Doktorand i bioinformatik (A)

vid Institutionen för biokemi och biofysik. Sista ansökningsdag: 2018-09-21.

Projektbeskrivning
Dina studier på forskarnivå inom biokemi med inriktning mot bioinformatik kommer att bedrivas inom projektet: Djupinlärning för förutsägande av proteinstrukturer. Projektledare: Arne Elofsson, arne@bioinfo.se, webbsida: www.bioinfo.se.

Djupinlärning är en gren av maskininlärning baserad på en uppsättning av algoritmer som försöker att modellera data på en hög abstraktionsnivå. Här kombineras olika modellarkitekturer, med komplexa strukturer, som består av flera icke-linjära transformationer. Användningen av djupinlärning har revolutionerat maskininlärning, men hittills endast använts i några få biologiska tillämpningar.

I det här projektet vill vi använda djupinlärningsmetod för att förutsäga olika aspekter av proteinstrukturer, inklusive (men inte begränsat till) modellkvalitetsbedömning, kontaktförutsägelser och sekundärstrukturförutsägelse. För en översikt över vårt arbete, se bioinfo.se/papers/.

Sökande med en bakgrund i matematik, datalogi eller bioinformatik är lämpade att söka. Programmeringserfarenhet är viktigt och ett generellt intresse i vetenskapliga frågeställningar är avgörande.

Behörighetskrav
Grundläggande behörighet har den som avlagt examen på avancerad nivå, fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller på annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

För särskild behörighet se länk till fullständig annons nedan.

Behörigheten ska vara uppfylld senast sista ansökningsdag.

Urval
För urval se länk till fullständig annons nedan.

Anställningsvillkor 
Som doktorand får endast den anställas som antas eller redan är antagen till utbildning på forskarnivå vid en högskola.

En ny anställning som doktorand gäller för högst ett år. Anställningen får förnyas med högst två år i taget. Den sammanlagda anställningstiden får dock inte vara längre än vad som motsvarar fyra års studier på heltid.

Den som är anställd som doktorand ska främst ägna sig åt sin egen utbildning på forskarnivå, men får arbeta högst 20 % med utbildning, forskning och administration.

Observera att beslut om anställning som doktorand inte kan överklagas.

Stockholms universitet strävar efter att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika möjligheter för alla.

Kontakt
Mer information angående projektet kan fås från projektledaren, se även annonsen på engelska.

Allmän information angående forskarutbildningen kan fås från studierektor, Pia Ädelroth, pia.adelroth@dbb.su.se, eller prefekten, Lena Mäler, lenam@dbb.su.se.


Fackliga företrädare
Ingrid Lander (Saco-S), tfn 0708-16 26 64, saco@saco.su.se, Lisbeth Häggberg (Fackförbundet ST och Lärarförbundet), tfn 08-16 20 00 (vx), seko@seko.su.se (SEKO), samt doktorandrepresentant, doktorandombud@sus.su.se.

Ansökan
Du söker doktorandplatsen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Anvisningar för sökande finns på webbsidan: anvisningar – sökande.

OBS! Den fullständiga annonsen hittar du på www.su.se/jobb under Doktorandplatser.

Välkommen med din ansökan!


Stockholms universitet – forskning, utbildning och samverkan i den internationella frontlinjen.