Doktorand Epigenetic regulation

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens 100 främsta lärosäten. Här finns cirka 44 000 studenter och mer än 8 000 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.


Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 2700 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.



Forskargruppen

Vid forskargruppen för Molekylär Neurogenetik bedrivs forskning om hjärnans utveckling och dess relation till sjukdomar.

Forskningen har sedan flera år legat i framkant inom området epigenetik. Gruppen leds av professor Johan Jakobsson och består av både forskande och teknisk personal. Verksamheten är lokaliserad på Biomedicinskt centrum i Lund. Här kan du läsa mer om vår spännande forskning: https://www.molecular-neurogenetics.lu.se/

Inom forskargruppen värnar vi om en god arbetsmiljö med respekt och omtanke i våra relationer med varandra. Vi arbetar ständigt för att skapa förutsättningar för arbetsglädje, utveckling och delaktighet för alla medarbetare.

Vi söker härmed en driven doktorand för arbete med ett projekt som syftar till att studera molekylära mekanismer som ligger till grund för reglering av epigenetiskt transponerbara element i mänskliga celler, och hur detta påverkar människors hälsa och sjukdom. Anställningen är på heltid under 4 år med önskat tillträdesdatum den 2021-09-01 eller enligt överenskommelse.

Arbetsuppgifter

Som doktorand inom forskargruppen kommer du delta i ett projekt som omfattar analys av CUT & RUN / Tag, RNA-seq, ChIP-seq och proteomic datasets. Nya bioinformatiska verktyg för att studera epigenetisk TE-reglering kommer att utvecklas, inklusive sekvenseringstekniker. Slutligen kommer projektet att stödja utformningen av CRISPR-baserade genetiska metoder för att tysta eller aktivera hela TE-familjer.

Tjänsten kommer att inkludera deltagande vid internationella konferenser.

Kvalifikationer
För anställningen krävs:

- Masterexamen i bioinformatik 
-Erfarenhet att analysera sekvenseringsdata för transposabla element med bioinformatiska verktyg (TEtranscripts, DEseq2, SEACR, deepTools)
- Dokumenterad erfarenhet att arbeta tillsammans i en teammiljö

Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper. Arbetsuppgifterna kräver att du är flexibel.

Meriterande för anställningen är:

- Erfarenhet av analys av CUT & RUN / Tag epigenomisk profildata

- Förståelse av utmaningar förknippade med kartläggning av repetitiva element som LINE-1-retrotransposoner och endogena retrovirus (ERV)

- Kunskap om R / Python

- Erfarenhet att studera cellulära modeller av mänsklig neural utveckling

- Grundkunskap om TE-utveckling i högre primater

Instruktioner för ansökan

Ansökan ska innehålla ett personligt brev där du beskriver hur du uppfyller eftersökta kvalifikationer, ett CV samt examensbevis

Övrigt

Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.


Behörighet

Grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå har den som har: avlagt examen på avancerad nivå, fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Bedömningsgrund

Bestämmelser för anställning som doktorand återfinns i förordning SFS 1998:80. Som innehavare får enbart förordnas den som är antagen till utbildning på forskarnivå. Vid tillsättning skall avseende främst fästas vid graden av förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildningen. Förutom skyldighet att ägna sig åt egen forskarutbildning kan innehavaren åläggas att fullgöra tjänstgöring som avser utbildning, forskning och administrativt arbete enligt särskilda bestämmelser i förordningen.

Villkor

Tidsbegränsad anställning fyra år enligt HF 5 kap 7§.

 

Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Vi ser jämställdhet och mångfald som en styrka och tillgång. Välkommen med din ansökan! Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.