Forskare

Forskare inom bioinformatik/human genomics, vid Institutionen för genetik och patologi, Rudbecklaboratoriet.

Institutionen för Genetik och Patologi vid Uppsala Universitet (http://www.genpat.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom medicinsk och klinisk genetik, bioinformatik, patologi, tumörbiologi samt vaskulärbiologi.Rudbecklaboratoriet erbjuder en välutvecklad infrastruktur för forskning med tillgång till spetsteknologi och ett antal serviceverksamheter, såsom cellanalys, konfokalmikroskopi, DNA-sekvensering och genotypning.

Beskrivning av huvudprojektet: Projektet är baserat på analys av en unik uppsättning av populationer från olika delar av Europa (Orkneyöarna, Kroatien, Italienska alperna, Nederländerna och norra Sverige) som tillsammans utgör det sk European Special Research Population Network (EUROSPAN).Genomvida associationsstudier (GWAS) har genomförts i syfte att identifiera genetiska faktorer som påverkar olika kliniska kvantitativa egenskaper i humana populationer och involverar analyser av genomet, transkriptomet, lipidomet, glykomet och proteomet.

Arbetsuppgifter: Att utföra avancerade statistiska/bioinformatiska analyser av data genererade bland annat i ett stort sameuropeiskt projekt.Vi planerar för att genomföra storskalig exomsekvensing i dessa populationer med SOLiD NGS teknologi som finns etablerad vid Rudbeck Laboratoriet, och söker därför en forskare som kan leda de bioinformatiska analyserna.Projektet involverar genetisk statistisk och epidemiologiska analyser av SNP GWAS data, exom sekvensdata, kvantitativa och kliniska karaktärer.I arbetsuppgifterna ingår planering, genomförande av statistiska och bioinformatiska analyser, deltagande i analysgrupper i olika internationella forskningskonsortier, sammanställning av data, skrivande av vetenskapliga uppsatser och publicering.I arbetet ingår även att bidra till skrivandet av forskningsansökningar och viss handledning av doktorander, studenter och gästforskare.

Kvalifikationskrav: Doktorsexamen med naturvetenskaplig inriktning.Mycket god erfarenhet av avancerade metoder för statistisk analyser av storskaliga genetiska (t ex GWAS) och icke-genetiska data vid olika studiedesigner (cohort-studier, familje-baserade studier).

Erfarenhet av storskaliga genetiska analyser i t ex GenAbel eller PLINK, meta-analyser av genetiska data från internationella konsortier och arbete med statistiska modeller för genetiska och miljöbetingade faktorer.Erfarenhet av analyser av DNA sekvensdata.Erfarenhet av att arbeta med diet, aktivitet och andra epidemiologiska data.Erfarenhet av att sammanställa och publicera vetenskapliga rapporter inom detta område.Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper


Välkommen med din ansökan med ev.bilagor senast
I samtliga fall ska UFV-PA 2010/1642 anges.

För att möjliggöra framtida kontakt ska ansökan innehålla uppgifter om namn, adress och telefon