Forskare inom strukturbiologi (Kryo-EM)

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra långsiktig skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har drygt 45 000 studenter, mer än 7 000 anställda och en omsättning på cirka 7 miljarder kronor.




Institutionen för Cell och Molekylärbiologi vid Uppsala universitet är en tvärvetenskaplig och framgångsrik forskningsinstitution som bedriver forskning inom Strukturbiologi, Molekylärbiologi, Mikrobiologi, Beräkningsbiologi, Molekylär systembiologi, Biofysik och molekylär evolution.

Läs mer på http://www.icm.uu.se. Den utlysta forskarpositionen är placerad i programmet för Molekylär systembiologi, i professor Sebastian Deindls forskningsgrupp (se http://deindl-lab.com).

https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/

Arbetsuppgifter
Kandidaten ska tillämpa kryo-EM karakteriseringsexperiment och analysera nukleosombundna remodellerande. Syftet med detta arbete är att utveckla och optimera kryo-EM bildbehandlingsmetoder för att bestämma och tolka 3D-strukturer av kromatinremodeller/nukleosomkomplex. Dessutom kommer kandidaten att utföra kompletterande biokemiska experiment för att komplettera och stärka de strukturella kryo-EM resultaten och publicera dessa resultat i vetenskapliga tidskrifter.

Kandidaten kommer också att ansvara för att inrätta, hantera och ge användarsupport för medlemmar i Deindl-labbet för prov screeningsprocessen vid ICM:s nya kryo-EM-facilitet. Du kommer även att arbeta med SciLifeLabs kryo-EM-facilitet (Titan Krios och Talos Arctica) och ha tillgång till en modern beräkningsinfrastruktur.

Kvalifikationskrav
Vi söker en motiverad kandidat med en doktorsexamen i biokemi eller annat ämne som arbetsgivaren bedömer som likvärdigt. Den sökande ska ha en akademisk bakgrund i strukturbiologi eller biofysik. Du ska ha expertis, det vill säga flerårig erfarenhet av att arbeta med provberedning för kryo-EM nukleosomer och nukleosomassocierade proteinkomplex, kryo-EM datasamling, dataanalys och bildbehandling samt 3D-rekonstruktions- och modelleringsmetoder för nukleosomkomplex.

Praktisk erfarenhet av användning av elektronmikroskop (Glacios, Arctica eller Krios). Erfarenhet i administration av Linux operativsystem krävs vilken inkluderar installation, konfiguration och hantering av forskningsprogramvara såsom RELION, cryoSPARC och andra program som är relevanta för kryo-EM och strukturell biologi i allmänhet.

Utmärkta kunskaper i skriven och talad engelska är en förutsättning. Stor vikt kommer även att läggas vid personliga färdigheter såsom kommunikations- och samarbetsfärdigheter, förmåga att arbeta självständigt såväl som i grupp, samt vetenskaplig mognad och kreativitet.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Ytterligare önskade kvalifikationer innefattar färdigheter i montering och rening av nukleosomer-proteiner, samt biokemisk karaktärisering av nukleosom-proteinkomplex. Grundläggande kunskaper i datorhårdvara, för underhåll och uppgradering av arbetsstationer, samt kunskaper i hantering av stora kryo-EM-datamängder (snabb hämtning från anläggningar, bearbetning, tolkning, arkivering och deposition i offentliga databaser). Vidare är det meriterande med kännedom om depositionsprocessen i de offentliga databaserna PDB, EMDB och EMPIAR, samt erfarenhet i hantering av flera användarkonton och konfiguration av jobbkösystem för kryo-EM analyser.

Ansökan
Din ansökan ska innehålla personligt brev med beskrivning av dig själv, ditt forskningsintresse, erfarenheter samt varför du är intresserad av och passar för tjänsten (max 2 sidor). CV innehållandes utbildning, övriga meriter och publikationslista. Kopia av doktorandexamen och din avhandling. Kontaktuppgifter (mailadress och telefonnummer) till två referenser.

Om anställningen 
Anställningen är tillsvidare. Omfattningen är 100%. Tillträde så snart som möjligt eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Martha Schattenhofer, mailto:martha.schattenhofer@icm.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 30:e November 2021, UFV-PA 2021/4359.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.


Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.