Bioinformatiker (tidsbegränsad anställning)

vid Institutionen för biokemi och biofysik. Sista ansökningsdag: 2022-02-10.


Science for Life Laboratory (SciLifeLab) är ett nationellt centrum för molekylär biovetenskap med fokus på hälso- och miljöforskning. Kombinationen av den mycket tvärvetenskapliga kompetensen och forskningsprojekten vid institutionen är unik i Sverige och även på internationell nivå. Denna expertis sträcker sig över cellbiologi, biokemi, biofysik och teori.

Den nationella forskarskolan i naturvetenskap har i sitt pedagogiska utvecklingsarbete fokuserat på att förbättra DBB:s bioinformatikkurs på MS-nivå. Tekniker som implementerats inkluderar undervisning i flippad klassrum, videoföreläsningar, Learning Management Systems, automatiserade examinationer, och virtualisering av laboratorieövningar. Väsentliga hård- och mjukvaruresurser och tekniker har samlats. Godkända betyg och studentnöjdhet har ökat. Målet att skapa en Massively Open Online Course (MOOC) i bioinformatik har fortfarande inte uppnåtts. Vi siktar också på att publicera våra pedagogiska tekniker och läromedel. Nu planeras att tillsammans med annan forskare ansöka om fortsatt finansiering från flera källor.

Aktuella forskningsområden ledda av studierektor Samuel Flores inkluderar tillämpningen av Deep Learning på RNA-strukturförutsägelse. I detta samarbetar han med Arne Elofssons forskargrupp. Utveckling har också gjort av modellbyggande tekniker för virala genom med hjälp av lågupplösta densitetskartor, t.ex. från Cryo Electron Microscopy. Det virala genomprojektet är ett samarbete med Jiří Černý- och Pavel Plevka-grupperna från Tjeckien.

Arbetsuppgifter
Bioinformatikern vi söker kommer att utvärdera, dokumentera och förbättra bioinformatikundervisningsteknikerna, och i synnerhet skapa en Massively Open Online Course (MOOC) i bioinformatik. Arbetet ska publiceras i en pedagogisk eller lämplig ämnestidskrift. Det finns möjlighet att hålla utvalda föreläsningar inom bioinformatik på MS-nivå inom bioinformatikerns kompetensområden.

Om tiden tillåter kan bioinformatikern också delta i vetenskaplig forskning. Forskningserfarenhet inom beräkningsstrukturbiologi, nukleinsyrastruktur, maskininlärning (särskilt djupinlärning) och/eller förutsägelse av makromolekylär struktur i 2D och 3D är därför meriterande.

Kvalifikationer


• Doktorsexamen i bioinformatik, datavetenskap, molekylärbiologi, biokemi, biomedicinsk vetenskap, bioteknik, naturvetenskaplig utbildning eller liknande disciplin.
• Vetenskapliga publikationer inom de tidigare nämnda områdena beräkningsbiologi eller i den pedagogiska litteraturen.
• Tidigare undervisningserfarenhet, lärarutbildningar eller andra bevis på pedagogiska intressen.

Som person bör du vara ansvarsfull, flexibel samt tycka om lagarbete. Då du kommer arbeta med studenter är det viktigt med tålamod. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lömplighet. 

Följande krävs inte men kan stärka din ansökan:


• Programmeringskunskaper, t.ex. i C++ eller Python.
• 3D molekylär modellering och simuleringsfärdigheter

Anställningsvillkor
Anställningen avser heltid och gäller under högst ett år. Stockholms universitet tillämpar individuell lönesättning, ange därför gärna löneanspråk. Tillträde snarast.

Stockholms universitet strävar efter att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika möjligheter för alla.

Kontakt
Närmare information om anställningen lämnas av, Samuel Flores, samuel.flores@scilifelab.se. 

Fackliga företrädare
Ingrid Lander (Saco-S), tfn 0708-16 26 64, saco@saco.su.se, Alejandra Pizarro Carrasco (Fackförbundet ST/Lärarförbundet), tfn 08-16 34 89, alejandra@st.su.se, samt seko@seko.su.se (SEKO).

Ansökan
Du söker anställningen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Bifoga endast personligt brev och CV. Kopior på betyg och intyg tar du med vid en eventuell intervju.

Anvisningar för sökande finns på webbsidan: att söka en anställning.

Välkommen med din ansökan!


Stockholms universitet bidrar till det hållbara demokratiska samhällets utveckling genom kunskap, upplysning och sanningssökande.