Doktorand i matematisk statistik

vid Matematiska institutionen. Sista ansökningsdag: 2018-11-05.

Allmän beskrivning:
Detta är ett par-doktorandprojekt där en doktorand är kopplad till Matematiska institutionen och har sin huvudhandledare (Joanna Tyrcha) där. Den andra doktoranden är kopplad till Institutionen för biokemi och biofysik och har sin huvudhandledare (Mats Nilsson) där. De två huvudhandledarna är biträdande handledare för varandras doktorander. 

Projektbeskrivning
DNA kartlades för första gången för 40 år sedan. Sedan dess har DNA sekvensiering successivt utvecklats och går nu in i en ny fas där storskalig parallell sekvensiering utförs direkt i cellen. Mats Nilssons grupp vid Institutionen för biokemi och biofysik har utvecklat en teknik som kallas in situ sequencing och som har förmåga att upptäcka ett stort antal genuttryck i celler vävnadsprov. Hans grupp arbetar med två datamängder: en rör bröstcancertumörer och en rör neuroner i mushjärnan. Målet är att svara på om några celler/molekyler tenderar att vara lokaliserade på givna sätt i förhållande till varandra.

Dessa biologiska frågeställningar innebär utmaningar som rör både statistisk dataanalys och inferens. Metoder från spatial statistik är centrala. En sådan metod är t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding (t-SNE)  som har blivit spridd inom maskininlärning. Metoden använder klassiska divergensmått men det finns en potentiell möjlighet att använda andra mått. Spatial statistik omfattar många olika tekniker varav många är i utvecklingsfasen. Det finns alltså potential att utveckla nya spatiala statistiska metoder och att använda dessa för att besvara biologiska frågor.

Den sökande bör ha en djup förståelse för statistiska metoder, erfarenhet av programmering samt tillräcklig förståelse för biologi för att kunna diskutera och samarbeta med sin par-doktorandkollega vid Institutionen för biokemi och biofysik.

Behörighetskrav
Se länk till fullständig annons nedan.

Urval
Urval bland de sökande görs med hänsyn till förmågan att tillgodogöra sig utbildning på forskarnivå och baseras på kursmeriter, kvalitet hos uppsats(er), referenser och, för en mindre grupp utvalda sökande, intervju. 

Antagningsordning för utbildning på forskarnivå vid Stockholms universitet finns på: www.su.se/styrdokument/utbildning.

Anställningsvillkor
Som doktorand får endast den anställas som antas eller redan är antagen till utbildning på forskarnivå vid en högskola.

En ny anställning som doktorand gäller för högst ett år. Anställningen får förnyas med högst två år i taget. Den sammanlagda anställningstiden får dock inte vara längre än vad som motsvarar fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Den som är anställd som doktorand ska främst ägna sig åt sin egen utbildning på forskarnivå, men får arbeta högst 20 % med utbildning, forskning och administration.

Observera att beslut om anställning som doktorand inte kan överklagas.

Stockholms universitet strävar efter att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika möjligheter för alla.

Kontakt
Ytterligare information lämnas av handledare Joanna Tyrcha, joanna@math.su.se, och studierektor för forskarutbildningen Maria Deijfen, mia@math.su.se.

Fackliga företrädare
Ingrid Lander (Saco-S), tfn 0708-16 26 64, saco@saco.su.se, Lisbeth Häggberg (Fackförbundet ST och Lärarförbundet), tfn 08-16 20 00 (vx), seko@seko.su.se (SEKO), samt doktorandrepresentant, doktorandombud@sus.su.se.

Ansökan
Du söker doktorandplatsen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

När du ansöker ber vi dig att fylla i följande uppgifter

Anvisningar för sökande finns på webbsidan: anvisningar – sökande.

OBS! Den fullständiga annonsen hittar du på www.su.se/jobb under Doktorandplatser.

Välkommen med din ansökan!


Stockholms universitet – forskning, utbildning och samverkan i den internationella frontlinjen.