Bioinformatiker till framtidens kliniska diagnostik

Med forskning i framkant, modern teknik och spetskompetens bedriver Diagnostikcentrum klinisk diagnostik och forskning inom laboratoriemedicin samt bild- och funktionsmedicin. Som ett led i utvecklingen av nya analysmetoder för individanpassad behandling har Diagnostikcentrum under våren 2016 etablerat en kliniköverskridande klinisk plattform för Next Generation Sequencing (NGS) på Universitetssjukhuset i Linköping. Plattformen möjliggör utveckling av avancerad NGS-baserad genetisk diagnostik för behandlingsstyrande analyser och individanpassad behandling inom olika kliniska discipliner som till exempel mikrobiologi, farmakologi, kemi, patologi och genetik. Under 2017 utökas analysbasen till att omfatta fler analyser kopplade till bröst- och äggstockscancer, hjärt- och kärlsjukdomar, blodets koaguleringsförmåga samt resistenta bakterier som till exempel MRSA.

För att möta den tekniska utvecklingen inom NGS, det ökade antalet analyser samt förstärka kompetensen i NGS-gruppen söker vi dig som vill jobba med bioinformatik och vara del i att fortsätta utveckla NGS-plattformen.

Arbetsbeskrivning
Vi söker dig som jobbar som bioinformatiker eller motsvarande idag med ett stort intresse inom bioinformatik, NGS och metodutveckling. I tjänsten ingår att utveckla och analysera komplex genomisk data från NGS för kliniska frågeställningar. Fokus för utvecklingsarbetet är utveckling och etablering av stabila bioinformatiska processer och nya metoder i samarbete med läkare, forskare och sjukhusgenetiker från olika kliniker. Tjänsten innefattar även hantering och lagring av data samt arbete med kvalitets- och patientsäkerhetsfrågor. Inom ramen för tjänsten förväntas du även:


• Självständigt planera och utföra experiment och analysera resultat
• Leda och utföra bioinformatiska analyser av NGS-data som delprojektledare
• Presentera projekt på relevanta externa seminarier och konferenser samt vid gruppens interna möten
• Följa litteraturen inom NGS och klinisk diagnostik
• Delta i att skriva vetenskapliga publikationer av analysresultat
• Samarbeta internt i gruppen och med externa aktörer
• Hålla fokus på kvalitet- och patientsäkerhetsfrågor

Utbildning och erfarenhet
För denna tjänst krävs minst masterexamen (MSc) inom biologi (molekylärbiolog), bioinformatik eller som civilingenjör inom bioteknik eller motsvarande samt goda kunskaper i metodutveckling och erfarenhet av arbete med NGS-data.

Utöver behörighetskraven ser vi gärna att du har:


• Kunskap i att arbeta med kliniska eller diagnostiska frågeställningar
• Praktisk erfarenhet av bioinformatiska analyser i klinisk, diagnostisk eller forskningsorienterad miljö
• Praktisk erfarenhet av laboratoriearbete med NGS som till exempel bibliotekspreparation, clonal amplification, sekvensering
• Kännedom om olika NGS-kemier och sekvenseringsutrustningar som till exempel Illumina, Qiagen eller annan NGS-instrumentering

Personliga egenskaper
Som person är du initiativtagande, flexibel, serviceinriktad och kan prioritera i ditt arbete. Du har god samarbetsförmåga och kan arbeta både självständigt och i grupp samt ser möjligheter i förändringar. Du har förmåga att arbeta välstrukturerat och målmedvetet. Att arbeta kvalitetsmedvetet är en självklarhet.

Anställning och information
Tillsvidaretjänst med tillträde enligt överenskommelse.

Upplysningar om tjänsten lämnas av: 
Chef NGS-plattformen Willem de Leeuw, 070-678 64 28.
Bioinformatiker Jenny Welander, 010-103 81 56.

Facklig företrädare för Vårdförbundet Lena Tudegård, 010-103 31 63.
Facklig företrädare för Naturvetarna Anneli Nordén Björnlert, 010-103 31 63.

Ansökan
Sista ansökningsdag är den 9 april 2017.
Vi arbetar med löpande urval så skicka gärna in din ansökan så snart som möjligt.
Välkommen med din ansökan via vårt rekryteringssystem.

Om du behöver teknisk support kontakta MTIT-akuten på 010-103 30 00 under kontorstid.

Vi undanber oss vänligt men bestämt direktkontakt från bemannings- och rekryteringsföretag, som vi inte har avtal med, samt försäljare av ytterligare platsannonser.

Region Östergötland