara demokratiska samhällets utveckling genom kunskap, upplysning och sanningssökande.