Bioinformatiker till Clinical Genomics

Vi söker nu en till två bioinformatiker till Core Facility/Clinical Genomics Linköping vid Medicinska fakulteten

Din framtida arbetsplats
Du kommer arbeta som bioinformatiker på Core Facility/Clinical Genomics (CG) vid Medicinska fakulteten. Inom medicinska fakulteten bedrivs forskning och utbildning inom medicin, biomedicin, vård och folkhälsa. Core Facility är en forskningsinfrastruktur vid Medicinska fakulteten som är en öppen resurs och stöd för alla forskargrupper. Den molekylärbiologiska enheten inom Core Facility är sedan 2019 en del av SciLifeLab plattformen Diagnostic Development och noden kallas lokalt Clinical Genomics Linköping. Noden kommer att utgöra en viktig grund för utvecklingen av arbetet med Genomic Medicine Sweden (GMS) och utveckling av det regionala GMC för sydöstra sjukvårdsregionen. CG Linköping arbetar tätt kopplat till den kliniska verksamheten. Kopplingen till SciLifeLab ger ett brett nätverk av bioinformatiker att interagera med.

Dina framtida arbetsuppgifter
Dina arbetsuppgifter kommer bestå i att:


• Ge bioinformatiskt stöd och konsultation till forskare och forskargrupper vid LiU och Region Östergötland samt i förekommande fall Genomiskt medicinskt centrum (GMC)
• Planera och utföra avancerade bioinformatiska analyser i forskningsprojekt inom genomisk medicin/biomedicin
• Presentera genomförande analyser för våra kunder
• Utveckla metoder, verktyg och arbetsflöden för analyser av framförallt biologiska data
• Lära ut bioinformatik till andra forskare genom att samarbeta inom projekt, undervisa på nationella kurser och nätverka
• Delta i det nationella samarbetet Genomic Medicine Sweden, GMS.

Du kommer att arbeta i flera olika projekt där analyser och tidsramar sätts upp i samråd med Core Facility användare. Centralt för dig är även analyser av komplexa genomikdata från mass-sekvensering inom såväl kliniska- som forskningsfrågeställningar. Utveckling och automation av stabila bioinformatiska processer men också utveckling av nya metoder i samarbete med forskargrupper eller diagnostiska team bestående av läkare, molekylärbiologer och biomedicinska analytiker kommer att utgöra en viktig del av dina arbetsuppgifter. Utöver detta involverar tjänsten också hantering och lagring av genomiska data, samt kvalitet och säkerhetsfrågor.

Dina kvalifikationer
Vi erbjuder tillsvidareanställning för en till två personer med erfarenhet och stark bakgrund inom bioinformatik, metodutveckling och programmering.

Vi söker dig som har minst masterexamen i bioinformatik eller datavetenskap. Doktorsexamen eller motsvarande relevant arbetslivserfarenhet från avancerade studier inom i akademin eller industrin är meriterande. Om du dessutom har postdoktorala studier är detta en ytterligare merit.

Du har mycket god förmåga att arbeta i terminalbaserad Linux-miljö och i minst ett skriptspråk (t ex Python, Perl eller R). Erfarenhet av administration av Linuxsystem, klustermiljöer, molnberäkning, databasdesign och kliniska frågeställningar är meriterande. Vi tror att du har erfarenhet av avancerade analyser inom t ex transkriptomik, epigenetik, proteogenomik eller ”single-cell” biologi, och med fördel integrativa analyser av flera olika datatyper. God förmåga inom experimentell design, mjukvaruutveckling, eller maskininlärning är också meriterande. “Reproducerbar forskning” och “FAIR data” är centrala koncept för oss. Du talar och skriver engelska flytande, och är bra på att samarbeta och kommunicera med andra.

Anställningens omfattning
Anställningarna avser heltid och gäller tills vidare med sex månaders provanställning om inte annat överenskommits.

Tillträde
Enligt överenskommelse

Lön
Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange löneanspråk i ansökan.

Fackliga kontaktpersoner
För kontakt med fackliga kontaktpersoner se nedan.   

Ansökan
Välkommen att skicka in din ansökan med CV och personligt brev senast den 15 april 2020. Du söker denna anställning genom att klicka på knappen "Ansök" här nedan. Ansökan som inkommer efter sista ansökningsdag kommer inte att beaktas.

Lika villkor


Linköpings universitet ska fortsätta att utvecklas som en attraktiv och kreativ arbetsplats som präglas av lika villkor och arbetar därför aktivt för jämställdhet och mångfald.

Välkommen med din ansökan!


Linköpings universitet har upphandlade avtal och undanber oss direktkontakt från bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.