Doktorand i molekylär reglering och 3D cellorganisation

Doktorand i molekylär reglering och 3D cellorganisation av muskuloskeletala vävnader

Institutionen för organismbiologi är en internationell miljö med fler än 100 medarbetare.

Vid institutionen bedrivs forskning och undervisning som är inriktad på utvecklingsbiologi, evolution, systematik, och fysiologi hos levande organismer. Läs gärna mer på https://www.iob.uu.se/

En doktorandanställning i molekylär reglering och 3D cellsorganisation av muskuloskeletala vävnader är tillgänglig vid institutionen för organismbiologi, avdelningen för evolution och utveckling i Haitina lab. Forskningsgruppen studerar cis-reglering, molekylär evolution och 3D cellorganisation av muskuloskeletala vävnader under utveckling och evolution av ryggradsdjur. Gruppen använder zebrafiskmodell och tillämpar ett antal banbrytande tekniker, inklusive transgenes, CRISPR/Cas9-genomredigering, avancerad mikroskopi och synkrotron-röntgenbaserad mikrotomografi för att koppla samman genetiska, molekylära och cellulära komponenter under normal skelettutveckling och i skelettsjukdomsmodeller. Läs mer om gruppens forskning på http://www.iob.uu.se/research/evolution-and-development/tatjana-haitina/.

Arbetsuppgifter
Doktorandprojektet är inriktat på undersökningen av skelettled- och ligamentutveckling i zebrafiskmodellen. Leder och ligament är nödvändiga för integriteten och rörligheten hos vårt skelett. Under embryologisk utveckling börjar bildandet av leden med interzonen, som tillsammans med den omgivande vävnaden bildar alla komponenter i den vuxna leden, inklusive ligament. Molekylära markörer för den tidiga interzonbildningen är förknippade med medfödda och åldersrelaterade ledsjukdomar.

PhD-studenten kommer att jämföra tre modeller av zebrafisk ledutveckling: 1.- som inte bildar käkled, 2.- som visar fördröjd men återhämtande ledutveckling och 3.- med normal ledutveckling. Heterogeniteten i de gemensamma interzoncellskikten kommer att undersökas genom att kombinera RNA-sekvensering av enskilda celler och rumslig analys av interzonceller. De viktigaste skillnaderna kommer att identifieras ytterligare mellan dessa tre modeller för 3D cell organisation, 3D morfologi, och subcellulära strukturer genom att använda genetiskt-taggade enzymer i kombination med synkrotron-röntgenbaserad mikrotomografi och avancerad elektronmikroskopisk avbildning. Detta projekt kommer att generera nya banbrytande upptäckter av de cellulära och molekylära mekanismerna under normal och förändrad led- och ligamentutveckling som har viktiga biomedicinska implikationer.

Den framgångsrika kandidaten ägnar större delen av tiden åt forskningsprojektet och egna forskarstudier. Andra tjänsteaktiviteter inom avdelningen, såsom undervisning och administrativt arbete, kan ingå i anställningsramen (högst 20 procent). Anställningen kommer att förlängas med den tid som ägnas åt undervisning för att möjliggöra fyra års heltidsstudier.

Kvalifikationskrav
Behörig till utbildning på forskarnivå är den som har

- avlagt examen på avancerad nivå inom Biologi, eller
- fullgjort minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå inklusive ett självständigt arbete om minst 15 högskolepoäng, eller
- på något annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Tidigare erfarenheter av arbete med tekniker inom molekylärbiologi och/eller histologi och mikroskopisk avbildning är ett krav.

Den sökande förväntas undervisa på engelska. Flytande engelska i både tal och skrift är ett krav.

Stor vikt läggs vid personlig lämplighet och bra samarbetsförmåga.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Tidigare erfarenheter av arbete med zebrafiskmodellen, flödescytometri, RNA sekvensering av enskilda celler, bildanalys, CRISPR/Cas9 genomredigering är meriterande.

Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer: https://regler.uu.se/?languageId=3.

Instruktioner för ansökan
Ansökan bör skrivas på engelska och ska innehålla:

1. Personligt brev, inklusive motivering att genomgå doktorandutbildningen (max. 1 sida)
2. CV
3. kopia på examensarbete, kopior av examensbevis och certifikat (inklusive lista över kurser och betyg), dokument som styrker kunskaper i engelska, samt andra ev. relevanta dokument
4. om tillgängligt, kontaktinformation (e-post och telefonnummer) till referenspersoner eller rekommendationsbrev. 

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad, enligt HF 5 kap § 7. Omfattningen är heltid. Tillträde 1 februari 2024 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala

Upplysningar om anställningen lämnas av: Docent Tatjana Haitina, tatjana.haitina@ebc.uu.se, +46184716120

Välkommen med din ansökan senast den 29 december 2023, UFV-PA 2023/4586.

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 500 anställda och 54 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.


Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet
https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/


Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.


Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.