Doktorand i fysik (MSCA project SPIDoc’s)

Doktorand i fysik med inriktning mot fotonmateriainteraktion

"SPIDoc's – The next generation MS SPIDoc's" finansieras inom Marie Skÿodowska-Curie Actions, sammansatt av 7 bidragsmottagare och 8 associerade partners i 8 länder, inom akademin och näringslivet.

SPIDocs projektet kommer att tillämpa banbrytande teknologier, som inbyggd masspektrometri (MS), röntgenstrålar för enkelpartikelavbildning (SPI) och molekyldynamiksimuleringar för att förstå dynamiken hos biomolekyler. Varje SPIDocs doktorand kommer att under en eller flera perioder utstationeras på andra orter inom nätverket, vilket möjliggör ett internationellt och tvärvetenskapligt utbyte. Läs mer: https://www.ms-spidoc.eu/spidocs/

Forskningen som bedrivs vid institutionen för fysik och astronomi omfattar ett brett spektrum av fysikämnen, fördelade på nio avdelningar. Läs mer på http://www.physics.uu.se

Avdelningen för röntgen fysik är världsledande när det gäller användningen av avancerade spektroskopimetoder. I denna avdelning ingår forskningsprogrammet kemisk och biomolekylär fysik, som värd för projektet har ett särskilt fokus på de grundläggande egenskaperna och ultrasnabba processerna i atomer, molekyler, kemiska system och proteiner.

Om projektet
De nya högenintensiva kortpulsiga röntgenkällor som sedan 10 år finns tillgängliga, röntgenlasrar, har öppnat upp för SPI med hjälp av röntgen. Att eliminera behovet av kristalliserade prover möjliggör studier av molekylstrukturer som tidigare varit svåra eller omöjliga att bestämma. Även om denna teknik redan visar ett betydande framsteg, måste vissa hinder övervinnas innan SPI kan nå sin fulla potential. Ett sådant problem är att bestämma provets rumsliga orientering vid tidpunkten för röntgeninteraktion. Simuleringar har förutspått att orienteringen av proteinet vid det ögonblick då det exponeras för röntgenpulsen kan bestämmas genom att kartlägga fördelningen av de utstötta jonerna när provet genomgår en Coulomb-explosion efter den intensiva joniseringen. Genom att mäta joner från det fragmenterade provet bör orienteringen av originalprovet vara möjlig att bestämma. Kunskap om orienteringen har tidigare visat sig vara till stor fördel vid rekonstruktionen av den ursprungliga strukturen. Denna idé har potential att utvecklas till ett avgörande verktyg för orienteringshämtning i enpartikelavbildningsexperiment, men för att den ska lyckas behöver vi göra ytterligare studier, både experimentellt och med hjälp av simuleringar. Detta projekt fokuserar på simuleringarna, med målet att besvara frågor som: "Vilket är förhållandet mellan reproducerbarheten av jonfördelningskartorna och proteinets struktur?", "Kan vi bestämma strukturen för den ursprungliga molekylen baserat på informationen i explosionen?”.

Som doktorand kommer du att studera den röntgeninducerade explosionsdynamiken hos biomolekyler med hjälp av klassisk molekyldynamik och kvantmekanik. Jonfördelningskartorna kommer i nästa steg att analyseras för att återvinna information om den ursprungliga molekylens struktur. Detta kommer att göras med hjälp av maskininlärningsalgoritmer och kombineras med andra typer av data, såsom aminosyrasekvensen, diffraktionsbilden och jonspektra.

Arbetsuppgifter
Den studerande ska i första hand inrikta sig på forskarutbildning, men andra arbetsuppgifter relaterade till undervisning och administrativt arbete kan vara inblandade, upp till högst 20 % av tiden. Information om forskarutbildning, behörighetskrav och antagningsregler finns på fakultetens hemsida, http://www.teknat.uu.se/utbildning/utbildning-pa-forskarniva/

Detta projekt inkluderar ytterligare utstationering inom SPIDocs-konsortiet vid DESY i Hamburg. Ytterligare korta besök kommer att arrangeras i samförstånd med handledaren för forskningsprojektet. Dessutom kommer du att delta i internationella konferenser, i regelbundna projektmöten och specialiserade kurser vid olika universitet för att komplettera dina kunskaper. En viss mängd resor förutses i samband med dessa aktiviteter.

Kvalifikationskrav
För att följa MSCA-programmets mobilitetsregel är du berättigad om du inte har bott eller utfört sin huvudsakliga verksamhet som arbete eller studier, i Sverige i mer än 12 månader under de 36 månaderna omedelbart före rekryteringsdatumet.

Behörig till utbildning på forskarnivå är den som har

- avlagt examen på avancerad nivå inom fysik, eller
- fullgjort minst 240 högskolepoäng inom relevant område såsom fysik, kemi eller materialvetenskap, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå inklusive ett självständigt arbete om minst 15 högskolepoäng, eller
- på något annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Utöver mobilitetsregeln är du berättigad till SPIDocs program, om du inte redan har en doktorsexamen vid rekryteringsdatumet. Om du framgångsrikt har försvarat din doktorsavhandling men som ännu inte formellt har avlagt doktorsexamen, anses du inte vara behörig.

Flytande engelska i både tal och skrift är en förutsättning.

Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer: https://regler.uu.se/?languageId=3

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad, enligt HF 5 kap § 7. Omfattningen är heltid. Tillträde 1 mars 2024 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Carl Caleman, carl.caleman@physics.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 27 november, UFV-PA 2023/3826.

Observera att detta är en förkortad version av annonsen. För att se den fullständiga annonsen vänligen klicka på ”Ansök här” eller se Uppsala universitets hemsida: https://uu.se/jobb/

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 500 anställda och 54 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.


Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet
https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/


Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.


Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.