OBS! Ansökningsperioden för denna annonsen har
passerat.
Arbetsbeskrivning
Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra långsiktig skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har drygt 54 000 studenter, mer än 7 500 anställda och en omsättning på cirka 8 miljarder kronor.
Vid forskningsområdet radiologi bedrivs utbildning och forskning med huvudinriktningen diagnostik och intervention med radiologiska metoder.
Ämnet innefattar såväl kliniska som experimentella studier. I dessa studier används röntgenstrålning, magnetisk resonanstomografi och ultraljud.
Ett projekt vid enheten rör studier av diabetes med hjälp av avancerade bildanalystekniker. Dessa tekniker kan integrera bildinfomationen med tex klinisk eller genetisk information. Projektet har den engelska titeln: Large-scale Imaging Studies of Associations and Causality of Body Composition in Relation to Type 2 Diabetes och kommer att genomföra inom den nystartade forskarskolan inom Uppsala Diabetes Center, UDC (https://www.uu.se/forskning/udc/) och inkludera bilddata och annan studiedata från UK Biobank (https://www.ukbiobank.ac.uk/), och SCAPIS (http://www.scapis.org) samt en systerstudie till SCAPIS som kallas IGT-Microbiota-studien.
https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/
Arbetsuppgifter
Du kommer arbeta i projektet ovan med metoder för automatiserad analys av CT och helkropps MRI data från tre storskaliga studier att både appliceras och vidareutvecklas. I analyserna kommer du att fokusera på att studera kopplingar mellan bilddata och icke-bilddata (som tex blodglukosdata samt genetik) som är relevant för typ 2 diabetes (T2D). I projektet kommer du få nyttja metoder som vi tidigare utvecklat och använt i forskargruppen (Imiomics, djupinlärning, och så kallad kohort-saliency-analys). Du kommer även att få vara en del av att utveckla metoderna vidare för att även kunna identifiera kausala samband mellan bilddata och T2D.
Genom detta kommer du få hjälpa till med att besvara projektets frågeställningar:
- Hur är kroppssammansättning kopplad till T2D och mått på glukosmetabolism?
- Hur bra kan bilddata ensamt eller i kombination med icke-bilddata förutsäga vem som redan har eller kommer att utveckla T2D och vilka kroppsegenskaper är viktigast för dessa förutsägelser?
- Är genetiken för T2D kausalt kopplad till kroppens sammansättning?
- Är kroppens sammansättning kausalt kopplad till T2D?
I anställningen ingår kurser och maximalt 20 % institutionsarbete.
Kvalifikationskrav
Den sökande ska ha en masterexamen inom relevant område. Vi söker en person som både är intresserad av att använda nuvarande tekniker för att besvara medicinska frågeställningar såväl som att vidareutveckla teknikerna.
Den sökande förväntas undervisa på svenska eller engelska. Flytande engelska i både tal och skrift är ett krav.
Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i https://regler.uu.se/?languageId=3.
Önskvärt/meriterande i övrigt
En gedigen bakgrund inom medicinsk bildbehandling och analys, bioinformatik, biomedicin eller medicin är meriterande. Det är även meriterande med kunskap i diabetes, genetik och statistiska analyser med hjälp av exempelvis Stata, R eller liknande.
Om anställningen
Anställningen är tidsbegränsad, enligt HF 5 kap § 7. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala
Upplysningar om anställningen lämnas av: Joel Kullberg, mailto:joel.kullberg@surgsci.uu.se
För frågor om anställningsförfarandet, kontakta personalsamordnare Karin Johansson, mailto:karin.m.johansson@uu.se
Välkommen med din ansökan senast den 15 augusti 2022, UFV-PA 2022/2707
Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.
Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.