Forskare

Institutionen för vatten och miljö
Institutionen för vatten och miljö (www.slu.se/vatten-miljo) är ett kompetenscentrum för tillämpad miljöforskning med ett nationellt ansvar för övervakning av miljötillståndet i svenska sjöar och vattendrag med avseende på vattenkemi, miljöförorening och akvatisk biota. Forskningen vid institutionen fokuserar på geokemiska och hydrologiska processer, akvatisk ekologi och biodiversitet, samt akvatisk ekotoxikologi och miljökemi. Institutionen har drygt 130 anställda varav ca hälften utgörs av forskare/doktorander och den andra hälften av teknisk och administrativ personal. Vi ingår i SLU:s Mark-Vatten-Miljöcentrum på Campus Ultuna i Uppsala. Den breda kompetensen bland de 300 personerna i klustret i kombination med en välutrustad infrastruktur skapar en unik plattform för forskning av hög kvalitet samt miljöövervakning och utvärdering.. 
Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom SLU på www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/

Arbetsuppgifter:
Innehavaren av tjänsten förväntas självständigt leda ett forskningsprojekt om symbiotisk interaktion i akvatiska ekosystem med fokus på multitrofa värd-parasit interaktioner och deras evolution och egenskaper. Syftet är att förstå den funktionella basen för dessa interaktioner genom jämförande transkriptomik och identifiera effekterna av dessa interaktioner på resten av det akvatiska ekosystemet och slutligen att utforska deras potentiella användning för biologisk kontroll.

Arbetet omfattar praktiskt expertarbete inom både bioinformatisk analys och avancerat molekylärt och mikrobiologiskt laboratoriearbete. Detta inkluderar analys av metabolism och funktionell analys av bakterie-, virus- och mikroeukaryota samhällen genom en kombination av metagenomik, metatranskriptomik och enkelcellsgenomik.

Tjänsten kommer också att omfatta utveckling och användning av multitrofa odlade modellsystem för högupplöst interaktionsanalys. Ytterligare arbetsuppgifter inkluderar analys och tolkning av data, samt presentation av resultat i vetenskapliga publikationer, handledning av studenter och doktorander, samt mentorskap inom bioinformatisk analys. Arbetsuppgifterna inkluderar även design av laboratorie-experiment och planering såväl som genomförande och koordinering av fältkampanjer. En del undervisning inom bioinformatik och närliggande områden ingår också.

Kvalifikationer som krävs:
För tjänsten ska den sökande ha en doktorsexamen i mikrobiologi, bioinformatik eller annat relevant ämne, samt ha relevant postdoktoral utbildning.

Kandidaten ska ha lång erfarenhet av storskaliga integrerade multiomics-analyser. Den sökande måste ha omfattande praktiska expertkunskaper om jämförande genomik med fokus på prokaryota system samt tolkning och analys av metagenomiska och metatranskriptomiska data, akvatiska fältprovtagning och färdigheter i provbehandling för nukleinsyra-baserade analyser.

Expertis inom rekonstruktion av prokaryoters och eukaryoters arvsmassa (både med Illumina short reads och PacBio long reads), annotering och analys av mikrobiell arvsmassa och tolkning av metabola egenskaper, samt påvisande av information som indikerar metaboliska interaktioner.

Den sökande ska även ha kunskap om experimentdesign och praktiskt mikrobiologiskt laboratoriarbetesom är relevant för projektet och vana av att studera olika komponenter i akvatiska mikrobiella näringsvävar.

Kandidaten måste ha praktisk erfarenhet av att utveckla multitrofa mikrobiella modellsystem i laboratorieskala. För tjänsten krävs därför visad kompetens inom mikrobiell odling och taxonomisk identifiering av mikrober. Sökande ska vidare ha erfarenhet av att studera ett brett spektrum av olika parasiter, inklusive bakteriofager, chytrider och NCLDV-virus som infekterar antingen bakterier eller växtplanktonvärdar.

Kandidater måste ha stor förmåga att arbeta i team och ha goda kunskaper i engelska i både tal och skrift.

Kvalifikationer som är meriterande:
Forskningserfarenhet av mikrobiell mångfald i en rad olika akvatiska ekosystem såsom sötvatten, bräckta vattenekosystem, hav, hypersalina vatten och djupa grundvatten anses meriterande.

Framgång med att erhålla externa forskningsanslag som huvudsökande är också meriterande för tjänsten. Erfarenhet av att leda och engagera sig i internationella forskningssamverkansprojekt är också höggradigt meriterande för tjänsten.

Det är vidare meriterande att ha viss undervisningserfarenhet inom högre utbildning, samt erfarenhet av handledning av masterstudenter och doktorander till examen. Relevant pedagogisk och ledarskapsutbildning i handledning och undervisning motsvarande SLU:s docentkrav är meriterande.

Ytterligare meriter som kommer att beaktas i denna rekrytering inkluderar giltig beskrivning och polyfasisk taxonomisk klassificering av odlade prokaryoter och kandidat-taxa, praktisk erfarenhet av flödescytometri och av att använda LIMS-systemet LabCollector och slutligen uppsökande och populärvetenskapliga aktiviteter för att dela forskningsresultat med allmänheten.

Placering:
Uppsala

Anställningsform:
Tillsvidareanställning. SLU kan komma att tillämpa provanställning.

Omfattning:
100%

Tillträde:
Snarast.

Ansökan:
Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen nedan senast den 2022-06-10.

Fackliga kontaktpersoner:
https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/



Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) är ett universitet i internationell toppklass med forskning, utbildning och miljöanalys inom vetenskaper för hållbart liv. Huvudorter är Alnarp, Umeå och Uppsala, men verksamhet bedrivs också på forskningsstationer, försöksparker och utbildningsorter i hela landet. Hos oss samlas människor med olika perspektiv men med det gemensamma målet att skapa de bästa förutsättningarna för en hållbar, levande och bättre värld.

SLU har drygt 3000 medarbetare, 5000 studenter och forskarstuderande och en omsättning på över tre miljarder kronor. Universitetet satsar på attraktiva miljöer på sina campusområden.

www.slu.se