Doktorand - Plasmider i växtnyttiga bakterier

Institutionen för växtbiologi
Vid institutionen för växtbiologi bedrivs grundläggande och strategisk växtbiologisk forskning på jordbruksväxter, skogsträd, bioenergigrödor och modellorganismer. Våra huvudsakliga forskningsområden omfattar samspelet mellan växter och mikroorganismer, och andra former av stress såsom tillväxt och utveckling hos växter, bioteknologi och metabolisk manipulation, reglering av genuttryck, populationsgenetik, genomanalys och utveckling av förädlingssystem. Vi använder oss av modellorganismer såsom Arabidopsis, Physcomitrella, och tobak, samt grödor som raps, korgvide (salix), potatis och spannmål och patogener som virus, bakterier och svampar/oomyceter.

Institutionen ansvarar för grundkurser och påbyggnadskurser i allmän och molekylär genetik; genteknologi; cellbiologi, växtfysiologi, genexpression, växtförädling, växtbiokemi och bioteknik, molekylära interaktioner mellan växter och växtskadegörare. Utöver det bidrar institutionen till ytterligare kurser tillsammans med andra institutioner.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom SLU på https://www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/

Plasmider i växtnyttiga bakterier
Biologi
Innehållsbeskrivning:
Nyttiga bakterier kan förbättra växters hälsa och bidra till ett hållbart jordbruk. I detta avseende är bakterier i släktet Sphingomonas lovande. De förekommer rikligt på en mängd olika växter i naturen och de kan hjälpa dem att överleva stress, bekämpa patogener eller öka produktionen. Sphingomonas bär sitt huvudsakliga DNA i en stor kromosom, men bär också på en del DNA i mindre bitar som kallas plasmider. Plasmider medför inte endast egenskaper som är till nytta för en bakterie, utan bakterierna kan också dela dem sinsemellan populationen och på så sätt anpassa sig till nya miljöer. Detta projekt kommer att katalogisera, karakterisera och utvärdera användbarheten av plasmider från Sphingomonas som isoleras från blad och rötter från den lilla modelväxten backtravs (Arabidopsis thaliana), samt från de ekonomiskt viktiga växterna korn och gran. Projektet kommer sekvensera plasmid- och kromosom-DNA i många av våra insamlade Sphingomonas och bestämma om deras plasmider är vanliga och i vilken utsträckning plasmiderna bär på egenskaper som kan hjälpa bakterierna att trivas och därmed hjälpa växter. Därefter kommer det att avgöra om bakterierna kan fås att avstå från sina plasmider med särskilda behandlingar - ju svårare det är att bli av med plasmiderna, desto viktigare kan de vara för bakterien! Slutligen kommer projektet att blanda några Sphingomonas som har fått några eller inga av sina plasmider borttagna och låta dem konkurrera på växter. Om en plasmid hjälper en bakterie att växa bättre på växten, betyder det att plasmiden kan bära egenskaper som är användbara även för andra bakterier. Detta projekt är spännande eftersom det inte bara kommer att bidra till att fastställa hur plasmider kan hjälpa nyttiga bakterier att samverka med växter, utan också till att skapa en möjlighet att "avla" förbättrade bakterier genom naturliga processer så att de delar med sig av dessa nyttiga plasmider, vilket kan kommer bidra till fortsatt utveckling av ett hållbart jord- och skogsbruk.

Kvalifikationer:
Vi söker en person med civilingenjörsexamen i biologi, molekylärbiologi, mikrobiologi, genomik eller liknande ämnen som arbetsgivaren anser vara likvärdiga. Goda kunskaper om molekylärbiologiska tekniker är väsentligt eftersom arbetet kräver manipulering av mikroorganismer och deras applicering på växter. Viss erfarenhet av att arbeta med bakterier krävs. Erfarenhet av mikrobiomprofileringstekniker, inklusive 16S rRNA PCR, är meriterande. Erfarenhet av R eller liknande programmeringsspråk är meriterande, men inget krav om det finns motivation att lära sig. Erfarenhet av genomisk analys och jämförande genomik är till hjälp. Personliga egenskaper som kreativitet, motivation och driv är meriterande. Förmåga att utföra självständigt vetenskapligt arbete, att arbeta i forskargrupper samt att skriva och tala tydligt på engelska förväntas då engelska är kommunikationsspråket i forskargruppen och institutionen.

Placering:           
Uppsala.

Försörjningsform:
Anställning som doktorand (4 år).

Tillträde:
Enligt överenskommelse.

Ansökan
Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen senast den 2024-01-31.

För att vara behörig till utbildning på forskarnivå krävs avlagd examen på avancerad nivå eller minst fyra års heltidsstudier varav minst ett år på avancerad nivå.

Urval bland de behöriga sökande baseras på: skriftlig ansökan inklusive meritförteckning; examensarbete, kopior av examensbevis och registerutdrag från tidigare studier på grund- och avancerad nivå vid universitet eller högskola, två personliga referenser, kunskaper i engelska. Skriv din ansökan på engelska. Mer information om krav på engelska kunskaper finns på följande sida:
www.slu.se/utbildning/program-kurser/forskarutbildning/nya-doktorander-sokes/krav-pa-engelskakunskaper/

Observera att den/de sökande som blir kallade till intervju ska lämna in vidimerade kopior av examensbevis, eller motsvarande, och registerutdrag från tidigare studier på grund- och avancerad nivå vid universitet eller högskola, samt att de sökande som har utländskt medborgarskap också ska lämna in en vidimerad kopia av den sida i passet som innehåller foto och personinformation.

Läs mer om SLU:s forskarutbildning på www.slu.se/utbildning/program-kurser/forskarutbildning/

Fackliga kontaktpersoner:
https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/



Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) har en nyckelroll i utvecklingen för hållbart liv, grundad i vetenskap och utbildning. Genom vårt fokus på samspelen mellan människa, djur och ekosystem och ett ansvarsfullt brukande av naturresurserna bidrar vi till en hållbar samhällsutveckling och goda livsvillkor på vår planet. Huvudorter är Alnarp, Umeå och Uppsala, men verksamhet bedrivs också på forskningsstationer, försöksparker och utbildningsorter i hela landet.

SLU har drygt 3000 medarbetare, 5000 studenter och forskarstuderande och en omsättning på över tre miljarder kronor. Universitetet satsar på attraktiva miljöer på sina campusområden. Vi arbetar för en jämställd och inkluderande arbetsmiljö där öppna samtal mellan människor med olika erfarenheter lägger grunden för vetenskaplighet, kreativitet och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och perspektiv att söka den aktuella anställningen.