Doktorand i evolutionär genomik

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 40.000 studenter, 7.000 anställda och en omsättning på 6,5 miljarder kronor.



Institutionen för ekologi och genetik är en internationell miljö med drygt 200 medarbetare.

Vid Institutionen bedrivs forskning och undervisning i skärningspunkten mellan ekologi, evolution och genomik. Vi driver ett flertal framgångsrika forskningsprojekt med fokus på naturlig och sexuell selektion, molekylär evolution, artbildning, mikrobiell diversitet och ekosystemprocesser. Vår forskning belyser grundläggande såväl som tillämpade aspekter, såsom bevarandebiologi och effekter av globala miljöförändringar. Vårt arbete bedrivs i fält och laboratorier såväl som genom storskaliga analyser av genom. Vår forskning är organiserad inom programmen zooekologi, evolutionsbiologi, limnologi, samt växtekologi och evolution.

Projektbeskrivning: Sedan växter började leva på land har arbuskulära mykorrhizasvampar (AM) bildat symbiotiska interaktioner med deras rötter. Doktorandprojektet är del av ett nytt forskningsprogram med mål att förstå evolution och ekologi hos dessa viktiga organismer. Genom att använda den senaste sekvenseringsteknologin, som PacBio sekvensering och enkelcellsgenomik, kommer projektet kartlägga genomorganisation hos en grupp AM svampar,Claroideoglomus spp. Specifikt kommer projektet att testa hypotesen att genetiskt distinkta kärnor samexisterar inom individer av AM svampar. Projektet omfattar odling av AM svampar, DNA extraktion från sporer, sortering och genotypning av kärnor från enskilda svampisolat. Även analys av genom och metagenom samt mätningar av genomstorlekar ingår.

Doktoranden kommer att vara del i ett forskningsteam som leds av Anna Rosling (http://www.ieg.uu.se/evolutionary-biology/rosling/research/) i samarbete med Hanna Johannesson (http://www.iob.uu.se/research/systematic-biology/johannesson/) vid Evolutionsbiologiskt Centrum (EBC), Uppsala Universitet och Jim Bever vid University of Kansas (https://eeb.ku.edu/james-bever). Projektet kommer delvis att utföras vid plattformen för mikrobiell enkelcellsgenomik vid SciLife Lab i Uppsala (https://www.scilifelab.se/facilities/single-cell/).

Kvalifikationskrav: Kandidaten ska ha en masterexamen och ska ha gjort ett masterexamensarbete i molekylärbiologi. Erfarenhet av jämförande genomik och särskilt arbete med svampgenom är meriterande. Kandidaten ska kunna arbeta både självständigt och som en del i ett team, och ha en god förmåga att uttrycka sig väl i tal och skrift på engelska.

Anställning:
Innehavare av doktorandanställning skall främst ägna sig åt egen forskarutbildning. Övrig tjänstgöring vid institutionen, som avser utbildning och administrativt arbete kan ingå inom ramen för anställningen (max 20 %). För anställning som doktorand krävs att innehavaren är antagen eller kommer att antas till forskarutbildning, där graden av förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildningen är avgörande. Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer http://regler.uu.se/. Lokala riktlinjer finns fastställda för löneinplacering. Mer information om forskarutbildning finns under http://www.teknat.uu.se/utbildning/forskarniva/

Ansökningsförfarande: Ansökan ska innehålla ett brev där den sökande kort beskriver sig själv och sina forskningsintressen (en A4-sida) och kontaktuppgifter till två referenspersoner. Ansökan ska dessutom innehålla CV, kopior av examensbevis eller intyg om avslutat examensarbete, examensarbete och övriga handlingar som sökanden önskar åberopa.

Uppsala universitet värdesätter de kvaliteter som jämn könsfördelning och mångfald tillför verksamheten. Vi ser därför gärna sökande av alla kön och med olika födelsebakgrund, funktionalitet och livserfarenhet.

Lön: Lokala riktlinjer finns fastställda för löneplacering.

Tillträde: Snarast, tidsbegränsad anställning 4 år.

Anställningens omfattning: 100 %

Upplysningar om anställningen lämnas av
Anna Rosling, 018-471 64 44, Anna.Rosling@ebc.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast 28 juni 2016. UFV-PA 2016/1762.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.