Forskare till programmet för fysiologi och miljötoxikologi

Institutionen för organismbiologi utlyser en forskartjänst i epigenetik till programmet för fysiologi och miljötoxikologi.

Forskaren kommer att vara en del av ’Environmental Epigenetics’ gruppen leds av Dr. Carlos Guerrero-Bosagna inom miljötoxikologiprogrammet.

Vid institutionen för organismbiologi bedriver vi undervisning och forskning  om evolution, utveckling och funktion på organismnivå. Vi studerar också de djupaste förgreningarna i livets träd  med hjälp av bioinformatik och experimentella molekylära tekniker. Forskning om hur kemikalier av antropogent ursprung interagerar  med cellfunktioner och ger upphov till långvariga hälsoeffekter på människor och djur utförs också. För mer information se http://www.iob.uu.se/.

Arbetsuppgifter
Vi söker en Forskare till programmet för fysiologi och miljötoxikologi i ett projekt som finansieras av en H2020 Research Innovation Action. Projektet undersöker epigenetiska och transkriptomiska förändringar som förekommer i flera regioner i kycklinghjärnan (och andra organ relaterade till stressrespons) under utvecklingen, liksom i grisvävnader, särskilt spermier. Arbetet kommer att omfatta molekylära (epigenetiska och genuttryck) och bioinformatikanalyser av DNA / RNA-prover som kommer från dessa vävnader. Dina uppgifter kommer att bestå av att arbeta med molekylära genetiska och epigenetiska analyser, främst för att utvärdera och integrera genetiska, transkriptomiskt och metylomiska förändringar, och med bioinformatiska verktyg för att analysera genererade data. De genomiska / epigenomiska metoderna som vi använder är ’Genotype-by-sequencing’ (GBS) och ’Methylated DNA immunoprecipitation’ (MeDIP). De bioinformatiska ’pipelines’ som används inkluderar demultiplexering av sekvenseringsdata, mappning av ’reads’ till deras respektive genom, utförande av statistiska test och generering av diagram för att visualisera data.

Du kommer övervaka doktoranders arbete både i molekylära och bioinformatiska aspekter. Dessutom bör kandidaten vara villig och flexibel att resa utomlands för samordningsmöten med våra samarbetare och för presentation i vetenskapliga möten. Du kommer att hålla reda på och organisera data och biologiskt material, och koordinera och utföra mätningar på laboratorier utomlands. Andra arbetsuppgifter som ingår är att organisera och samordna möten och workshops med våra partners, där både våra bioinformatiska och molekylära metoder (GBS och GBS-MeDIP) lärs ut. Du kommer att skriva vetenskapliga artiklar på engelska och leda hela publiceringsprocessen samt presentera resultaten på engelska vid vetenskapliga konferenser.

Kvalifikationskrav
Vi söker någon med djupgående kunskap och erfarenhet om de bioinformatiskt och molekylära verktygen som behövs i projektet (t.ex. GBS och MeDIP), såväl som förmågan (dokumenterad av vetenskapliga publikationer) att bearbeta data som kommer från dessa molekylära analyser. PhD i biologiska vetenskaper eller annat relevant område är ett krav. Kandidaten måste ha erfarenhet av att skriva vetenskapliga artiklar samt erfarenhet av att handleda studenter både i molekylära och bioinformatiska aspekterna. Du måste ha erfarenhet av gris och kycklingforskning. Detta bör bevisas som författare i ’peer-reviewed’ vetenskapliga publikationer.

Mycket god kommunikationsförmåga på engelska, både muntligt och skriftligt, är ett krav. Vi lägger särskilt stor vikt vid personliga egenskaper såsom god problemlösning och samarbetsförmåga. Med tanke på mängden data som förväntas genereras behöver vi en person med god kunskap och erfarenhet av bioinformatiskt och molekylärt bech arbete, och organisations- och planeringsförmåga.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Undervisningserfarenhet inom genetik eller bioinformatik kommer att betraktas som meritande. Kunskap om andra epigenetiska tekniker är meriterande, liksom förmågan att självständigt skapa alternativa sätt att analysera eller visualisera genomiska data.

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad, 2 år. Omfattningen är heltid, 100%. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Dr. Carlos Guerrero-Bosagna, Universitetslektor, 0700895837, carlos.guerrero.bosagna@ebc.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 12 februari 2024, UFV-PA 2024/425. 

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 500 anställda och 54 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.


Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet
https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/


Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.


Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.