Doktorand i medicinsk vetenskap

Uppsala universitet ledigförklarar härmed en

Doktorandplats i medicinsk vetenskap inom området molekylär medicin vid Institutionen för medicinska vetenskaper, Akademiska sjukhuset, med tillträde snarast.

Institutionen för medicinska vetenskaper vid Uppsala universitet, www.medsci.uu.se, har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom en rad områden.

Forskningsprojektets målsättning är att identifiera genetiska och epigenetiska signaturer som förutspår svaret på läkemedelsbehandling av patienter med akut barnleukemi (ALL).I projektet analyseras ett unikt patientmaterial bestående av prover från nordiska patienter med ALL med hjälp av modern teknologi för genomanalys.Patienterna är väl karakteriserade med avseende på svaret på behandling med cytostatika både in vitro och in vivo.Genetisk variation i eller metylering av de regulatoriska områdena av gener kan påverka genernas uttrycksnivåer genom att förändra bindningen av transkriptionsfaktorer eller andra proteiner.Genetiska varianter som skapar eller förstör ett bindningsställe för små RNA-molekyler (mikroRNA) kan påverka genuttrycksnivåer genom förändrad transkripternas stabilitet och därigenom deras uttrycksnivåer.Dessa mekanismer kan förorsaka allelspecifika skillnader i genernas uttrycksnivåer.

Projektet stävar till att identifiera sådan regulatorisk genetisk variation och baserar sig på data från en systematisk analys av allelspecifikt uttryck av 8000 gener i cellprover från 200 patienter med ALL.Metylering av promotorområdena i de gener som uppvisar de största skillnaderna i allelspecifikt genuttryck kommer att bestämmas med genotypningsmetodik.Regulatorisk genetisk variation kommer att identifieras med hjälp av ny storskalig teknologi för sekvensanalys från Solexa.Betydelsen av de identifierade genetiska varianterna kommer sedan att påvisas med hjälp av associationsanalys av genuttrycknivåerna och läkemedelssvaret i ett större antal ALL-patienter.Om projektet blir framgångsrikt kommer det att identifiera genetiska markörer som kan användas i farmakogenetiska tester som stöd vid planering av en optimal behandling av patienterna.

Kompetenskravet för en framgångsrik sökande av doktorandplatsen är erfarenhet av modern teknologi för genomanalys och bioinformatik samt av traditionella laborativa molekylärbiologiska eller cellbiologiska metoder.Lämplig grundutbildning är examen i molekylär biologi, biokemi eller biomedicin.Goda språkkunskaper i engelska anses mycket meriterande

Ansökan skall innehålla CV, kopior av examensbevis och betyg, examensarbete, eventuella publikationer och en kort beskrivning av dina forskningsintressen.Vi ser gärna att du lämnar uppgifter om referenspersoner och/eller bifogar rekommendationsbrev.

Information om utbildning på forskarnivå, behörighetskrav och antagningsbestämmelser finner du på www.medfarm.uu.se/forskarutbildning/index.shtml .Personen som kommer att antas på doktorandplatsen kommer att anslås på institutionens hemsida (www.medsci.uu.se).

Upplysningar om anställningen lämnas av Ann-Christine Syvänen, professor, tel.