Doktorand i storskalig dynamisk analys av genetiska bibliotek

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 40 000 studenter, 7 000 anställda och en omsättning på 6,5 miljarder kronor.



Uppsala Antibiotic Center (UAC) startade sin verksamhet 2015 för att samla, stimulera och stödja forskning som tar upp viktiga frågor angående antibiotikaresistens från samtliga tre ämnesområden vid UU: medicin och farmaci, naturvetenskap och teknik samt humaniora och samhällsvetenskap.

UAC utlyser nu 14 doktorandplatser.

Antibiotikaresistens är ett snabbt växande globalt problem. Komplexiteten i den nuvarande situationen kräver forskning inom alla vetenskapliga ämnesområden, inklusive nya antibiotika, bättre förståelse för resistensutveckling, snabbare diagnostiska metoder, nya ekonomiska modeller för läkemedelsutveckling, global styrning och bättre förståelse för hur man ändrar beteendet kring användningen av antibiotika och spridning av patogena bakterier

Anställningen är placerad vid Institutionen för cell- och molekylärbiologi (ICM) och programmet för molekylär systembiologi. ICM är en av de mest internationella, tvärvetenskapliga och framgångsrika forskningsavdelningarna inom molekylärbiovetenskap i Europa.

Projektbeskrivning: En viktig slutsats från genetiska och fysiologiska studier under de senaste fem decennierna är att den omgivande miljön drastiskt kan påverka fenotypisk expression av en specifik genotyp, inklusive de som ger antibiotikaresistens. Stokastisk variation i genuttryck genererar också variation i antibiotikaresistens vilket exemplifieras av så kallade persistenta bakterier. Detta projekt syftar till att reda ut sambandet mellan cell-till-cell-variation i tillväxthastighet och antibiotikatolerans och hur detta leder till resistensutveckling. Vi kommer att använda oss av en kombination av ny mikrofluidisk teknik, avancerad mikroskopi och storskalig genteknik för att möjliggöra en detaljerad fenotypisk karakterisering av många tusen bakteriestammar parallellt.

Uppdrag: Vi söker en doktorand som vill arbeta i en nyfikenhetsdriven forskningsmiljö med världsledande vetenskapliga projekt. Vi erbjuder en stimulerande arbetsplats i gränslandet mellan biofysik, optik och mikrobiologi där vi karaktäriserar de grundläggande mekanismerna för bakteriell genreglering och antibiotikaresistens samt utvecklar nya optiska tekniker för studier av enskilda molekyler i levande celler. Tillsammans med den tvärvetenskapliga forskargruppen kommer du att utveckla nya metoder för storskalig dynamisk fenotypning av genetiska bibliotek för att kunna svara på grundläggande frågor om effekten av cell-till-cell-variationer på utvecklingen av antibiotikaresistens. Arbetet innefattar användning av toppmoderna integrerade mikrofluidiska och optiska system för cellanalys, kloningstekniker och kvantitativ bilddataanalys.

Kvalifikationskrav: Du har en passion för vetenskap och höga ambitioner att utföra högkvalitativ forskning. Du har en masterexamen i ett relevant ämnesområde, bra våtlabbserfarenhet och grundläggande kunskaper om kvantitativ dataanalys. Personliga egenskaper, förmåga att arbeta självständigt och samtidigt kunna interagera med andra forskare är mycket viktiga då projektet innebär samarbete på flera nivåer. Utmärkt kommunikationsförmåga på engelska både skriftligt och muntligt är en förutsättning.

Ansökningsförfarande: Ansökan ska innehålla ett brev där den sökande kort beskriver sig själv och sina forskningsintressen. Ansökan ska dessutom innehålla CV, kopior av examensbevis och betyg, examensarbete och övriga handlingar som sökanden önskar åberopa.

Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer http://regler.uu.se/ Information om doktorandutbildning, krav och antagningsregler finns på http://www.teknat.uu.se/utbildning/forskarniva. Lönen sätts enligt etablerade lokala riktlinjer.

Uppsala universitet värdesätter de kvaliteter som jämn könsfördelning och mångfald tillför verksamheten. Vi ser därför gärna sökande av alla kön och med olika födelsebakgrund, funktionalitet och livserfarenhet.

Lön: Enligt lokalt avtal (Lokalt kollektivavtal för doktorander och amanuenser).

Tillträde: 2017-09-01, tidsbegränsad anställning t.o.m. 2021-08-31

Anställningens omfattning: 100 %

Upplysningar om anställningen lämnas av: Irmeli Barkeforsk (irmeli.barkefors@icm.uu.se, +46 18 4716681) eller Johan Elf (johan.elf@icm.uu.se)

Välkommen med din ansökan senast den 31 maj 2017, UFV-PA 2017/1505.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.