Doktorand i kemi med fokus på strukturbiologi

Kemiska institutionen söker en doktorand med fokus på replikeringsmaskineriet hos humana patogena luftvägsvirus från Pneumoviridae-familjen.

Projektet involverar utbildning i toppmodern kryogen elektronmikroskopi (cryo-EM) datainsamling och bearbetning. Doktoranden kommer också att lära sig hur man förbereder utmanande prover och karakteriserar dessa med biokemiska, biofysiska och funktionella analyser. Umeå universitet är en av Sveriges största akademiska institutioner med över 37 000 studenter, med en mångsidig, samverkande och öppen kultur. Välkommen med din ansökan senast 8 september, 2023.

Virus som tillhör familjen Pneumoviridae är den dominerande orsaken till akuta nedre luftvägsinfektioner (ALRI) hos små barn. En grundlig förståelse av virusstrukturer är avgörande för att belysa mekanismer för viral replikation som bas för rationell utveckling av terapi.

I dina doktorandstudier kommer du att producera och karakterisera polymeraskomplex av virus från familjen Pneumoviridae. Med hjälp av integrrad strukturbiologi och biofysik kommer du att analysera struktur och dynamik i dessa komplex. Du kommer att; använda en kollektion av ”camelid nanobodies” för att inhibera polymeraskonformationer, använda en metod med hög genomströmning för att bestämma flera strukturer bundna till ”nano bodies” och relatera dessa tillbaka till funktionella tillstånd. Du kommer att använda aktivitetsanalyser för att identifiera svaga punkter som ”nano bodies” har identifierat. Resultaten av projektet kommer att bidra till vår förståelse av pneumovirusreplikeringsmaskineriet.

Studieuppgifter 
Doktorandstudierna syftar till en doktorsexamen där huvuduppgiften är att bedriva forskning för att reda ut den molekylära grunden för hur patogener fungerar för att interferera med sina värdceller. Du kommer att använda en blandning av olika rekombinanta proteinuttryckssystem för att producera komponenter i det virala maskineriet. Du kommer att använda biokemiska metoder för att rena och rekonstituera komplex, och analysera dessa funktionellt. Du kommer att använda dig av nationella och internationella infrastrukturer som tillåter avancerade metoder för provkarakterisering. Du kommer att ges möjligheter att lära dig hur man använder kryogena elektronmikroskop, 3D-strukturförfining och modellförfining. Vid Umeå universitet kommer du att tillhöra en stöttande, levande och mångsidig forskningsmiljö med toppmodern utrustning och faciliteter för analys av makromolekylära komplex. För att lyckas med din doktorsexamen kommer du att få handledning från flera bihandledare som är experter inom sina respektive områden.

Kvalifikationer  

För att bli antagen till utbildning på forskarnivå krävs det att den sökande har grundläggande behörighet genom avlagd examen på avancerad nivå, eller slutförda kursfordringar om minst 240 högskolepoäng varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller motsvarande utländsk utbildning, eller motsvarande kvalifikationer. 

För att uppfylla kravet på särskild behörighet att antas till utbildning på forskarnivå i kemi krävs att den sökande har grundläggande högskoleutbildning om minst 90 högskolepoäng i kemi eller andra ämnen som bedöms vara direkt relevanta för den aktuella inriktningen: biokemi. Av de 90 högskolepoängen skall minst 15 högskolepoäng på avancerad nivå inom inriktningen, eller motsvarande, ingå.  

Du är kreativ och intresserad av infektionsbiologi. Du har dokumenterad erfarenhet inom biokemi, strukturbiologi och molekylärbiologi (exempelvis kloning, proteinuttryck, proteinrening, cellkultur). Du är bekväm med grundläggande beräkningar. Goda kunskaper i engelska i både tal och skrift krävs. 

Erfarenhet av Linux och eller Python samt tidigare erfarenhet av virologi är meriterande. 

Du kan arbeta självständigt, ta initiativ och har en god problemlösande analysförmåga. Du både trivs och har förmågan att samarbeta i team mot gemensamma mål och tycker om att hjälpa och jobba tillsammans med kollegor. Du har god kommunikationsförmåga och är respektfull mot andra. 

Villkor för anställningen 
Anställningen syftar till en doktorsexamen och doktorandens huvuduppgift är att ägna sig åt egen forskarutbildning vilket innefattar såväl deltagande i forskningsprojekt som forskarutbildningskurser. I arbetsuppgifterna kan undervisning och annat institutionsarbete (upp till max 20%) ingå. Anställningen är tidsbegränsad till fyra år heltid eller upp till fem år vid undervisning deltid. Löneplaceringen sker enligt fastställd lönestege för doktorandanställning. 

Ansökan 
Ansökan ska innehålla följande dokument:

- Ett personligt brev där du beskriver dina forskningsintressen samt dina skäl att söka utbildningsplatsen
- CV 
- Styrkta kopior av examensbevis eller motsvarande, inklusive dokumentation av genomförda akademiska kurser, erhållna betyg, och ev andra intyg 
- Namn och kontaktinformation till minst två referenspersoner 

Ansökan ska göras via vårt e-rekryteringssystem Varbi på engelska (företrädesvis) eller svenska och vara inkommen senast den 8 september 2023. 

För mer information kontakta biträdande universitetslektor Max Renner, mailto:max.renner@umu.se.

Information om oss 
Kemiska institutionen är en av de största institutionerna inom Teknisk-naturvetenskaplig fakultet och har närmare 200 anställda, varav ca 40 forskarstuderande och en stark och expanderande forskning. Tre större forskningsområden, biologisk kemi, miljö- och biogeokemi och teknisk kemi samlar institutionens forskning och utbildning inom kemi. Vi är också en stark partner inom KBC, Kemisk-biologiskt centrum. Information om institutionens forskarutbildning finns på vår hemsida: http://www.umu.se/teknisk-naturvetenskaplig-fakultet/utbildning/utbildning-pa-forskarniva/kemi/. 

Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.


Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.