Biträdande forskare

Göteborgs universitet möter samhällets utmaningar med mångsidig kunskap. 53 300 studenter och 6 500 medarbetare gör universitetet till en stor och inspirerande arbetsplats. Stark forskning och attraktiva utbildningar lockar forskare och studenter från hela världen. Med ny kunskap och nya perspektiv bidrar Göteborgs universitet till en bättre framtid.

På institutionen för biomedicin bedrivs forskning och undervisning inom prekliniska och kliniska medicinska ämnen. Institutionen är indelad i följande fyra avdelningar: infektionssjukdomar, mikrobiologi och immunologi, medicinsk kemi och cellbiologi samt laboratoriemedicin. För närvarande har institutionen cirka 360 medarbetare och cirka 440 Mkr i omsättning.

Att klassificera mikroorganismer taxonomiskt är centralt både inom medicinska tillämpningar och för bevarande av biodiversitet. Det senaste årtiondet har mängden sekvensdata för taxonomisk klassificering exploderat. Detta medför dock att det inte längre är görbart att manuellt hantera och kvalitetsgranska all denna data. Mjukvaran MetaxaQR är tänkt att introducera automatiska kvalitetskontroller för sekvensdata. Projektet kommer innebära att arbeta för att färdigställa denna programvara för taxonomisk analys.

Arbetsuppgifter
Den anställda förväntas utföra tre huvuduppgifter: 1) Koppla samman gammal kod från tidigare versioner av Metaxa med ny kod. 2) Skapa nya databaser för MetaxaQR utifrån resurser såsom SILVA, UNITE och Metaxa2’s databaser. 3) Dokumentera arbetet och framställa utkast till en vetenskaplig artikel som beskriver programvaran och dess databaser.

Kvalifikationer
Examen inom relevant ämne (t.ex. molekylärbiologi, biomedicin, bioinformatik, statistik, datavetenskap). Dokumenterad erfarenhet av bioinformatiskt arbete är ett krav för tjänsten, liksom tidigare erfarenhet av taxonomisk data och biologiska databaser. God förtrogenhet med Python och viss erfarenhet av Perl är en förutsättning för tjänsten. Tidigare arbete med taxonomiska verktyg som Metaxa2, Mothur eller QIIME är meriterande. Särskilt meriterande är direkt erfarenhet av att behandla data från SILVA och UNITE-databaserna, samt erfarenhet av tidigare versioner av Metaxa.

Anställning
Anställningen är på heltid och tidsbegränsad, 5 månader, med placering på institutionen för biomedicin. Tillträde sker enligt överenskommelse.

Kontaktuppgifter för anställningen
Har du frågor om anställningen är du välkommen att kontakta forskarassistent Johan Bengtsson-Palme, e-post: johan.bengtsson-palme@gu.se

Fackliga organisationer
Fackliga företrädare vid Göteborgs universitet hittar du här: https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/hjalp-for-sokande

Ansökan
Du söker anställningen via Göteborgs universitets rekryteringsportal genom att klicka på knappen "Ansök". Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Ansökan ska vara inkommen senast: 2021-09-16

Universitetet arbetar aktivt för en arbetsmiljö med jämställda förhållanden och sätter värde på de kvalitéer mångfald tillför verksamheten.

Universitetet tillämpar individuell lönesättning.

Enligt Riksarkivets föreskrifter är universitetet skyldigt att förvara ansökningshandlingar i två år efter tillsättningsbeslutet. Om du som sökande till en anställning särskilt begär tillbaka dina handlingar återsänds de när de två åren har förflutit, i annat fall kommer de att gallras ut.


Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Göteborgs universitet anlitar upphandlad annonsbyrå i samband med rekrytering av personal. Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av jobbannonser.