Doktorandplats i bakteriell genetik

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 40 000 studenter, 7 000 anställda och en omsättning på 6,5 miljarder kronor.



Uppsala Antibiotic Center (UAC) startade sin verksamhet 2015 för att samla, stimulera och stödja forskning som tar upp viktiga frågor angående antibiotikaresistens från samtliga tre ämnesområden vid UU: medicin och farmaci, naturvetenskap och teknik samt humaniora och samhällsvetenskap.

UAC utlyser nu 14 doktorandplatser.

Antibiotikaresistens är ett snabbt växande globalt problem. Komplexiteten i den nuvarande situationen kräver nya resultat inom alla vetenskapliga ämnesområden, inklusive nya antibiotika, bättre förståelse för resistensutveckling, snabbare diagnostiska metoder, nya ekonomiska modeller för läkemedelsutveckling, global styrning och bättre förståelse för hur man ändrar beteendet kring användningen av antibiotika och spridning av patogena bakterier.

Denna doktorandplats är placerad vid Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (IMBIM). Vi söker en starkt motiverad individ med förmåga att arbeta självständigt och med ett starkt intresse för att bedriva forskarutbildning i bakteriell genetik med fokus på horisontell genetisk överföring och antibiotikaresistens. Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi vid Uppsala universitet har en stark och internationell forsknings- och undervisningsmiljö med över 250 forskare, inklusive över 40 doktorander.

Projektbeskrivning: Fenotyper och potential för vidareutveckling av horisontellt överförda antibiotikaresistensgener. Projektet kommer att utveckla ett robust experimentellt system för att hantera den fenotypisk och evolutionär potentiell av främmande antibiotikaresistens och andra gener för att överkomma expressionsbarriärer som kan begränsa deras framgång efter horisontell genetisk överföring (HGT) till naiva bakteriearter. Det kommer inledningsvis att fokusera på genfamiljer med välkänd relevans för resistens i kliniska patogener, vars produkter interagerar med väsentliga cellkomponenter. Särskilda syften kommer att innefatta: att mäta resistens- och fitnesskostnader hos resistensgener efter de överförts till isogena bakteriestammar; Mätning av geners potentiell för att utveckla högre resistens och/eller mindre fitnesskostnader i den nya bakteriearten: spåra de evolutionära banorna för anpassning i den nya bakterievärden: mäta effekten av HGT-resistensgen före och efter adaptiv evolution, på in vivo fitness och virulens. Ytterligare studier kommer att fokusera på resistens-fitness fenotyper och evolutionära banor efter HGT av större genetiska regioner (mobila genetiska element är en naturlig miljö för många resistensgener). Detta experimentella system skulle kunna användas för att förutsäga nya och framväxande resistenshot mot nuvarande antibiotika och ge en rationell grund för att bestämma vilka nya antimikrobiella föreningar som ska väljas för utveckling till kliniska kandidater.

Arbetsuppgifter: Den framgångsrika kandidaten kommer att delta i forskningsarbete och fördjupa sig i doktorandstudier inom ämnesområdet. Andra uppgifter vid institutionen, exempelvis administration och undervisning, kan inkluderas till en nivå ej överstigande 20% av tiden.

Kvalifikationer: Kandidaten ska vid tjänstens tillsättning inneha en MSc-examen eller motsvarande med ett starkt fokus inom ett relevant ämnesområde, såsom medicinsk bakteriologi och/eller bakteriell genetik. Kandidaten förväntas vara initiativrik och angelägen att samarbeta såväl med gruppens övriga medlemmar som med nationella och internationella samarbetspartners. Stor vikt läggs vid personlig lämplighet.

För anställning som doktorand krävs att innehavaren är antagen eller kommer att antas till forskarutbildning, där graden av förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning är avgörande. Information om utbildning på forskarnivå, behörighetskrav och antagningsbestämmelser finns på http://www2.medfarm.uu.se/utbildning/forskarniva/.

Studieperioden (på heltid) är maximalt fyra år. Bestämmelser för doktorandstudier finns i Högskoleförordningen 5 kap 1-7 §§ samt i universitetets regler och riktlinjer http://regler.uu.se/.

Lön: Enligt lokalt avtal (Lokalt kollektivavtal för doktorander och amanuenser).

Tillträde: snarast eller enligt överenskommelse. 

Anställningens omfattning: 100 %

För ytterligare information: vänligen kontakta professor Diarmaid Hughes (diarmaid.hughes@imbim.uu.se), 018-471 4507.

Ansökan mottages via Uppsala universitets ansökningsportal och förväntas innehålla i) CV, ii) ett brev som beskriver kandidatens bakgrund, forskningsintresse, färdigheter och motivation till att söka den utlysta platsen, iii) eventuella publikationer och kopia av magisteruppsats eller motsvarande, samt iv) två referensbrev.

Du är välkommen att skicka in din ansökan senast 19 maj 2017, referens UFV-PA 2017/1536.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.