Doktorand i beräkningsbiologi och bioinformatik

Göteborgs universitet möter samhällets utmaningar med mångsidig kunskap. 53 300 studenter och 6 500 medarbetare gör universitetet till en stor och inspirerande arbetsplats. Stark forskning och attraktiva utbildningar lockar forskare och studenter från hela världen. Med ny kunskap och nya perspektiv bidrar Göteborgs universitet till en bättre framtid.

Vi söker en doktorand för att gå med i vår nya grupp vid institutionen för kemi och molekylärbiologi & Wallenbergs centrum för molekylär och translationell medicin vid Göteborgs universitet.

Glykaner eller komplexa kolhydrater utgör kapslarna av bakterier, svampar, såväl som växtceller, och pryder alla typer av andra biomolekyler som proteiner, lipider eller RNA. Den specifika glycansekvensen som är fysiskt bunden till ett protein förändrar i grunden dess egenskaper och kapacitet, finjusterande stabilitet, struktur och funktion. Vi har nyligen visat att - med hjälp av maskininlärning - kan denna rika information utnyttjas för att förutsäga glykanegenskaper och i sin tur egenskaper hos organismer som uppvisar dessa glykaner, vilket öppnar potentialen för glykobiologi för att underlätta en ny förståelse av biologi och möjliggöra framtida biomedicinska terapier.

I det här projektet kommer vi att etablera en plattform som förutsäger glycan-repertoarer av biologiska system och analyserar glycan-funktioner. Detta kräver framsteg inom toppmodern maskininlärning, bioinformatik såväl som systembiologi och kommer att omvandla glykobiologi till en verklig högkapacitetsdisciplin. Att upptäcka den invecklade roll som glykaner spelar i biologin kommer inte bara att möjliggöras av denna bedrift utan kommer att ledas till att utnyttja deras potential för biomedicinska ändamål.

Arbetsuppgifter
Den framgångsrika kandidaten kommer att utforma, utveckla och tillämpa algoritmer som härrör från toppmodern maskininlärning och / eller bioinformatik för att utnyttja systembiologidata för att förutsäga glycan-repertoarer av flera biologiska system och utnyttja dem för att få biologisk insikt. Arbetsuppgifter inkluderar, men är inte begränsade till, bearbetning och analys av systembiologiska data (t.ex. genomik / transkriptomik), algoritmutveckling och konstruktion samt analys av relevanta modeller. Projektet kommer att kräva omfattande återkoppling med experimentell datainsamling, så en tillräcklig förståelse av nödvändiga tekniker och effektiv kommunikation med de ansvariga kommer att vara avgörande för projektets framgång.

Behörighet
Grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå har den som:
1. avlagt examen på avancerad nivå, eller
2. fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. på annat sätt inom eller utom landet förvärvat motsvarande kunskaper.

Särskild behörighet:
1. avlagt examen på avancerad nivå i relevant* naturvetenskapligt ämne, eller
2. fullgjort kursfordringar om minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå i relevanta* naturvetenskapliga ämnen, eller
3. på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper relevanta för den planerade utbildningen.* Relevant för den planerade utbildningen på forskarnivå

Bedömningsgrund
Urval bland sökande som uppfyller krav på grundläggande och särskild behörighet baseras på förmågan att tillgodogöra sig utbildningen på forskarnivå. Vid bedömningen fästs särskild vikt vid dokumenterade kvalifikationer avseende:

- erfarenhet av beräkningsarbete

- kunskaper om Python, R eller annat programmeringsspråk som är relevant för beräkningsbiologi

Anställning
Anställningsform: Tidsbegränsad anställning, fyra år

Omfattning: 100 %

Placering: Inst. för Kemi och molekylärbiologi, Göteborg

Tillträde: Snarast enligt överenskommelse

Bestämmelser för anställning som doktorand återfinns i förordning SFS 1998:80.

Universitetet tillämpar lokalt avtal om lönesättning av doktorander.

Tillsättningsförfarande
Registrera din ansökan elektroniskt www.gu.se/ledigaanstallningar.

Kontaktuppgifter för anställningen
Daniel Bojar: daniel@bojar.net

Ansökan

Du hittar fullständig annons och ansöker om att till att bli antagen till forskarstudier via Göteborgs universitets rekryteringsportal, www.gu.se/ledigaanstallningar genom att klicka på knappen ”Ansök”. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.
Ansökan ska vara inkommen senast: 2021-04-21

 


Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Göteborgs universitet anlitar upphandlad annonsbyrå i samband med rekrytering av personal. Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av jobbannonser.