Doktorand i kemi med inriktning mot biokemi

Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med drygt 36 000 studenter och 4 200 anställda.  Här finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden. Umeå universitet är också platsen för den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 – en revolution inom gentekniken som tilldelats Nobelpriset i kemi.

Vid Umeå universitet är allt nära. Våra sammanhållna campus gör det lätt att mötas, samarbeta och utbyta kunskap, något som gynnar en dynamisk och öppen kultur där vi gläds åt varandras framgångar.


Är du intresserad av att veta mer om Umeå universitet som arbetsplats läs mer på:https://umu.se/jobba-hos-oss/




Vi söker en doktorand för ett fullt finansierat fyraårigt forskningsprojekt om metaboliska vägar i arten av den mänskliga tarmmikrobiomet.

Projektet omfattar fördjupade studier i proteomik, mänsklig tarmmikrobiom, biokemi och analys av stora datamängder. Ansök senast 4 april 2022.  

De arter som utgör den mänskliga tarmmikrobiomet är dåligt karakteriserade på sin molekylära nivå, trots deras viktiga roller för att upprätthålla ett hälsosamt tillstånd. Närvaron av patogena arter eller obalanser i sammansättningen av kommensala arter är förknippade med sjukdom.

I dina doktorandstudier kommer du att använda proteomikmetoder för att kartlägga metaboliska vägar i de vanligaste arterna av den mänskliga tarmmikrobiomet, det vill säga vilka proteiner som uttrycks och används för att metabolisera olika näringsämnen. Du kommer sedan att koppla de identifierade vägarna med artinteraktioner (t.ex. kommensalism, mutualism eller parasitism) för att förutsäga hur mikrobiella samhällen etableras och upprätthålls. Detta kommer att ge en första indikation om hur mikrobiella samhällen i tarmen rationellt kan manipuleras, antingen genom dietinterventioner eller genom kolonisering med specifika arter, för att tillåta artobalanser orsakade av sjukdomar att återställas.

Arbetsuppgifter
Forskarstudierna syftar till en doktorsexamen där huvuduppgiften är forskning inom att karakterisera proteinfunktion och interaktioner hos arter av människans tarmmikrobiomet. Du kommer att använda avancerade bakterieodlingsförhållanden för att odla arten av den mänskliga tarmmikrobiomet i frånvaro av syre. Du kommer att använda termisk proteomprofilering och andra proteomikmetoder för att identifiera vilka metabola vägar som är aktiva under olika näringsförhållanden. Du kommer att lära dig att analysera stora datamängder samt att använda molekylärbiologiska och biokemimetoder för att följa upp intressanta fynd. På Umeå universitet kommer du att vara involverad i en stark forskningsmiljö både vid Kemiska institutionen och Molekylär infektionsmedicin Sverige (MIMS), och få chansen att använda flera olika infrastrukturer (t.ex. metabolomik, proteinuttryck, NMR, cryoEM) ) för en framgångsrik doktorsexamen. Utöver forskningsuppdraget ingår även deltagande i forskarutbildningskurser.

Kvalifikationer 
För att bli antagen till utbildning på forskarnivå krävs det att den sökande har grundläggande behörighet genom avlagd examen på avancerad nivå, eller slutförda kursfordringar om minst 240 högskolepoäng varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller motsvarande utländsk utbildning, eller motsvarande kvalifikationer.

För att uppfylla kravet på särskild behörighet att antas till utbildning på forskarnivå i kemi krävs att den sökande har grundläggande högskoleutbildning om minst 90 högskolepoäng i kemi eller andra ämnen som bedöms vara direkt relevanta för den aktuella inriktningen. Av de 90 högskolepoängen skall minst 15 högskolepoäng på avancerad nivå inom inriktningen, eller motsvarande, ingå. 

Du är intresserad av proteomik, biokemi och mikrobiologi och måste ha visat förmågor inom experimentell biokemi och molekylärbiologi (t.ex. bakteriekultur, kloning, western blot). Du måste ha viss grundläggande erfarenhet av proteomik och dataanalys (dvs grundläggande programmeringskunskaper; till exempel i R eller python). Goda kunskaper i engelska i både tal och skrift krävs.

Kunskap om 16S rRNA-sekvensering eller växande arter under anaeroba förhållanden är meriterande men inte ett krav.

Du kan arbeta självständigt, ta initiativ och samarbeta med forskargruppen. Du har god förmåga att kommunicera din forskning i såväl tal som skrift. Du motiveras av att ägna fyra år till doktorandstudier som sedan resulterar i en doktorsexamen.

Villkor för anställningen
Anställningen syftar till en doktorsexamen och doktorandens huvuduppgift är att ägna sig åt egen forskarutbildning vilket innefattar såväl deltagande i forskningsprojekt som forskarutbildningskurser. I arbetsuppgifterna kan undervisning och annat institutionsarbete (upp till max 20%) ingå. Anställningen är tidsbegränsad till fyra år heltid eller upp till fem år vid undervisning deltid. Löneplaceringen sker enligt fastställd lönestege för doktorandanställning.

Ansökan
Ansökan ska innehålla: 

- Ett personligt brev där du beskriver dina forskningsintressen samt dina skäl att söka utbildningsplatsen
- CV
- Styrkta kopior av examensbevis eller motsvarande, inklusive dokumentation av genomförda akademiska kurser, erhållna betyg
- Namn och kontaktinformation till minst två referenspersoner

Ansökan ska göras via vårt e-rekryteringssystem Varbi och vara inkommen senast den 4 april 2022. 

För mer information, vänligen kontakta biträdande universitetslektor André Mateus, mailto:andre.mateus@umu.se, https://mateuslab.com/.

Information om oss
Kemiska institutionen är en av de största institutionerna inom Teknisk-naturvetenskaplig fakultet och har närmare 200 anställda, varav ca 40 forskarstuderande och en stark och expanderande forskning. Tre större forskningsområden, biologisk kemi, miljö- och biogeokemi och teknisk kemi samlar institutionens forskning och utbildning inom kemi. Vi är också en stark partner inom KBC, Kemisk-biologiskt centrum. Information om institutionens forskarutbildning finns på vår hemsida: http://www.umu.se/teknisk-naturvetenskaplig-fakultet/utbildning/utbildning-pa-forskarniva/kemi/.