Forskare inom molekylär mikrobiologi

Arbetsbeskrivning

Umeå universitet satsar på kreativa miljöer för studier och arbete. Hos oss finns attraktiva utbildningar, världsledande forskning och utmärkta innovations- och samverkansmöjligheter. Fler än 4 300 medarbetare och 31 500 studenter har redan valt Umeå universitet. Välj oss du också.



Vi söker en forskare vid institutionen för molekylärbiologi och laboratoriet för molekylär infektionsmedicin Sverige (MIMS) som kommer att delta i att utveckla en del av ett större forskningsprogram finansierat av vetenskapsrådet, benämnt ”Peptidoglykanmångfald och plasticitet hos bakterier”.

Arbetsuppgifter
Den anställda kommer ha ansvar för utveckling och ledning av ett delprojekt, vilket omfattar ett avgränsat forskningsprogram om hur temperaturen och små miljömolekyler (såsom D-aminosyror och fenaziner) reglerar bildning av biofilm i Vibrio cholerae. Detta program har stor potential i att identifiera molekylära triggers av kolerautbrott.

I nära samarbete med Benes lab (ansvarig för GeneCore vid EMBL, Tyskland), kommer den anställda använda en RNA-seq (inklusive små RNA) strategi för studier av V. cholerae under anpassning till olika former av miljöpåverkan. Du kommer att handleda och utföra t.ex. RNA-seq, Tn-seq, avancerad mikroskopi, analytisk kemi (HPLC, UPLC) och arbetet innefattar också molekylärbiologiska tekniker, genetik och bioinformatik.

Vidare kommer följande forskningsfrågeställningar och metodik att vara aktuella. Identifieringen av transkriptions förändringar genom mRNAseq och sRNAseq kommer att kompletteras med: i) kvantitativ analys av uttrycket av strukturella och regulatoriska komponenter under biofilmsbildningsprocess (vidhäftning, mikrokolonier, produktionsmatris och spridning); ii) fenotypisk analys av Tn-mutant bibliotek för regulatoriska element; iii) konfokalmikroskopi för analys av förändringar av delpopulationer; iv) HPLC-baserade analys av D-aminosyror och fenaziner av olika bakterier och v) co-kultur experiment för reglering av fysiologiska koncentrationer på biofilm utveckling.

Behörighet
Sökande måste ha en doktorsexamen inom ett område relevant för projektet, med en kombination av biokemi och molekylärbiologi, eller en utländsk examen som bedöms likvärdig. Inriktning på examen bör vara mot mikrobiologi, molekylärgenetik och/eller basala regleringsmekanismer.

Kvalifikationer
Du måste ha stor erfarenhet av molekylära mikrobiologiska metoder, i synnerhet undersökning av bakteriella genetiska förändringar i anpassningen till miljöpåverkan. Du måste kunna leda, genomföra och föreslå implikationer av följande metodik: genetisk analys, enzymatiska aktivitetsmätningar, generering av knock-out stammar i olika organismer och reporterstammar för genuttrycksanalys. Erfarenheter som är extra kvalificerande för positionen är goda kunskaper i följande specifika tekniker och dess tillämpningar: i) RNA-seq och Tn-seq teknik från planering av bibliotek till slutbioinformatikanalys (Bowtie, Samtools, DESeq, etc); ii) EMSA, DNas I och KMnO4 ”footprint” analys och in vitro transkription; och iii) HPLC och UPLC analys.

Bedömningsgrunder
Som bedömningsgrund för anställning skall gälla graden av sådan skicklighet som är ett krav för behörighet för anställning. Graden av vetenskaplig och pedagogisk skicklighet är ytterligare kriterier för bedömning. Bedömningskriterierna kommer i första hand att ta hänsyn till den vetenskapliga kompetensen och i andra hand den pedagogiska skickligheten. Internationell erfarenhet och mångårig erfarenhet av postdoktorala studier är starkt meriterande. Den sökandes förmåga att bidra till den framtida utvecklingen av forskning, samarbete och utbildning i experimentell forskningsverksamhet i laboratoriet, kommer också att vara en grund för bedömning. De pedagogiska färdigheterna avser främst erfarenhet och förmåga att handleda forskarstuderande i forskargruppen.

Anställningsvillkor
Anställningen är på heltid och finansieringen av anställningen som forskare garanteras för fyra år inom det VR finansierade projektet ”Peptidoglykanmångfald och plasticitet hos bakterier”. Anställningen gäller från 2015-06-01, eller enligt överenskommelse.

Hur man ansöker
Du ansöker via vårt rekryteringssystem. Logga in och ansöka via knappen längst ner på sidan. Vi ser gärna att du skriver på engelska Din ansökan ska bestå av följande handlingar:

- Personligt brev
- Meritförteckning
- Fullständig publikationslista
- Redogörelse för vetenskaplig verksamhet
- Avsikts-/programförklaring avseende vetenskaplig verksamhet
- Redogörelse för pedagogisk verksamhet med fokus på experimentell handledning
- Kopior av relevanta examensbevis
- Kontaktuppgifter till två personliga referenser 

Mer institution och projekt
http://www.molbiol.umu.se/english/?languageId=1
http://www.mims.umu.se/groups/felipe-cava.html
http://vrproj.vr.se/detail.asp?arendeid=98849
http://www.wallenbergacademyfellows.se/en/List-of-scientists/CavaFelipe/http://www.umu.se/sok/english/staff-directory/view-person?uid=feca0003&guise=employee212077

När ansökan är mottagen kommer du att få ett bekräftelsemeddelande.

Välkommen med din ansökan!

Umeå universitet vill erbjuda en miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vid varje rekrytering strävar vi efter ökad mångfald och använder möjligheten till positiv särbehandling.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.

Kontaktpersoner på detta företaget

Gruppledare Felipe Cava
090- 785 67 55
Prefekt Anna Berghard
090-785 67 01

Sammanfattning

Besöksadress

Umeå universitet
None

Postadress

Umeå universitet
Umeå, 90187

Liknande jobb


Forskare

Forskare

20 december 2024

Forskningsassistent inom granulombiologi

Forskningsassistent inom granulombiologi

20 december 2024

19 december 2024

17 december 2024