Doktorand i biokemi med särskild inriktning mot bioinformatik (D)

vid Institutionen för biokemi och biofysik. Sista ansökningsdag: 2018-11-05.

Projektbeskrivning
Dina studier på forskarnivå inom biokemi med inriktning mot bioinformatik kommer att bedrivas på Science for Life Laboratory inom projektet Nätverksinferens och pathwayanalys. Projektledare: Erik Sonnhammer, erik.sonnhammer@scilifelab.se.

Cellulära mekanismer är beroende av det komplexa samspelet mellan proteiner, gener, metaboliter, och andra komponenter som utgör en levande cell. Målet med detta projekt är att utveckla beräkningsalgoritmer och metoder som använder high-throughput biologisk data för att bygga nätverk med information om hur dessa komponenter samverkar med varandra. Detta görs med systembiologiska tekniker som att bygga globala nätverk av funktionell koppling (se FunCoup.sbc.su.se/) och inferens av genereglernätverk från genuttrycksdata efter perturbationer. Det finns ett överlapp mellan dessa typer av nätverk som kommer att utnyttjas i syfte att förbättra kvaliteten och användbarheten av båda. Metoderna inkluderar regressionsmodeller, Bayesiansk integrering, olika statistiska analyser och egenutvecklade modelleringstekniker. I FunCoup kombineras heterogena publika datakällor för att förutsäga funktionell koppling mellan proteiner för att bygga globala nätverk av funktionell koppling. Projektet omfattar programmering, dataanalys, benchmarking, modellering, samt tillämpning av de utvecklade metoder på experimentella data som genereras av gruppen.

Behörighetskrav
Grundläggande behörighet har den som avlagt examen på avancerad nivå, fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng (hp), varav minst 60 hp på avancerad nivå, eller på annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

För särskild behörighet se länk till fullständig annons nedan.

Behörigheten ska vara uppfylld senast sista ansökningsdag.

Urval
För urval se länk till fullständig annons nedan.

Anställningsvillkor 
Som doktorand får endast den anställas som antas eller redan är antagen till utbildning på forskarnivå vid en högskola.

En ny anställning som doktorand gäller för högst ett år. Anställningen får förnyas med högst två år i taget. Den sammanlagda anställningstiden får dock inte vara längre än vad som motsvarar fyra års studier på heltid.

Den som är anställd som doktorand ska främst ägna sig åt sin egen utbildning på forskarnivå, men får arbeta högst 20 % med utbildning, forskning och administration.

Observera att beslut om anställning som doktorand inte kan överklagas.

Stockholms universitet strävar efter att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika möjligheter för alla.

Kontakt
Mer information angående projektet kan fås från projektledaren, se även annonsen på engelska.

Allmän information angående forskarutbildningen kan fås från studierektor, Pia Ädelroth, pia.adelroth@dbb.su.se, eller prefekten, Lena Mäler, lenam@dbb.su.se.

Fackliga företrädare
Ingrid Lander (Saco-S), tfn 0708-16 26 64, saco@saco.su.se, Lisbeth Häggberg (Fackförbundet ST och Lärarförbundet), tfn 08-16 20 00 (vx), seko@seko.su.se (SEKO), samt doktorandrepresentant, doktorandombud@sus.su.se.

Ansökan
Du söker doktorandplatsen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Anvisningar för sökande finns på webbsidan: anvisningar – sökande.

OBS! Den fullständiga annonsen hittar du på www.su.se/jobb under Doktorandplatser.

Välkommen med din ansökan!


Stockholms universitet – forskning, utbildning och samverkan i den internationella frontlinjen.