Forskare - bioinformatik och anpassning av grödor till klimatförändringar

Institutionen för växtförädling
Om jobbet
Du kommer att arbeta inom ett NordForsk-finansierat projekt som är utformat för att generera praktiska insikter om kommande klimatdynamik i Norden och Baltikum. Det främsta målet är att underlätta anpassningen av växtsorter till de föränderliga klimatförhållandena. Fokus ligger på att förbättra grödornas motståndskraft i korn (som representerar spannmål), rödklöver (som representerar (fodergrödor) och potatis (som representerar rotfrukter). Projektet leds av det norska beräkningscentret (NR) och omfattar samarbete med partnerinstitutioner från nordiska forskningsinstitut och förädlingssorganisationer, tillsammans med Finlands meteorologiska institut.

Dina ansvarsområden kommer att omfatta en rad uppgifter. Dessa inkluderar sammanställning och analys av stora mängder genotypiska och fenotypiska data med hjälp av avancerade bioinformatiska verktyg. Dessutom kommer du att använda modelleringsmetoder för att förutsäga den framtida avkastningspotentialen för potatis, korn och rödklöver med hjälp av regionala klimatprognoser och relevanta odlingssäsongsindikatorer. Samtidigt kan din roll omfatta att handleda praktikanter och studenter, samt potentiella undervisningsuppdrag. Arbetet inkluderar att sprida och publicera resultaten för både offentlig och vetenskaplig publik på såväl nationell som internationell nivå samt i fackgranskade tidskrifter.

Din bakgrund 
Vi söker en bioinformatiker med färdigheter inom kurering, hantering och integrering av storskalig genotypisk och fenotypisk data från flera offentliga källor. Den ideala kandidaten har erfarenhet av molnbaserad databehandling, datakurering, automatisering av arbetsflöden med verktyg som Snakemake, samt förmåga att implementera skalbara bioinformatiska pipelines. Expertis inom databashantering och integrering av komplex data för växtforskning är mycket önskvärt.

Du är berättigad att söka denna tjänst om du har doktorerat och har högst fem års forskarerfarenhet inom växtförädling, genetik, bioinformatik eller liknande samt erfarenhet av statistisk och genetisk analys kopplad till växtförädling och hantering av storskaliga data. Kunskaper i programmeringsspråken R och Python samt utveckling av analysverktyg inom bioinformatik krävs.

Du ska kunna arbeta både i team och individuellt, organisera arbetet effektivt och prioritera arbetsbördan. Stor vikt kommer att läggas vid dina personliga egenskaper som återspeglas i former, såsom nyfikenhet, noggrannhet, samarbetsförmåga, och förmåga att ta initiativ och arbeta självständigt.

God förmåga att kommunicera på engelska i tal och skrift är ett krav.

Det är meriterande om du har kunskap om och tidigare praktisk erfarenhet av växtförädling.

En god förmåga att kommunicera på ett skandinaviskt språk är också meriterande.

Om oss
Institutionen för växtförädling undervisar och utför strategisk och tillämpad forskning på hortikulturella grödor och jordbruksgrödor med målet att tillhandahålla kunskap, verktyg och produkter för en biobaserad ekonomi, en hållbar miljö och en förbättrad hälsa hos människor. Inom avdelningen för växtförädling använder vi ett brett spektrum av tekniker; från fältexperiment och karakterisering av jordbrukets biologiska mångfald, till genetik, genomik, genteknik, biokemi och fysiologi.

Mer information om institutionen/avdelningen: https://www.slu.se/institutioner/vaxtforadling/

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba vid SLU på https://www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/

Placering:
Alnarp

Anställningsform:
Tidsbegränsad anställning 12 månader

Omfattning:
Exempelvis 100%

Tillträde:
Enligt överenskommelse.

Ansökan:
Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen nedan senast 2024-11-04.

Fackliga kontaktpersoner:
https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/

 


Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) har en nyckelroll i utvecklingen för hållbart liv, grundad i vetenskap och utbildning. Genom vårt fokus på samspelen mellan människa, djur och ekosystem och ett ansvarsfullt brukande av naturresurserna bidrar vi till en hållbar samhällsutveckling och goda livsvillkor på vår planet. Huvudorter är Alnarp, Umeå och Uppsala, men verksamhet bedrivs också på forskningsstationer, försöksparker och utbildningsorter i hela landet.

SLU har drygt 3000 medarbetare, 5000 studenter och forskarstuderande och en omsättning på över tre miljarder kronor. Universitetet satsar på attraktiva miljöer på sina campusområden. Vi arbetar för en jämställd och inkluderande arbetsmiljö där öppna samtal mellan människor med olika erfarenheter lägger grunden för vetenskaplighet, kreativitet och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och perspektiv att söka den aktuella anställningen.