Forskare

Uppsala universitet

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 40 000 studenter, 6 500 anställda och en omsättning på cirka 5,5 miljarder kronor.

Tidsbegränsad anställning på ett år, tillträde snarast eller enligt överenskommelse.

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet (http://www.igp.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på genomik, cancer och molekylär diagnostik. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera närmare samarbete mellan kliniska och prekliniska forskare. Forskning bedrivs inom medicinsk och klinisk genetik, klinisk immunologi, bioinformatik, patologi, tumörbiologi samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för klinisk genetik, immunologi och patologi-cytologi vid Akademiska sjukhuset, Uppsala. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar inom den medicinska fakulteten samt ett antal utbildningar inom teknisk-naturvetenskaplig fakultet. Institutionen omsätter omkring 277 mkr och har ca 340 personer i sin arbetsstyrka, varav ca 90 är doktorander.

Projektbeskrivning. Inom forskargruppen pågår ett flertal projekt baserade på storskalig sekvensering av DNA och RNA. Forskning bedrivs både inom klinik-nära tillämpad forskning och på grundforskningsnivå. Data genereras från ett flertal olika sekvensplattformar inklusive Illumina, SOLiD, IonProton och PacBio. Arbetet innebär  utveckling av analysstrategier och pipelines för sekvensdata, samt statistisk analys av resultat från sekvensanalyser. Fokus ligger på detektion av expressionsskillnader och identifiering av isoformer med RNA-seq data, och på variantanalys och tolkning av genetisk variation med DNA-sekvensdata. Det finns även projekt där de novo assembly och integrering av olika sekvensdatatyper krävs. Forskargruppen kombinerar bioinformatiska analyser med funktionella experiment.

Arbetsuppgifter: För att stärka den bioinformatiska kompentensen i forskargruppen söker vi nu en motiverad forskare som kan driva utveckling av dataanalys och frågeställningar inom informatik. Detta innebär utveckling av analyspipelines som bygger på utveckling och anpassning av analysprogram och algoritmer för sekvensdata. Då utvecklingen inom området sker mycket snabbt krävs en person som har förmåga att testa, utvärdera och anpassa analyser. I befattningen ingår arbete inom olika projekt där det krävs interaktion och samarbete med andra yrkesgruppen inklusive läkare, genetiker och molekylärbiologer. Inom ramen för anställningen ingår också att skriva vetenskapliga artiklar, presentera både tekniska och biomedicinska resultat och att hjälpa till att leda det bioinformatiska arbetet inom forskargruppen.

Kvalifikationskrav: Personen vi söker ska ha doktorsexamen i ett område lämpligt för befattningen, såsom t.ex. bioinformatik, bioteknik, fysik eller liknande.   Dessutom krävs: -Dokumenterad erfarenhet av analys av data från next-generation sekvensering. -Dokumenterad erfarenhet i bioinformatik, framförallt för genom- och transkriptomdata, genomannotering, och god kunskap om bioinformatiska databaser och analysverktyg. -Dokumenterad programmeringskunskap i antingen Java, C/C++, Python eller Perl, samt erfarenhet av vetenskapliga beräkningar i Linux-baserade högpresterande system. -Dokumenterad kunskap i statistik och programmering med R. -God förmåga att uttrycka sig såväl muntligt som skriftligt på engelska. -God samarbets- och kommunikationsförmåga, samt förmåga att dokumentera arbetets gång. -Publikation och presentation av forskningsresultat.

Önskvärt och meriterande i övrigt: Kunskap eller intresse för genetik, medicin eller biologi i allmänhet är meriterande.

Sökande behöver ha god arbetsdisciplin och noggrannhet, och en förståelse för datasäkerhetsaspekter rörande patientdata och genetisk information. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Ansökan skall innehålla CV, kopior av examensbevis och betyg, eventuella publikationer och en kort beskrivning av dina forskningsintressen. Vi ser gärna att du lämnar uppgifter om referenspersoner. Ansökningarna bedöms enligt följande kriterier: Lämplig grundutbildning, tidigare erfarenhet av arbete och/eller forskning inom närliggande område samt personlig lämplighet.

Lön: Individuell lönesättning tillämpas. Ange löneanspråk i ansökan.

Upplysningar om anställningen lämnas av universitetslektor Lars Feuk (lars.feuk@igp.uu.se), tel: 018-4714827.

Välkommen med din skriftliga ansökan senast den 13 april, 2013. UFV-PA 2014/829. Klicka på länken nedan för att komma till ansökningsformuläret.

Forskare




Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Vi tar enbart emot ansökan på det sätt som beskrivs i annonsen.