Doktorand i biologi med inriktning ekologi

Institutionen för vatten och miljö
Institutionen för vatten och miljö (www.slu.se/vatten-miljo) är ett kompetenscentrum för tillämpad miljöforskning med ett nationellt ansvar för övervakning av miljötillståndet i svenska sjöar och vattendrag med avseende på vattenkemi, miljöförorening och akvatisk biota. Forskningen vid institutionen fokuserar på geokemiska och hydrologiska processer, akvatisk ekologi och biodiversitet, samt akvatisk ekotoxikologi och miljökemi. Institutionen har drygt 130 anställda varav ca hälften utgörs av forskare/doktorander och den andra hälften av teknisk och administrativ personal. Vi ingår i SLU:s Mark-Vatten-Miljöcentrum på Campus Ultuna i Uppsala. Den breda kompetensen bland de 300 personerna i klustret i kombination med en välutrustad infrastruktur skapar en unik plattform för forskning av hög kvalitet samt miljöövervakning och utvärdering. Detta doktorandprojekt kommer att höra under sektionen för ekologi och biodiversitet i gruppen för funktionell mikrobiell ekologi

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom SLU på www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/

Viruspåverkan på sjöarnas växtplankton
Eutrofiering och ökande näringstillförsel är ett växande hot mot ett hållbart användande av våra sjöar och andra ytvatten. Denna påverkan kan leda till förhöjd produktion av växtplankton och skadliga algblomningar. Även om det är relativt väl studerat hur växtplankton svarar på denna typ av näringstillförsel har vi bristfällig kunskap om bildningen av algblomningar och de processer som leder till att de så småningom försvinner. Växtplankton påverkas och kan infekteras av olika parasiter såsom chytrid-svampar och virus, men hur dessa interaktioner påverkar växtplankton är inte tillräckligt utforskat. Man vet att denna typ av infektioner kan avsluta algblomningar inom bara ett par dagar och att de kan styra växtplanktonens populationsstorlek, dynamik och mångfald. Doktorandprojektet kommer att ha fokus på hur parasitiska interaktioner (främst virusinfektioner) påverkar växtplanktonblomningar i sötvatten och växtplanktonens dynamik och funktion. För att lära oss mer om dessa interaktioner på genetisk och cellulär nivå använder vi odlade modellsystem med virus och växtplankton, storskaliga sekvenseringstekniker (metagenomik, metatranskriptomik) och olika typer av experimentsystem på lab och i fält.

Innehållsbeskrivning:
Vi söker en doktorand som ska arbeta både laborativt och med bioinformatisk analys av stora dataset. En stor del av projektet kommer att innefatta metagenomisk och metatranskriptomisk analys av interaktioner mellan växtplankton och virus, men doktorandprojektet inkluderar även fältarbete med provtagning av sjöar, provberedning, och genomförandet av kontrollerade experiment i laboratoriemiljö samt användandet av en rad analytiska metoder, biostatistik och kommunikation av forskningsresultat i tal och skrift.

Kvalifikationer:
Krav: Mastersexamen (eller motsvarande) med specialisering i mikrobiologi, mikrobiell ekologi, molekylärbiologi, bioinformatik eller närliggande område. Ett brinnande intresse för mikrobiell ekologi och mikrobiella interaktioner. Analytisk förmåga och förmåga att kommunicera professionellt på engelska.

Önskvärt: Personlig lämplighet för arbetsuppgifterna, god samarbetsförmåga men även förmåga att arbeta självständigt och i grupp. Ett flexibelt synsätt och problemlösande förmåga kommer att beaktas vid utvärdering av sökande. Det är också önskvärt att man har:


• Dokumenterad erfarenhet av dataanalys och programmering (Unix, Python, R)
• Erfarenhet av att isolera och odla olika typer av mikroorganismer
• Molekylärbiologiska färdigheter
• Erfarenhet av vetenskaplig publicering

Placering:           
Uppsala

Försörjningsform:
Anställning som doktorand (4 års utbildning)

Omfattning:
100%

Tillträde:
2022-10-15 eller enligt överenskommelse.

Ansökan
Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen senast den 2022-08-31.

Ansökan ska innehålla följande:


• Ett personligt brev med en kortfattad beskrivning av utbildnings och forskningsbakgrund, motivering till varför man söker just denna tjänst och hur projektet och forskarutbildningen passar ihop med  sökandens långsiktiga karriärplan.
• En meritförtäckning / curriculum vitae som inkluderar utbildning, forskningsprofil, meriter, anställningar och annan relevant information.
• En elektronisk kopia av examensarbetet och en publikationslista med rapporter, artiklar, populärvetenskapliga skrifter eller annat skrivet material).

Ansökningshandlingarna ska vara på engelska. Personliga intervjuer kommer att vara en viktig del i rekryteringsprocessen.

För att vara behörig till utbildning på forskarnivå krävs avlagd examen på avancerad nivå eller minst fyra års heltidsstudier varav minst ett år på avancerad nivå.

Urval bland de behöriga sökande baseras på: skriftlig ansökan inklusive meritförteckning; examensarbete, kopior av examensbevis och registerutdrag från tidigare studier på grund- och avancerad nivå vid universitet eller högskola, två personliga referenser, kunskaper i engelska. Mer information om krav på engelska kunskaper finns på följande sida:
www.slu.se/utbildning/program-kurser/forskarutbildning/nya-doktorander-sokes/krav-pa-engelskakunskaper/

Observera att den/de sökande som blir kallade till intervju ska lämna in vidimerade kopior av examensbevis och registerutdrag från tidigare studier på grund- och avancerad nivå vid universitet eller högskola, samt att de sökande som har utländskt medborgarskap också ska lämna in en vidimerad kopia av den sida i passet som innehåller foto och personinformation.

Läs mer om SLU:s forskarutbildning på www.slu.se/utbildning/program-kurser/forskarutbildning/

Fackliga kontaktpersoner:
https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/



Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) är ett universitet i internationell toppklass med forskning, utbildning och miljöanalys inom vetenskaper för hållbart liv. Huvudorter är Alnarp, Umeå och Uppsala, men verksamhet bedrivs också på forskningsstationer, försöksparker och utbildningsorter i hela landet. Hos oss samlas människor med olika perspektiv men med det gemensamma målet att skapa de bästa förutsättningarna för en hållbar, levande och bättre värld.

SLU har drygt 3000 medarbetare, 5000 studenter och forskarstuderande och en omsättning på över tre miljarder kronor. Universitetet satsar på attraktiva miljöer på sina campusområden.

www.slu.se