Bioinformatiker vid avdelningen för infektionsmedicin

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens främsta lärosäten. Här finns omkring 47 000 studenter och mer än 8 800 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.


Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Jämställdhet, lika villkor och mångfald är grundläggande principer för alla delar av vår verksamhet.




Beskrivning av arbetsplatsen
CombatSepsis är ett tvärvetenskapligt nätverk som utvecklar och använder proteomik för att kartlägga det inflammatoriska svaret i sepsis, för att introducera individanpassade behandlingar för sepsis.

Forskargruppen har ett nära samarbete med BioMS, en nationell forskningsinfrastruktur inom biologisk masspektrometri och har tillgång till ett flertal moderna masspektrometrar som Oribitraps och TiMS-TOFs.
Miljön är tvärvetenskaplig med seniora forskare, postdoktorer och doktorander, med kompetens inom klinisk medicin, djurmodeller, cellbiologi, proteomik och bioinformatik.

Inom forskargruppen värnar vi om en god arbetsmiljö med respekt och omtanke i våra relationer med varandra. Vi arbetar ständigt för att skapa förutsättningar för arbetsglädje, utveckling och delaktighet för alla medarbetare.

Vi erbjuder
Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Vi har även ett flextidsavtal som skapar goda förutsättningar för balans mellan arbete och fritid. Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd vid Lunds universitet https://www.lu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss

Arbetsuppgifter och ansvarsområden
Som bioinformatiker hos oss kommer dina arbetsuppgifter att bestå av att utveckla nya arbetsflöden inom bioinformatik för att bearbeta och analysera data inom biologiska masspektrometri. Huvudsakliga arbetsuppgifter inkluderar drift och utveckling av nya analysverktyg för att genomföra storskalig analys av proteomik data samt att skapa nya algoritmer och prediktiva modeller för att förbättra behandling av sepsis patienter.

Du kommer också att etablera och underhålla data managementsystem (openBIS) samt kontrollfunktioner av arbetsflöden (gc3pie/applicake).

Kvalifikationer
Krav för anställningen är:

- Lägst Fil.kand. examen i bioinformatik eller i närliggande ämnesområden.
- Erfarenhet av Python programmering.
- Erfarenhet av Linux systemadministration (Ubuntu).
- Databaserfarenhet, helst inom postgresql.
- Erfarenhet av programmen C++ och Rust.
- Erfarenhet av storskaliga beräkningssystem (”cloud computing”).
- Erfarenhet av vetenskapligt användarstöd inom bioinformatik.
- Erfarenhet av beräkningsbiologi.

Personliga egenskaper som vi värderar högt i samband med denna tjänst är att du är noggrann, ambitiös och har stor social kompetens samt goda kommunikativa egenskaper.  

Meriterande för anställningen är:

- Erfarenhet av proteomik data.
- Kunskap inom infektionssjukdomar.

Övrigt
Anställningen är på 100 % och tillsvidare. Önskat startdatum är den 19 september 2024, eller enligt överenskommelse.

Så här söker du
Anställningen söks via universitetets rekryteringssystem. Ansökan ska innehålla personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter. Ansökan ska även innehålla CV, examensbevis eller motsvarande samt övrigt som du önskar åberopa (kopior av betyg, uppgifter till referenser, rekommendationsbrev etc.)

 

Varmt välkommen med din ansökan!

Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 2700 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.

Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.