Bioinformatiker vid Laboratoriemedicin, Umeå

Storskalig sekvensering tillsammans med andra nya molekylära tekniker gör snabbt insteg i klinisk verksamhet och forskning. De etableras som viktiga verktyg för diagnostik av ärftliga sjukdomar och som vägledning för cancerdiagnostik och -behandling. Teknikerna är avhängiga bioinformatisk metodik, ett fält som mognat men fortfarande utvecklas starkt.
Vi söker dig som vill applicera bioinformatiska färdigheter på kliniskt meningsfulla frågor.
Anställningen är placerad inom Laboratoriemedicin, Norrlands Universitetssjukhus.
Genom samfinansiering planeras anställningen omfatta 50 % arbete för forskargrupper vid Institutionen för medicinsk biovetenskap, Umeå Universitet och 50 % vid Laboratoriemedicin.


ARBETSUPPGIFTER
Som bioinformatiker förväntas du analysera storskaliga sekvensdata (Next Generation Sequencing, NGS) /Massive parallell sequencing, MPS), arraydata och expressionsdata inom forskning och klinik. Du kommer att arbeta med forskargrupper inom Institutionen för medicinsk biovetenskap samt i ett kliniskt diagnostiskt team bestående av läkare, sjukhusgenetiker och biomedicinska analytiker. I båda miljöerna finns god kompetens inom molekylärbiologi, humangenetik och klinisk diagnostik. Dina huvudsakliga arbetsuppgifter är att skapa och utveckla bioinformatiska flöden, analysera olika typer av rådata och fungera som en kompetensresurs. Etablerande av automatiserade arbetsflöden och installation/underhåll av programvara med öppen källkod ingår i arbetsuppgifterna.





KVALIFIKATIONER

Doktorsexamen i för anställningen lämpligt ämne [t.ex. bioinformatik, bioteknik, molekylärbiologi, genetik, genomik, biomedicin, matematik/statistik].
Stor vikt läggs vid personliga egenskaper såsom kommunikativ och pedagogisk förmåga. Vi söker dig som har ett stort driv att arbeta självständigt och samtidigt god förmåga att bidra i ett team. Vi ser gärna att du bedriver egen forskning.



Det är en fördel om du har grundläggande kunskaper inom medicinsk/klinisk genetik samt tidigare erfarenhet av storskalig DNA-sekvensering. Du har kunskap om och erfarenhet av bioinformatisk analys, programvaror och dataformat samt förmåga att automatisera datoranalysuppgifter genom färdigheter i något eller några programmeringsspråk. På sikt kan arbete med data från stordatormiljö bli aktuellt, vana vid hantering av större datamängder är därför också erfarenheter som värdesätts.