Doktorand i mikrobiologi, komparativ systembiologi antibiotika resistens

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 40 000 studenter, 7 000 anställda och en omsättning på 6,5 miljarder kronor.



Doktorand vid Institutionen för cell- och molekylärbiologi.

Tillträde 170901.

Uppsala Antibiotics Center (UAC) startades 2015 som ett initiativ för att stödja och stimulera forskning inom antibiotikaresistensområdet. Det involverar Uppsala Universitets samtliga fakulteter: Medicin och Farmaci, Teknik och Naturvetenskap samt Human och Samhällsvetenskapliga fakulteten. Denna doktorandtjänst är en av 14 doktorandtjänster inom UAC.

Det övergripande målet för detta doktorandprojekt är att studera uppkomst av resistens mot antibiotikan metronidazole (MTZ) eller 5-nitroimidazole. Det är ett unikt antibiotikum eftersom det är aktivt mot både bakterier och protozoer, enkelcelliga eukaryoter. Resistens mot Mtz har på senare tid upptäckts i både bakterier (t.ex. Helicobacter pylori och Clostridium difficile) och parasitiska protozoer (Giardia intestinalis, Entamoeba histolytica och Trichomonas vaginalis). Dock vet man mycket lite om resistensmekanismerna och det är svårt att identifiera resistenta organismer. I detta projekt kommer vi att använda en komparativ systembiologisk approach för att identifiera resistensmekanismerna. Vi kommer att selektera fram resistenta organismer (G. intestinalis och C. difficile) i laboratoriemiljö och dessa kommer att studeras mha DNA och RNA sekvensering, proteomik och metabolomik. Olika statistiska och bioinformatiska metoder kommer att användas för att koppla ihop de olika faktorerna som associeras med resistens.

De sökande ska ha en Master of Science i mikrobiologi eller infektionsbiologi, en examen från ingenjörsprogrammet i molekylärbioteknik eller liknande kvalifikationer. Tidigare erfarenheter av bioinformatiska analyser av systembiologisk data är meriterande, liksom tidigare erfarenhet av arbete med patogena mikroorganismer. De sökande ska uppvisa god förmåga att arbeta såväl självständigt som i grupp och ha goda skriftliga och muntliga kunskaper i engelska.

Institutionstjänstgöring, vanligtvis undervisning, kommer att omfatta högst 20% av tjänsten. Information om utbildning på forskarnivå finns på teknisk naturvetenskaplig fakultets hemsida http://teknat.uu.se. För anställning som doktorand krävs att innehavaren är antagen eller kommer att antas till forskarutbildning. Lokala riktlinjer finns för löneinplacering.

Ansökan bör innehålla en kort beskrivning av forskningsintressen och relevanta erfarenheter (maximum en sida), CV, kopior av examensbevis och betyg, examensarbete (eller utkast därav) och övriga handlingar som sökanden önskar åberopa (gärna dokumentation av tidigare bioinformatisk verksamhet). Vi ser också gärna att Du lämnar uppgift om referenspersoner eller bifogar rekommendationsbrev från tidigare forskningshandledare.

Upplysningar om anställningen lämnas av professor Staffan Svärd, e-post: staffan.svard@icm.uu.se tel. 018-471 45 58.

Välkommen med din ansökan senast den 9 juni, UFV-PA 2017/1560.



Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.